23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_4302 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_4302  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  100 
 
 
168 aa  330  7.000000000000001e-90  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31370  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  48.75 
 
 
164 aa  135  2e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0494  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  45.03 
 
 
168 aa  116  9.999999999999999e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.235058  normal  0.242573 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0996  hemerythrin HHE cation binding region  32.59 
 
 
148 aa  54.3  0.0000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1891  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  36.43 
 
 
152 aa  53.9  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2172  hypothetical protein  34.02 
 
 
146 aa  52.8  0.000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0485385  hitchhiker  0.00000439184 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1436  hypothetical protein  30.67 
 
 
154 aa  50.8  0.000009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0699  hypothetical protein  30.08 
 
 
146 aa  48.1  0.00006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2577  hemerythrin HHE cation binding domain protein  35.8 
 
 
84 aa  47.8  0.00007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0415221  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1749  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  31.65 
 
 
238 aa  46.6  0.0001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.280527 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1365  Domain of unknown function DUF1858  28.83 
 
 
295 aa  45.4  0.0004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7183  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  32.98 
 
 
190 aa  45.1  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5327  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  26.97 
 
 
347 aa  44.7  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3600  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  31.88 
 
 
240 aa  42.7  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3669  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  31.88 
 
 
240 aa  43.1  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1580  putative PAS/PAC sensor protein  27.96 
 
 
406 aa  42.4  0.003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2937  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  33.96 
 
 
184 aa  42  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0493  hemerythrin HHE cation binding region  27.55 
 
 
146 aa  41.2  0.006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5064  hemerythrin HHE cation binding region  31.93 
 
 
141 aa  41.6  0.006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.650384  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3632  iron-sulfur cluster repair di-iron protein  31.87 
 
 
221 aa  41.2  0.007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3777  iron-sulfur cluster repair di-iron protein  31.87 
 
 
221 aa  41.2  0.007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3955  iron-sulfur cluster repair di-iron protein  31.87 
 
 
221 aa  41.2  0.008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2085  hemerythrin HHE cation binding region  29.46 
 
 
148 aa  41.2  0.008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.297499 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>