31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfla_1146 on replicon NC_007947
Organism: Methylobacillus flagellatus KT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007947  Mfla_1146  hemerythrin HHE cation binding region  100 
 
 
146 aa  293  8e-79  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.184168  normal  0.471523 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3570  hemerythrin HHE cation binding region  61.81 
 
 
145 aa  184  5e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.499938 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2501  hemerythrin  58.9 
 
 
160 aa  183  7e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2773  hypothetical protein  58.9 
 
 
147 aa  182  9e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0249473  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0691  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  59.15 
 
 
147 aa  171  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001938  hypothetical protein  55.15 
 
 
143 aa  163  5.9999999999999996e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4086  hemerythrin HHE cation binding region  52.94 
 
 
146 aa  155  1e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01683  hypothetical protein  53.68 
 
 
151 aa  150  4e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0790342  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3465  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  58.82 
 
 
147 aa  145  1.0000000000000001e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.15554  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3909  hemerythrin HHE cation binding region  55.15 
 
 
147 aa  140  5e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.288591  normal  0.315835 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2777  hemerythrin HHE cation binding protein  47.79 
 
 
145 aa  138  3e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0340  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  46.81 
 
 
159 aa  121  3e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000991487  hitchhiker  0.00000000430115 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0362  hypothetical protein  44.68 
 
 
162 aa  119  9.999999999999999e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2004  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  43.88 
 
 
151 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4394  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  40.74 
 
 
147 aa  108  3e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.001025  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0996  hypothetical protein  44.2 
 
 
169 aa  105  2e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.457689  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2188  hemerythrin HHE cation binding region  36.92 
 
 
162 aa  94  7e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1182  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  32.85 
 
 
148 aa  72.8  0.000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.900555  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0129  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  26.21 
 
 
171 aa  60.1  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0146  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  25.52 
 
 
171 aa  57.4  0.00000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.613584  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5558  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  35.19 
 
 
188 aa  54.3  0.0000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.418641 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4534  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  27.21 
 
 
345 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2793  Hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  25.34 
 
 
185 aa  49.3  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0769418  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1791  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  28.06 
 
 
346 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.482606  normal  0.753058 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2831  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  28.99 
 
 
184 aa  44.3  0.0006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3897  hemerythrin HHE cation binding region  25.74 
 
 
351 aa  43.5  0.0009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.65028  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2304  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  34.78 
 
 
155 aa  43.5  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.49085  hitchhiker  0.00000533583 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3800  Hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  27.03 
 
 
187 aa  43.1  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000606803 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00300  hemerythrin HHE cation binding protein  35.66 
 
 
157 aa  42.7  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2678  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  29.17 
 
 
187 aa  42  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.027018 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3837  hypothetical protein  26.09 
 
 
445 aa  41.6  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0111576  normal  0.104463 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>