63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_0307 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_0307  hypothetical protein  100 
 
 		 184 aa  366  1e-101  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000126228  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1164  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  48.37 
 
 		 184 aa  189  2e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2937  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  52.72 
 
 		 184 aa  189  2e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0260  hemerythrin HHE cation binding protein  40.22 
 
 		 183 aa  144  7.0000000000000006e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1196  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  41.49 
 
 		 182 aa  131  5e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.406056  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1402  hemerythrin HHE cation binding protein  39.01 
 
 		 201 aa  115  3.9999999999999997e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2551  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  37.91 
 
 		 202 aa  114  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2428  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  37.08 
 
 		 202 aa  112  3e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0824334 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2455  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  37.91 
 
 		 202 aa  112  3e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.704463  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3669  hypothetical protein  32.43 
 
 		 185 aa  95.5  4e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0292536 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1917  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  30.68 
 
 		 179 aa  90.9  9e-18  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1012  hemerythrin HHE cation binding region  31.25 
 
 		 180 aa  90.5  1e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3018  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  36.69 
 
 		 183 aa  90.5  1e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.850698  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0221  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  30.68 
 
 		 182 aa  89  4e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000313734  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1232  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  35.97 
 
 		 187 aa  87.8  8e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000355045 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0760  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  29.61 
 
 		 177 aa  86.3  2e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000791976  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2516  hemerythrin HHE cation binding region  36.5 
 
 		 188 aa  85.1  5e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.74757  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0505  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  28.41 
 
 		 180 aa  84.7  7e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.581987  normal  0.213341 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1597  hemerythrin HHE cation binding region  29.89 
 
 		 177 aa  82.8  0.000000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.768096  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2650  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  31.64 
 
 		 182 aa  81.3  0.000000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.567158  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0288  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  29.35 
 
 		 178 aa  80.9  0.000000000000009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00932018 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3145  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  29.45 
 
 		 316 aa  80.9  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0771  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  33.33 
 
 		 185 aa  79.7  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1610  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  34.31 
 
 		 185 aa  79  0.00000000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2661  hypothetical protein  32.1 
 
 		 188 aa  78.2  0.00000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0065  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  34.93 
 
 		 182 aa  69.7  0.00000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.73098  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2614  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  30.69 
 
 		 176 aa  69.3  0.00000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.587772  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2495  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  31.72 
 
 		 184 aa  68.6  0.00000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0364  ABC transporter  25.28 
 
 		 437 aa  66.2  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0199162  unclonable  0.000000063148 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1509  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  26.49 
 
 		 187 aa  64.7  0.0000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0220946  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0685  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  28.12 
 
 		 187 aa  63.5  0.000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.434426  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2455  hemerythrin HHE cation binding region  26.6 
 
 		 196 aa  63.2  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3104  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  28.8 
 
 		 257 aa  62.8  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1323  hypothetical protein  25 
 
 		 235 aa  62  0.000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1353  hypothetical protein  27.61 
 
 		 180 aa  61.2  0.000000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.086878 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12027  hypothetical protein  28.05 
 
 		 255 aa  60.8  0.00000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000558386  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3084  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  29.19 
 
 		 191 aa  60.1  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.664175  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0219  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  30.81 
 
 		 191 aa  60.1  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00618287 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2830  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  32.08 
 
 		 194 aa  55.5  0.0000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.168396  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0395  hypothetical protein  30.56 
 
 		 163 aa  53.9  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1456  hypothetical protein  25 
 
 		 206 aa  52.4  0.000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0103956  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0227  hemerythrin HHE cation binding protein  28.42 
 
 		 193 aa  52.4  0.000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.172932  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1515  hemerythrin HHE cation binding region  35.29 
 
 		 176 aa  49.3  0.00003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0910  hemerythrin HHE cation binding region  27.81 
 
 		 194 aa  48.1  0.00007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.17752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4024  hypothetical protein  26.01 
 
 		 193 aa  47.8  0.00009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.336316 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0120  hypothetical protein  35.03 
 
 		 216 aa  47.4  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1354  rhodopsin-like G-protein  29.3 
 
 		 222 aa  47.4  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2519  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  27.22 
 
 		 232 aa  47.4  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3819  hemerythrin HHE cation binding region  27.94 
 
 		 196 aa  47  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2767  hemerythrin HHE cation binding region  29.75 
 
 		 189 aa  47  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0539302  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0042  hemerythrin HHE cation binding region  28.65 
 
 		 198 aa  46.6  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0022  hypothetical protein  24.03 
 
 		 180 aa  45.8  0.0003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1891  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  30.65 
 
 		 152 aa  45.4  0.0004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1756  hemerythrin HHE cation binding region  26.9 
 
 		 177 aa  45.4  0.0004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1641  hypothetical protein  26.29 
 
 		 268 aa  44.7  0.0008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1521  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  23.65 
 
 		 199 aa  44.7  0.0008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.343981  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0736  hypothetical protein  25.16 
 
 		 213 aa  44.3  0.0009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.388253  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1527  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  27.61 
 
 		 177 aa  44.3  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000541236  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2550  putative hemerythrin  23.57 
 
 		 176 aa  42.4  0.004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1479  hemerythrin HHE cation binding region  25 
 
 		 197 aa  42.4  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.786202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0755  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  29.52 
 
 		 398 aa  42.4  0.004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1855  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  25.74 
 
 		 196 aa  41.6  0.007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.013511  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1518  hypothetical protein  34.44 
 
 		 179 aa  41.2  0.008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.473183  normal  0.32871 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>