50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_1421 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_1421  hemerythrin HHE cation binding region protein  100 
 
 
178 aa  359  1e-98  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4302  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  58.45 
 
 
171 aa  160  9e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0180  hemerythrin HHE cation binding region protein  55.32 
 
 
166 aa  142  2e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2007  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  52.73 
 
 
164 aa  135  4e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2248  hypothetical protein  53.38 
 
 
161 aa  134  9.999999999999999e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3879  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  50.31 
 
 
165 aa  126  2.0000000000000002e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3822  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  46.48 
 
 
482 aa  122  2e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.690759  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0733  hypothetical protein  43.24 
 
 
195 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.21283  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0069  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  39.86 
 
 
158 aa  103  1e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4614  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  41.72 
 
 
185 aa  102  3e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.178279  normal  0.138326 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0077  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  39.86 
 
 
158 aa  102  3e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.556159 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1486  hemerythrin HHE cation binding region  42.68 
 
 
168 aa  101  4e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0603  hemerythrin HHE cation binding region  44.52 
 
 
154 aa  101  5e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.499729  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0858  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  38.55 
 
 
186 aa  100  8e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2480  hypothetical protein  42.04 
 
 
177 aa  94.4  8e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0435976  normal  0.540036 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5496  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  40.67 
 
 
184 aa  91.3  6e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4232  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  40 
 
 
178 aa  91.7  6e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4867  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  37.32 
 
 
158 aa  80.1  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00231267  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1314  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  35.42 
 
 
190 aa  80.5  0.00000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2008  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  34.44 
 
 
202 aa  78.2  0.00000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2453  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  44.14 
 
 
165 aa  72.8  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.217194  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2549  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  44.14 
 
 
165 aa  72.4  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5414  hypothetical protein  39.44 
 
 
157 aa  72  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4773  hypothetical protein  32.41 
 
 
190 aa  71.2  0.000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3504  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  31.71 
 
 
271 aa  68.2  0.00000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.033907  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7183  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  31.47 
 
 
190 aa  67  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1404  hemerythrin HHE cation binding protein  41.38 
 
 
165 aa  62  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2146  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  31.87 
 
 
350 aa  60.8  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.460261 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2548  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  31.29 
 
 
190 aa  59.7  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5327  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  30.63 
 
 
347 aa  59.3  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1807  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  32.17 
 
 
194 aa  58.5  0.00000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0985875  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1182  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  31.21 
 
 
148 aa  57  0.0000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.900555  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00300  hemerythrin HHE cation binding protein  34.48 
 
 
157 aa  56.6  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08638  HHE domain protein (AFU_orthologue; AFUA_4G00730)  26.61 
 
 
228 aa  54.7  0.0000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.000349477  normal  0.759451 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0129  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  30.95 
 
 
171 aa  52.4  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1791  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  26.39 
 
 
346 aa  52.4  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.482606  normal  0.753058 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5558  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  31.78 
 
 
188 aa  51.6  0.000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.418641 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3897  hemerythrin HHE cation binding region  27.4 
 
 
351 aa  51.6  0.000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.65028  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0146  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  29.84 
 
 
171 aa  50.8  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.613584  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2304  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  34.01 
 
 
155 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.49085  hitchhiker  0.00000533583 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2776  Hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  28.99 
 
 
184 aa  50.4  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.1725  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2404  hemerythrin HHE cation binding region  32.68 
 
 
158 aa  49.3  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00792518 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4534  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  24.36 
 
 
345 aa  47.8  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2426  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  36.7 
 
 
163 aa  47  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.13977  normal  0.0393648 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4394  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  33.61 
 
 
147 aa  47.4  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.001025  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2678  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  28.87 
 
 
187 aa  45.4  0.0005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.027018 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0691  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  34.12 
 
 
147 aa  44.3  0.0009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1764  hypothetical protein  33.64 
 
 
150 aa  44.3  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2722  hemerythrin HHE cation binding domain protein  34.62 
 
 
154 aa  42.4  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3326  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  26.45 
 
 
207 aa  41.2  0.009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>