56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_4232 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010676  Bphyt_4232  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  100 
 
 
178 aa  351  2.9999999999999997e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2480  hypothetical protein  81.71 
 
 
177 aa  280  7.000000000000001e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0435976  normal  0.540036 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4614  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  69.57 
 
 
185 aa  223  1e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.178279  normal  0.138326 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5496  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  60.62 
 
 
184 aa  193  1e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2007  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  41.36 
 
 
164 aa  113  2.0000000000000002e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4302  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  47.26 
 
 
171 aa  111  5e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2248  hypothetical protein  40.79 
 
 
161 aa  111  7.000000000000001e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0603  hemerythrin HHE cation binding region  43.04 
 
 
154 aa  110  9e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.499729  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0077  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  41.83 
 
 
158 aa  108  3e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.556159 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0069  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  41.18 
 
 
158 aa  107  6e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0180  hemerythrin HHE cation binding region protein  44.3 
 
 
166 aa  102  4e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1486  hemerythrin HHE cation binding region  40.94 
 
 
168 aa  101  5e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3879  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  38.65 
 
 
165 aa  100  9e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1421  hemerythrin HHE cation binding region protein  40 
 
 
178 aa  97.4  1e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0733  hypothetical protein  36.36 
 
 
195 aa  93.2  2e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.21283  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5414  hypothetical protein  42.76 
 
 
157 aa  93.6  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4867  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  36.71 
 
 
158 aa  92  4e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00231267  normal 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3822  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  34.9 
 
 
482 aa  85.5  4e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.690759  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2678  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  35.66 
 
 
187 aa  79.7  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.027018 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3504  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  37.24 
 
 
271 aa  77  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.033907  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1314  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  35.33 
 
 
190 aa  75.9  0.0000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0858  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  35.54 
 
 
186 aa  73.6  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7183  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  34.03 
 
 
190 aa  72  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00300  hemerythrin HHE cation binding protein  35.54 
 
 
157 aa  71.2  0.000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2548  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  34 
 
 
190 aa  70.1  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2008  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  31.29 
 
 
202 aa  64.3  0.0000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4773  hypothetical protein  27.49 
 
 
190 aa  64.3  0.0000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2453  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  34.78 
 
 
165 aa  59.7  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.217194  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2549  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  34.78 
 
 
165 aa  60.1  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2793  Hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  32.17 
 
 
185 aa  58.5  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0769418  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08638  HHE domain protein (AFU_orthologue; AFUA_4G00730)  28.21 
 
 
228 aa  57.4  0.0000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.000349477  normal  0.759451 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3326  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  29.69 
 
 
207 aa  56.2  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5558  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  31.45 
 
 
188 aa  56.6  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.418641 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0129  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  30.83 
 
 
171 aa  55.8  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2304  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  33.12 
 
 
155 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.49085  hitchhiker  0.00000533583 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1807  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  29.46 
 
 
194 aa  53.9  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0985875  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1404  hemerythrin HHE cation binding protein  36.13 
 
 
165 aa  54.3  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0146  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  29.41 
 
 
171 aa  53.5  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.613584  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2776  Hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  29.41 
 
 
184 aa  53.1  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.1725  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4535  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  29.86 
 
 
179 aa  52.4  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.739296  normal  0.620598 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3007  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  36.6 
 
 
154 aa  52  0.000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.442011  normal  0.933539 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2404  hemerythrin HHE cation binding region  33.33 
 
 
158 aa  50.4  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00792518 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2860  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  35.29 
 
 
154 aa  49.3  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.184327  normal  0.243367 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3032  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  35.95 
 
 
154 aa  49.3  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2426  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  34.16 
 
 
163 aa  48.5  0.00006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.13977  normal  0.0393648 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4679  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  32.29 
 
 
235 aa  47.8  0.00008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2722  hemerythrin HHE cation binding domain protein  36.6 
 
 
154 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1791  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  23.29 
 
 
346 aa  46.2  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.482606  normal  0.753058 
 
 
-
 
NC_006670  CNA02980  conserved hypothetical protein  29.36 
 
 
220 aa  44.7  0.0008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.959027  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4228  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  24.32 
 
 
233 aa  43.1  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0340  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  30.95 
 
 
159 aa  42.7  0.003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000991487  hitchhiker  0.00000000430115 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1182  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  29.91 
 
 
148 aa  42  0.004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.900555  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4534  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  23.81 
 
 
345 aa  42.4  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36520  hypothetical protein  32.45 
 
 
156 aa  41.6  0.005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00150219  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4844  cyclase/dehydrase  28.87 
 
 
328 aa  42  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.327815  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3800  Hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  25.55 
 
 
187 aa  40.8  0.01  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000606803 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>