121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4844 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_4844  cyclase/dehydrase  100 
 
 		 328 aa  660    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.327815  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6540  cyclase/dehydrase  47.55 
 
 		 287 aa  291  1e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.472702  normal  0.0557794 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3665  cyclase/dehydrase  66.22 
 
 		 158 aa  213  3.9999999999999995e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.961718 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0825  cyclase/dehydrase  65.77 
 
 		 152 aa  207  3e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.987427  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0103  cyclase/dehydrase  63.51 
 
 		 203 aa  201  9.999999999999999e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4854  cyclase/dehydrase  60 
 
 		 155 aa  200  3e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.199897  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7248  integral membrane protein-like protein  59.48 
 
 		 232 aa  189  7e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0202449  normal  0.282365 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1801  cyclase/dehydrase  51.05 
 
 		 205 aa  187  2e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1740  cyclase/dehydrase  58.82 
 
 		 153 aa  186  5e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.294422  decreased coverage  0.000862073 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0297  cyclase/dehydrase  50.98 
 
 		 210 aa  185  8e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1754  cyclase/dehydrase  58.82 
 
 		 153 aa  185  1.0000000000000001e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.33796 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2639  cyclase/dehydrase  57.72 
 
 		 162 aa  183  3e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.697167  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15860  polyketide cyclase / dehydrase family protein  59.06 
 
 		 156 aa  182  5.0000000000000004e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00215892  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0007  cyclase/dehydrase  55.03 
 
 		 160 aa  178  1e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1093  cyclase/dehydrase  50.56 
 
 		 212 aa  175  9.999999999999999e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3433  cyclase/dehydrase  57.72 
 
 		 155 aa  175  9.999999999999999e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.151513  hitchhiker  0.00285229 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0957  cyclase/dehydrase  53.69 
 
 		 170 aa  173  2.9999999999999996e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1015  cyclase/dehydrase  53.69 
 
 		 159 aa  173  3.9999999999999995e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0343567  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1018  cyclase/dehydrase  53.02 
 
 		 159 aa  172  9e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.665706  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1003  cyclase/dehydrase  53.69 
 
 		 156 aa  169  4e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.109283  decreased coverage  0.00240737 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1044  cyclase/dehydrase  50.97 
 
 		 272 aa  166  6.9999999999999995e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.214991  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1527  cyclase/dehydrase  49.32 
 
 		 181 aa  160  4e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.626943  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3967  cyclase/dehydrase  47.74 
 
 		 300 aa  155  1e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.139128  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0245  cyclase/dehydrase  46.31 
 
 		 217 aa  146  4.0000000000000006e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0659  cyclase/dehydrase  42.59 
 
 		 158 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.913891  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3412  cyclase/dehydrase  44.52 
 
 		 337 aa  139  7e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2865  cyclase/dehydrase  44.44 
 
 		 143 aa  138  1e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3678  cyclase/dehydrase  43.4 
 
 		 216 aa  134  1.9999999999999998e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0898363  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2801  cyclase/dehydrase  42.36 
 
 		 145 aa  130  3e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0725635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4005  cyclase/dehydrase  37.82 
 
 		 330 aa  124  2e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.290687  normal  0.973287 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2352  cyclase/dehydrase  36.71 
 
 		 418 aa  113  4.0000000000000004e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.196534 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14140  polyketide cyclase / dehydrase family protein  40.13 
 
 		 164 aa  109  7.000000000000001e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.850996 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3381  cyclase/dehydrase  34.62 
 
 		 416 aa  108  2e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.155742  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6854  integral membrane protein-like protein  33.97 
 
 		 394 aa  105  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2333  cyclase/dehydrase  31.72 
 
 		 335 aa  103  3e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.234929  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2380  cyclase/dehydrase  31.72 
 
 		 335 aa  103  3e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.336605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2374  cyclase/dehydrase  31.72 
 
 		 336 aa  103  3e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.361241  normal  0.880819 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1675  hemerythrin hhE cation binding domain-containing protein  37.76 
 
 		 193 aa  98.2  2e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.974431  normal  0.386222 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3999  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  39.1 
 
 		 202 aa  91.7  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1946  hemerythrin HHE cation binding region  42.22 
 
 		 188 aa  89.7  5e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1992  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  42.22 
 
 		 188 aa  89.7  5e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.709277 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4228  hemerythrin HHE cation binding region  39.42 
 
 		 196 aa  89.7  6e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1926  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  42.22 
 
 		 188 aa  89.4  8e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.669043  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2070  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  41.41 
 
 		 185 aa  88.2  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000612385  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0577  cyclase/dehydrase  38.13 
 
 		 241 aa  84.7  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3684  cyclase/dehydrase  35.86 
 
 		 219 aa  83.2  0.000000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4750  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  40.98 
 
 		 190 aa  83.2  0.000000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.777475  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0831  hypothetical protein  34.59 
 
