85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_2404 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_2404  hemerythrin HHE cation binding region  100 
 
 		 158 aa  313  6e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00792518 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2304  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  64 
 
 		 155 aa  170  6.999999999999999e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.49085  hitchhiker  0.00000533583 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3007  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  69.59 
 
 		 154 aa  168  3e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.442011  normal  0.933539 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2722  hemerythrin HHE cation binding domain protein  67.57 
 
 		 154 aa  166  9e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2860  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  67.57 
 
 		 154 aa  164  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.184327  normal  0.243367 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3032  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  65.54 
 
 		 154 aa  161  3e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00300  hemerythrin HHE cation binding protein  54.14 
 
 		 157 aa  156  1e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3133  hypothetical protein  66.89 
 
 		 156 aa  154  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.682098  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36520  hypothetical protein  66.89 
 
 		 156 aa  154  6e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00150219  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4867  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  39.73 
 
 		 158 aa  98.6  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00231267  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5414  hypothetical protein  38.62 
 
 		 157 aa  94.7  4e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1182  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  38.51 
 
 		 148 aa  83.2  0.000000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.900555  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1486  hemerythrin HHE cation binding region  38.36 
 
 		 168 aa  80.1  0.00000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3897  hemerythrin HHE cation binding region  28.93 
 
 		 351 aa  79.7  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.65028  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2248  hypothetical protein  35.94 
 
 		 161 aa  80.1  0.00000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4614  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  35.71 
 
 		 185 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.178279  normal  0.138326 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4302  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  36 
 
 		 171 aa  77.8  0.00000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0733  hypothetical protein  34.75 
 
 		 195 aa  73.9  0.0000000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.21283  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3879  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  34.38 
 
 		 165 aa  73.2  0.000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0180  hemerythrin HHE cation binding region protein  37.8 
 
 		 166 aa  71.2  0.000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1490  hemerythrin hhE cation-binding domain-containing protein  27.04 
 
 		 351 aa  70.5  0.000000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2007  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  34.09 
 
 		 164 aa  69.7  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0603  hemerythrin HHE cation binding region  35.37 
 
 		 154 aa  69.7  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.499729  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0129  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  28.57 
 
 		 171 aa  68.9  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0146  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  27.92 
 
 		 171 aa  67.8  0.00000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.613584  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0077  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  33.33 
 
 		 158 aa  67.4  0.00000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.556159 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1421  hemerythrin HHE cation binding region protein  32.68 
 
 		 178 aa  67  0.00000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5558  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  32.12 
 
 		 188 aa  67  0.00000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.418641 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0069  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  32.5 
 
 		 158 aa  67  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2480  hypothetical protein  37.42 
 
 		 177 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0435976  normal  0.540036 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1807  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  27.7 
 
 		 194 aa  63.9  0.0000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0985875  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4534  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  25.66 
 
 		 345 aa  63.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4232  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  33.33 
 
 		 178 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5496  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  28.57 
 
 		 184 aa  62.4  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2776  Hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  30.28 
 
 		 184 aa  61.6  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.1725  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7183  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  31.88 
 
 		 190 aa  61.2  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5327  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  26.28 
 
 		 347 aa  60.8  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1791  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  25.64 
 
 		 346 aa  60.5  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.482606  normal  0.753058 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2549  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  34.04 
 
 		 165 aa  59.7  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12652  hypothetical protein  31.58 
 
 		 161 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  4.33287e-35  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1314  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  30.71 
 
 		 190 aa  60.1  0.00000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2453  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  34.04 
 
 		 165 aa  59.7  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.217194  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2426  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  34.97 
 
 		 163 aa  59.3  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.13977  normal  0.0393648 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2146  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  27.27 
 
 		 350 aa  59.7  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.460261 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2008  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  30.22 
 
 		 202 aa  57.8  0.00000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2534  hypothetical protein  28.28 
 
 		 495 aa  57.8  0.00000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.715554  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1827  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  36.3 
 
 		 149 aa  58.2  0.00000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1404  hemerythrin HHE cation binding protein  33.33 
 
 		 165 aa  56.6  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2719  hypothetical protein  26.9 
 
 		 407 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3504  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  25.17 
 
 		 271 aa  55.5  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.033907  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2188  hemerythrin HHE cation binding region  31.06 
 
 		 162 aa  53.9  0.0000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3822  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  32.21 
 
 		 482 aa  53.5  0.000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.690759  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2678  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  28.29 
 
 		 187 aa  53.5  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.027018 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4394  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  28.99 
 
 		 147 aa  52.8  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.001025  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001938  hypothetical protein  32.28 
 
 		 143 aa  52.8  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0691  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  29.23 
 
 		 147 aa  51.2  0.000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4773  hypothetical protein  30 
 
 		 190 aa  50.8  0.000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1868  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  26.53 
 
 		 144 aa  50.8  0.000007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1146  hemerythrin HHE cation binding region  29.2 
 
 		 146 aa  49.3  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.184168  normal  0.471523 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2777  hemerythrin HHE cation binding protein  28.26 
 
 		 145 aa  49.3  0.00002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1891  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  27.67 
 
 		 152 aa  49.7  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01683  hypothetical protein  31.54 
 
 		 151 aa  48.5  0.00003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0790342  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08638  HHE domain protein (AFU_orthologue; AFUA_4G00730)  27.01 
 
 		 228 aa  48.5  0.00004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.000349477  normal  0.759451 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2543  hypothetical protein  27.97 
 
 		 216 aa  48.1  0.00005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.771916  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4679  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  25.55 
 
 		 235 aa  48.1  0.00005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2548  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  24.46 
 
 		 190 aa  48.1  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2793  Hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  26.76 
 
 		 185 aa  47.8  0.00007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0769418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4228  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  25.25 
 
 		 233 aa  46.6  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0858  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  30.07 
 
 		 186 aa  45.8  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0324  hypothetical cytosolic protein  25.85 
 
 		 144 aa  46.2  0.0002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4535  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  27.59 
 
 		 179 aa  44.7  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.739296  normal  0.620598 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3999  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  27.34 
 
 		 202 aa  43.5  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0307  hypothetical protein  32.41 
 
 		 184 aa  43.5  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000126228  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4086  hemerythrin HHE cation binding region  23.91 
 
 		 146 aa  43.5  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1764  hypothetical protein  26.49 
 
 		 150 aa  43.1  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA02980  conserved hypothetical protein  30.43 
 
 		 220 aa  42.7  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.959027  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05325  conserved hypothetical protein  27.04 
 
 		 206 aa  42.7  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4844  cyclase/dehydrase  24.83 
 
 		 328 aa  42  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.327815  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3326  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  27.5 
 
 		 207 aa  42.4  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2501  hemerythrin  27.86 
 
 		 160 aa  41.2  0.005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1017  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  26.28 
 
 		 167 aa  40.8  0.007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2831  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  30.22 
 
 		 184 aa  40.8  0.007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3570  hemerythrin HHE cation binding region  26.35 
 
 		 145 aa  40.8  0.007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.499938 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2773  hypothetical protein  29.29 
 
 		 147 aa  40.8  0.008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0249473  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3837  hypothetical protein  23.78 
 
 		 445 aa  40.4  0.009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0111576  normal  0.104463 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>