81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4867 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_4867  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  100 
 
 		 158 aa  320  7e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00231267  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5414  hypothetical protein  69.23 
 
 		 157 aa  216  7e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7183  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  37.5 
 
 		 190 aa  99.8  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0733  hypothetical protein  42.98 
 
 		 195 aa  99.4  2e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.21283  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4302  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  42.95 
 
 		 171 aa  93.2  1e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3504  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  33.95 
 
 		 271 aa  93.2  1e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.033907  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5496  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  39.73 
 
 		 184 aa  92.4  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2007  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  38.62 
 
 		 164 aa  92.8  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0603  hemerythrin HHE cation binding region  38.46 
 
 		 154 aa  90.9  6e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.499729  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2248  hypothetical protein  39.2 
 
 		 161 aa  90.9  7e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0069  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  40.14 
 
 		 158 aa  90.9  7e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3879  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  39.06 
 
 		 165 aa  89.7  1e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0077  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  39.44 
 
 		 158 aa  89.4  2e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.556159 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4614  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  39.58 
 
 		 185 aa  88.6  3e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.178279  normal  0.138326 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0180  hemerythrin HHE cation binding region protein  40.13 
 
 		 166 aa  88.2  4e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2678  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  36 
 
 		 187 aa  87.4  6e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.027018 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2480  hypothetical protein  36.77 
 
 		 177 aa  86.7  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0435976  normal  0.540036 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2776  Hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  34.69 
 
 		 184 aa  85.9  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.1725  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2549  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  43.17 
 
 		 165 aa  85.5  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1486  hemerythrin HHE cation binding region  40.85 
 
 		 168 aa  84.7  5e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2453  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  42.45 
 
 		 165 aa  83.2  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.217194  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4232  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  36.71 
 
 		 178 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1807  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  32.69 
 
 		 194 aa  82  0.000000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0985875  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2304  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  41.84 
 
 		 155 aa  81.6  0.000000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.49085  hitchhiker  0.00000533583 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1421  hemerythrin HHE cation binding region protein  37.32 
 
 		 178 aa  80.1  0.00000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2548  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  34.46 
 
 		 190 aa  79.7  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5558  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  31.85 
 
 		 188 aa  78.6  0.00000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.418641 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2008  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  34.33 
 
 		 202 aa  75.9  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2404  hemerythrin HHE cation binding region  39.73 
 
 		 158 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00792518 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1404  hemerythrin HHE cation binding protein  42.66 
 
 		 165 aa  72.4  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1314  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  29.71 
 
 		 190 aa  70.5  0.000000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3822  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  37.39 
 
 		 482 aa  70.1  0.00000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.690759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2426  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  42.14 
 
 		 163 aa  68.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.13977  normal  0.0393648 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00300  hemerythrin HHE cation binding protein  33.87 
 
 		 157 aa  68.2  0.00000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0146  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  34.01 
 
 		 171 aa  67.4  0.00000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.613584  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1182  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  34.43 
 
 		 148 aa  65.9  0.0000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.900555  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2793  Hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  30.28 
 
 		 185 aa  64.7  0.0000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0769418  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0129  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  32.65 
 
 		 171 aa  64.7  0.0000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4535  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  29.87 
 
 		 179 aa  64.7  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.739296  normal  0.620598 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4228  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  25.83 
 
 		 233 aa  63.9  0.0000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2722  hemerythrin HHE cation binding domain protein  36.99 
 
 		 154 aa  62  0.000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4773  hypothetical protein  28.97 
 
 		 190 aa  62  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0858  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  34.44 
 
 		 186 aa  60.1  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3032  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  35.86 
 
 		 154 aa  58.9  0.00000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3326  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  28.15 
 
 		 207 aa  57.8  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1828  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  29.79 
 
 		 145 aa  56.6  0.0000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4679  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  27.33 
 
 		 235 aa  56.2  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2860  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  37.16 
 
 		 154 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.184327  normal  0.243367 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1791  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  26.06 
 
 		 346 aa  54.7  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.482606  normal  0.753058 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4394  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  29.93 
 
 		 147 aa  54.3  0.0000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.001025  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08638  HHE domain protein (AFU_orthologue; AFUA_4G00730)  23.94 
 
 		 228 aa  53.9  0.0000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.000349477  normal  0.759451 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3007  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  35.17 
 
 		 154 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.442011  normal  0.933539 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3800  Hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  26.95 
 
 		 187 aa  53.5  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000606803 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2146  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  31.71 
 
 		 350 aa  52.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.460261 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1868  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  29.08 
 
 		 144 aa  52.8  0.000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1827  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  31.25 
 
 		 149 aa  51.6  0.000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2543  hypothetical protein  28.57 
 
 		 216 aa  52  0.000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.771916  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4534  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  27.41 
 
 		 345 aa  50.8  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3133  hypothetical protein  36.88 
 
 		 156 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.682098  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0362  hypothetical protein  28.91 
 
 		 162 aa  50.1  0.00001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1926  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  25.5 
 
 		 188 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.669043  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3897  hemerythrin HHE cation binding region  26.76 
 
 		 351 aa  50.4  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.65028  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36520  hypothetical protein  36 
 
 		 156 aa  50.4  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00150219  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5327  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  25.35 
 
 		 347 aa  49.7  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1946  hemerythrin HHE cation binding region  25.5 
 
 		 188 aa  49.7  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1992  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  25.5 
 
 		 188 aa  49.7  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.709277 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3999  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  27.89 
 
 		 202 aa  48.9  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0340  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  29.69 
 
 		 159 aa  48.5  0.00003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000991487  hitchhiker  0.00000000430115 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0324  hypothetical cytosolic protein  27.66 
 
 		 144 aa  47.8  0.00007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA02980  conserved hypothetical protein  28.57 
 
 		 220 aa  45.4  0.0003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.959027  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1490  hemerythrin hhE cation-binding domain-containing protein  25.35 
 
 		 351 aa  45.1  0.0004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0691  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  29.25 
 
 		 147 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01683  hypothetical protein  27.35 
 
 		 151 aa  44.3  0.0006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0790342  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4228  hemerythrin HHE cation binding region  27.52 
 
 		 196 aa  44.3  0.0007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4750  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  28.29 
 
 		 190 aa  43.5  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.777475  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2188  hemerythrin HHE cation binding region  30.1 
 
 		 162 aa  43.1  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2501  hemerythrin  29.25 
 
 		 160 aa  43.1  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2773  hypothetical protein  28.3 
 
 		 147 aa  42  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0249473  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2168  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  26.17 
 
 		 188 aa  41.6  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2304  putative regulator of cell morphogenesis and NO signaling  27.41 
 
 		 162 aa  41.2  0.005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.904148  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4844  cyclase/dehydrase  28.67 
 
 		 328 aa  41.2  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.327815  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>