 		 194 aa  82.8  0.000000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.763872 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0834  cyclase/dehydrase  34.46 
 
 		 269 aa  81.3  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.179759 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1350  cyclase/dehydrase  33.79 
 
 		 238 aa  79.7  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0114  cyclase/dehydrase  35.42 
 
 		 225 aa  79.3  0.00000000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4497  cyclase/dehydrase  33.79 
 
 		 232 aa  76.6  0.0000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1887  hemerythrin HHE cation binding region  38.67 
 
 		 193 aa  74.3  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.182349  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1933  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  38.67 
 
 		 193 aa  74.3  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1867  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  38.67 
 
 		 193 aa  74.7  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0876152 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3666  cyclase/dehydrase  30.11 
 
 		 284 aa  74.3  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.470859  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0042  cyclase/dehydrase  30.6 
 
 		 244 aa  73.6  0.000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.64456 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1407  cyclase/dehydrase  33.81 
 
 		 197 aa  72  0.00000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2168  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  40.74 
 
 		 188 aa  71.2  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0307  cyclase/dehydrase  31.65 
 
 		 303 aa  71.2  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0066  cyclase/dehydrase  34.27 
 
 		 198 aa  70.9  0.00000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.364974  normal  0.163087 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0123  cyclase/dehydrase  30.22 
 
 		 243 aa  70.1  0.00000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.764786 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5444  cyclase/dehydrase  32.41 
 
 		 164 aa  68.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.252579  normal  0.482853 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0140  cyclase/dehydrase  28.78 
 
 		 242 aa  67.8  0.0000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3009  cyclase/dehydrase  30.22 
 
 		 256 aa  64.7  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000149284 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2142  hemerythrin HHE cation binding region  36.19 
 
 		 197 aa  63.9  0.000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0413  hypothetical protein  27.86 
 
 		 231 aa  63.2  0.000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.239427  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4195  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  39.26 
 
 		 188 aa  62.4  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5344  cyclase/dehydrase  27.78 
 
 		 187 aa  62  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6283  cyclase/dehydrase  29.29 
 
 		 240 aa  62.4  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000939789  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0167  cyclase/dehydrase  30.82 
 
 		 169 aa  61.2  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.22431  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01281  putative integral membrane protein  27.14 
 
 		 156 aa  61.2  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.49008  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01301  putative integral membrane protein  28.37 
 
 		 157 aa  61.6  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.561031 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0812  cyclase/dehydrase  33.33 
 
 		 217 aa  60.1  0.00000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.714265  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26201  putative integral membrane protein  26.47 
 
 		 149 aa  58.5  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.52339 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0117  putative integral membrane protein  24.29 
 
 		 156 aa  57.8  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2678  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  26.06 
 
 		 187 aa  57  0.0000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.027018 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3430  cyclase/dehydrase  26.75 
 
 		 239 aa  56.6  0.0000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1111  cyclase/dehydrase  27.66 
 
 		 162 aa  56.2  0.0000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3216  cyclase/dehydrase  27.46 
 
 		 162 aa  56.2  0.0000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3103  hypothetical protein  32.17 
 
 		 212 aa  55.5  0.000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.602873  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3832  cyclase/dehydrase  31.47 
 
 		 212 aa  55.5  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.341531 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2623  cyclase/dehydrase  21.71 
 
 		 244 aa  55.5  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.502552 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01321  putative integral membrane protein  24.29 
 
 		 156 aa  54.3  0.000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01311  putative integral membrane protein  24.29 
 
 		 156 aa  54.7  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3177  cyclase/dehydrase  27.27 
 
 		 151 aa  55.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3897  hemerythrin HHE cation binding region  25.85 
 
 		 351 aa  52  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.65028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3664  hypothetical protein  29.37 
 
 		 214 aa  52.4  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.321126 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3785  cyclase/dehydrase  21.13 
 
 		 223 aa  51.6  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.720369  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7183  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  28.67 
 
 		 190 aa  50.8  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01881  putative integral membrane protein  24.29 
 
 		 150 aa  50.1  0.00005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.560201  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1511  hypothetical protein  26.87 
 
 		 145 aa  49.7  0.00007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.399595  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4789  cyclase/dehydrase  23.48 
 
 		 147 aa  49.7  0.00007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.799233  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1483  putative integral membrane protein  24.31 
 
 		 150 aa  49.3  0.00008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.77346  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0994  cyclase/dehydrase  25.53 
 
 		 164 aa  49.3  0.00009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.864114  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3326  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  27.78 
 
 		 207 aa  49.3  0.00009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4394  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  28.8 
 
 		 147 aa  48.9  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.001025  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1322  cyclase/dehydrase  27.34 
 
 		 237 aa  48.5  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2776  Hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  23.4 
 
 		 184 aa  47.8  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.1725  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1409  cyclase/dehydrase  33.33 
 
 		 153 aa  47.4  0.0003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>