39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_3822 on replicon NC_010580
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010580  Bind_3822  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  100 
 
 
482 aa  951    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.690759  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0180  hemerythrin HHE cation binding region protein  48.67 
 
 
166 aa  150  3e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4302  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  44.59 
 
 
171 aa  139  8.999999999999999e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1421  hemerythrin HHE cation binding region protein  46.48 
 
 
178 aa  122  9.999999999999999e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4614  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  40.72 
 
 
185 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.178279  normal  0.138326 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2007  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  45.33 
 
 
164 aa  108  2e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3879  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  42.67 
 
 
165 aa  104  3e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2248  hypothetical protein  39.22 
 
 
161 aa  103  5e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1486  hemerythrin HHE cation binding region  44.22 
 
 
168 aa  103  9e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0603  hemerythrin HHE cation binding region  43.06 
 
 
154 aa  95.1  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.499729  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5496  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  39.6 
 
 
184 aa  94.7  3e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0733  hypothetical protein  40.54 
 
 
195 aa  92.4  2e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.21283  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2480  hypothetical protein  39.47 
 
 
177 aa  89.4  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0435976  normal  0.540036 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0069  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  38.16 
 
 
158 aa  84.7  0.000000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0077  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  37.5 
 
 
158 aa  82.8  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.556159 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4232  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  34.9 
 
 
178 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0858  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  36.88 
 
 
186 aa  79  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1314  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  35.14 
 
 
190 aa  71.2  0.00000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3504  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  36.72 
 
 
271 aa  70.9  0.00000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.033907  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4867  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  37.39 
 
 
158 aa  70.1  0.00000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00231267  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5414  hypothetical protein  39.64 
 
 
157 aa  69.3  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2008  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  33.1 
 
 
202 aa  66.6  0.0000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2453  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  36.89 
 
 
165 aa  66.6  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.217194  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2549  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  36.89 
 
 
165 aa  66.6  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4773  hypothetical protein  33.33 
 
 
190 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1404  hemerythrin HHE cation binding protein  35.92 
 
 
165 aa  61.2  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00300  hemerythrin HHE cation binding protein  35.04 
 
 
157 aa  55.8  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2678  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  28.21 
 
 
187 aa  52  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.027018 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5558  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  30.97 
 
 
188 aa  51.6  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.418641 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2548  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  29.41 
 
 
190 aa  50.8  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7183  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  30.34 
 
 
190 aa  49.3  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1807  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  27.05 
 
 
194 aa  47.8  0.0004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0985875  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3897  hemerythrin HHE cation binding region  29.79 
 
 
351 aa  45.4  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.65028  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2426  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  33.66 
 
 
163 aa  45.1  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.13977  normal  0.0393648 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08638  HHE domain protein (AFU_orthologue; AFUA_4G00730)  26.55 
 
 
228 aa  44.7  0.004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.000349477  normal  0.759451 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2404  hemerythrin HHE cation binding region  32.69 
 
 
158 aa  44.7  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00792518 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2793  Hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  29.71 
 
 
185 aa  44.3  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0769418  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4228  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  30.48 
 
 
233 aa  43.9  0.006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2304  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  38.55 
 
 
155 aa  43.5  0.008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.49085  hitchhiker  0.00000533583 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>