51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_0858 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_0858  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  100 
 
 		 186 aa  374  1e-103  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1421  hemerythrin HHE cation binding region protein  38.69 
 
 		 178 aa  104  8e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0180  hemerythrin HHE cation binding region protein  39.6 
 
 		 166 aa  96.3  3e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4302  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  38.82 
 
 		 171 aa  95.1  5e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2007  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  37.34 
 
 		 164 aa  91.7  5e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3879  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  39.1 
 
 		 165 aa  91.3  6e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4614  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  40.76 
 
 		 185 aa  91.3  7e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.178279  normal  0.138326 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0603  hemerythrin HHE cation binding region  38.56 
 
 		 154 aa  86.3  3e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.499729  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3822  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  37.42 
 
 		 482 aa  84.7  7e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.690759  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0733  hypothetical protein  34.03 
 
 		 195 aa  80.5  0.00000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.21283  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4232  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  35.54 
 
 		 178 aa  79  0.00000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2248  hypothetical protein  35.37 
 
 		 161 aa  78.6  0.00000000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1486  hemerythrin HHE cation binding region  34.03 
 
 		 168 aa  77.8  0.00000000000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5496  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  37.01 
 
 		 184 aa  75.5  0.0000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2480  hypothetical protein  35.29 
 
 		 177 aa  75.1  0.0000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0435976  normal  0.540036 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0069  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  37.93 
 
 		 158 aa  73.6  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0077  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  35.54 
 
 		 158 aa  72  0.000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.556159 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4867  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  34.44 
 
 		 158 aa  69.3  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00231267  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1314  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  31.25 
 
 		 190 aa  65.1  0.0000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5414  hypothetical protein  35.85 
 
 		 157 aa  64.3  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5558  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  28.47 
 
 		 188 aa  58.2  0.00000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.418641 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00300  hemerythrin HHE cation binding protein  33.55 
 
 		 157 aa  54.3  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0129  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  30.58 
 
 		 171 aa  53.5  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4534  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  29.82 
 
 		 345 aa  53.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0146  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  30.58 
 
 		 171 aa  53.5  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.613584  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2008  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  24.67 
 
 		 202 aa  52.4  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7183  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  31.15 
 
 		 190 aa  50.8  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4773  hypothetical protein  30.17 
 
 		 190 aa  49.3  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2453  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  32.14 
 
 		 165 aa  48.9  0.00004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.217194  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2426  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  31.54 
 
 		 163 aa  48.5  0.00006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.13977  normal  0.0393648 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2549  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  32.53 
 
 		 165 aa  47.4  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1017  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  33.61 
 
 		 167 aa  47.4  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2678  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  27.64 
 
 		 187 aa  46.6  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.027018 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3897  hemerythrin HHE cation binding region  23.74 
 
 		 351 aa  46.6  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.65028  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5327  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  26.67 
 
 		 347 aa  46.2  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1404  hemerythrin HHE cation binding protein  32.14 
 
 		 165 aa  45.8  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2146  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  27.73 
 
 		 350 aa  45.8  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.460261 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1828  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  30.37 
 
 		 145 aa  45.1  0.0006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1946  hemerythrin HHE cation binding region  29.29 
 
 		 188 aa  44.7  0.0009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1992  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  29.29 
 
 		 188 aa  44.7  0.0009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.709277 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1675  hemerythrin hhE cation binding domain-containing protein  31.43 
 
 		 193 aa  44.3  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.974431  normal  0.386222 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1182  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  33.33 
 
 		 148 aa  44.3  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.900555  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1807  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  26.4 
 
 		 194 aa  44.3  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0985875  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2548  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  27.74 
 
 		 190 aa  44.3  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1926  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  29.29 
 
 		 188 aa  44.3  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.669043  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3504  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  26.19 
 
 		 271 aa  43.5  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.033907  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2304  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  33.06 
 
 		 155 aa  42.4  0.004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.49085  hitchhiker  0.00000533583 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2776  Hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  28.68 
 
 		 184 aa  41.6  0.007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.1725  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2188  hemerythrin HHE cation binding region  26.09 
 
 		 162 aa  41.6  0.007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1490  hemerythrin hhE cation-binding domain-containing protein  21.93 
 
 		 351 aa  41.6  0.007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1868  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  27.83 
 
 		 144 aa  41.6  0.008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>