60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4535 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_4535  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  100 
 
 
179 aa  363  1e-100  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.739296  normal  0.620598 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2678  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  33.89 
 
 
187 aa  102  3e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.027018 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2776  Hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  32.39 
 
 
184 aa  95.1  5e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.1725  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7183  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  32.6 
 
 
190 aa  90.5  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3504  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  33.33 
 
 
271 aa  85.5  4e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.033907  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3800  Hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  30.86 
 
 
187 aa  82.4  0.000000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000606803 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3999  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  30.64 
 
 
202 aa  72.8  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4228  hemerythrin HHE cation binding region  30.23 
 
 
196 aa  72  0.000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2793  Hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  32.04 
 
 
185 aa  68.9  0.00000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0769418  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1807  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  29.03 
 
 
194 aa  68.9  0.00000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0985875  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4867  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  29.87 
 
 
158 aa  64.7  0.0000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00231267  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08638  HHE domain protein (AFU_orthologue; AFUA_4G00730)  25 
 
 
228 aa  63.9  0.000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.000349477  normal  0.759451 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5414  hypothetical protein  32.24 
 
 
157 aa  63.9  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2142  hemerythrin HHE cation binding region  32.16 
 
 
197 aa  63.5  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2453  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  31.18 
 
 
165 aa  62.8  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.217194  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2548  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  29.73 
 
 
190 aa  62.8  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1946  hemerythrin HHE cation binding region  27.01 
 
 
188 aa  62  0.000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1992  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  27.01 
 
 
188 aa  62  0.000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.709277 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2549  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  30.99 
 
 
165 aa  62  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1926  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  27.01 
 
 
188 aa  61.2  0.000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.669043  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4679  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  29.75 
 
 
235 aa  58.5  0.00000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4302  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  42.59 
 
 
171 aa  56.6  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1498  hypothetical protein  31.21 
 
 
231 aa  55.1  0.0000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0829172  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1314  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  28.28 
 
 
190 aa  53.5  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1404  hemerythrin HHE cation binding protein  30.81 
 
 
165 aa  52.8  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2168  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  26.44 
 
 
188 aa  52  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA02980  conserved hypothetical protein  23.95 
 
 
220 aa  50.4  0.00001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.959027  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4614  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  31.47 
 
 
185 aa  49.3  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.178279  normal  0.138326 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4750  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  26.74 
 
 
190 aa  49.3  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.777475  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1675  hemerythrin hhE cation binding domain-containing protein  29.71 
 
 
193 aa  48.9  0.00004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.974431  normal  0.386222 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1868  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  20.41 
 
 
144 aa  48.5  0.00005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00300  hemerythrin HHE cation binding protein  33.07 
 
 
157 aa  48.5  0.00005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2248  hypothetical protein  39.66 
 
 
161 aa  48.1  0.00006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2008  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  26.43 
 
 
202 aa  48.1  0.00007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0077  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  27.73 
 
 
158 aa  47  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.556159 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05325  conserved hypothetical protein  21.99 
 
 
206 aa  47  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0069  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  27.73 
 
 
158 aa  47.4  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0180  hemerythrin HHE cation binding region protein  43.4 
 
 
166 aa  46.6  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4228  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  25.44 
 
 
233 aa  46.2  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4394  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  26.67 
 
 
147 aa  46.2  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.001025  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5496  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  31.3 
 
 
184 aa  45.8  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4195  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  25.86 
 
 
188 aa  45.8  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0603  hemerythrin HHE cation binding region  38.46 
 
 
154 aa  45.4  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.499729  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4773  hypothetical protein  28.15 
 
 
190 aa  45.1  0.0006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2480  hypothetical protein  31.25 
 
 
177 aa  45.1  0.0006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0435976  normal  0.540036 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1933  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  25.91 
 
 
193 aa  44.7  0.0007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1887  hemerythrin HHE cation binding region  25.91 
 
 
193 aa  44.7  0.0007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.182349  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2860  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  42.42 
 
 
154 aa  44.7  0.0008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.184327  normal  0.243367 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1486  hemerythrin HHE cation binding region  24.65 
 
 
168 aa  44.7  0.0008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1867  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  25.91 
 
 
193 aa  44.7  0.0008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0876152 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4534  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  20.86 
 
 
345 aa  43.9  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2722  hemerythrin HHE cation binding domain protein  42.42 
 
 
154 aa  43.9  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0324  hypothetical cytosolic protein  19.05 
 
 
144 aa  43.1  0.002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3032  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  42.42 
 
 
154 aa  43.5  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4232  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  29.86 
 
 
178 aa  43.1  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5558  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  27.61 
 
 
188 aa  42  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.418641 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6524  hypothetical protein  31.78 
 
 
258 aa  42.4  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0561637 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3007  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  39.39 
 
 
154 aa  41.6  0.006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.442011  normal  0.933539 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3822  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  40.74 
 
 
482 aa  41.6  0.006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.690759  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2304  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  39.39 
 
 
155 aa  41.6  0.007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.49085  hitchhiker  0.00000533583 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>