19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_4096 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_4096  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  100 
 
 		 183 aa  372  1e-102  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.100934  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08638  HHE domain protein (AFU_orthologue; AFUA_4G00730)  29.19 
 
 		 228 aa  61.6  0.000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.000349477  normal  0.759451 
 
 
-
 
NC_006670  CNA02980  conserved hypothetical protein  35.71 
 
 		 220 aa  61.6  0.000000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.959027  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7183  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  31.37 
 
 		 190 aa  57.4  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3897  hemerythrin HHE cation binding region  25.98 
 
 		 351 aa  52  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.65028  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4534  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  25 
 
 		 345 aa  52  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4394  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  28.79 
 
 		 147 aa  49.7  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.001025  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2548  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  27.27 
 
 		 190 aa  48.9  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5558  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  27.12 
 
 		 188 aa  46.6  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.418641 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5162  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  32.97 
 
 		 147 aa  45.1  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.145779 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1490  hemerythrin hhE cation-binding domain-containing protein  26.56 
 
 		 351 aa  44.3  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3837  hypothetical protein  29.06 
 
 		 445 aa  43.5  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0111576  normal  0.104463 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5327  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  24.8 
 
 		 347 aa  42.7  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1675  hemerythrin hhE cation binding domain-containing protein  28.68 
 
 		 193 aa  42.7  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.974431  normal  0.386222 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6540  cyclase/dehydrase  29.03 
 
 		 287 aa  42.7  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.472702  normal  0.0557794 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4844  cyclase/dehydrase  27.89 
 
 		 328 aa  42.4  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.327815  normal  1 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3822  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  28.81 
 
 		 482 aa  42  0.005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.690759  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2188  hemerythrin HHE cation binding region  26.87 
 
 		 162 aa  41.6  0.006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05325  conserved hypothetical protein  25.49 
 
 		 206 aa  41.6  0.007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>