81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_2937 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_2937  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  100 
 
 		 184 aa  365  1e-100  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1164  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  59.78 
 
 		 184 aa  228  5e-59  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0307  hypothetical protein  52.72 
 
 		 184 aa  189  2e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000126228  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1196  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  51.09 
 
 		 182 aa  174  6e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.406056  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0260  hemerythrin HHE cation binding protein  45.11 
 
 		 183 aa  155  2e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2428  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  39.89 
 
 		 202 aa  123  1e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0824334 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2551  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  38.76 
 
 		 202 aa  119  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1402  hemerythrin HHE cation binding protein  39.33 
 
 		 201 aa  118  4.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2455  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  38.2 
 
 		 202 aa  115  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.704463  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1012  hemerythrin HHE cation binding region  36.36 
 
 		 180 aa  100  9e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1610  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  34.75 
 
 		 185 aa  100  1e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3669  hypothetical protein  32.8 
 
 		 185 aa  92.8  2e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0292536 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1597  hemerythrin HHE cation binding region  32.95 
 
 		 177 aa  93.6  2e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.768096  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1917  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  37.16 
 
 		 179 aa  92.4  3e-18  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3145  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  34.75 
 
 		 316 aa  88.6  5e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0505  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  33.73 
 
 		 180 aa  85.5  4e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.581987  normal  0.213341 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0288  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  30.41 
 
 		 178 aa  83.6  0.000000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00932018 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2516  hemerythrin HHE cation binding region  35.77 
 
 		 188 aa  82.4  0.000000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.74757  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2661  hypothetical protein  36.23 
 
 		 188 aa  81.6  0.000000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3018  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  35.77 
 
 		 183 aa  80.5  0.00000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.850698  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2614  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  35.29 
 
 		 176 aa  80.5  0.00000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.587772  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0221  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  32.4 
 
 		 182 aa  79.7  0.00000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000313734  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0771  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  36.94 
 
 		 185 aa  79.7  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1232  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  35.04 
 
 		 187 aa  78.6  0.00000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000355045 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2650  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  32.2 
 
 		 182 aa  75.9  0.0000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.567158  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0685  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  28.02 
 
 		 187 aa  73.2  0.000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.434426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0760  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  29.28 
 
 		 177 aa  72  0.000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000791976  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2495  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  30.16 
 
 		 184 aa  71.2  0.000000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1353  hypothetical protein  27.67 
 
 		 180 aa  68.2  0.00000000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.086878 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0065  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  32.57 
 
 		 182 aa  65.5  0.0000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.73098  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1509  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  27.51 
 
 		 187 aa  62  0.000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0220946  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1323  hypothetical protein  25 
 
 		 235 aa  59.7  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0776  hypothetical protein  31.61 
 
 		 270 aa  58.2  0.00000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000379179  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0364  ABC transporter  25.27 
 
 		 437 aa  57.8  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0199162  unclonable  0.000000063148 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0752  hypothetical protein  31.61 
 
 		 270 aa  57  0.0000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00690211  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3104  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  27.57 
 
 		 257 aa  57.4  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3819  hemerythrin HHE cation binding region  29.56 
 
 		 196 aa  56.2  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0395  hypothetical protein  24.55 
 
 		 163 aa  53.1  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2830  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  26.59 
 
 		 194 aa  51.6  0.000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.168396  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3872  hemerythrin HHE cation binding region  30.82 
 
 		 197 aa  50.1  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1479  hemerythrin HHE cation binding region  30.63 
 
 		 197 aa  49.7  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.786202  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1641  hypothetical protein  29.61 
 
 		 268 aa  49.7  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12027  hypothetical protein  23.03 
 
 		 255 aa  48.9  0.00004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000558386  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1891  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  34.38 
 
 		 152 aa  48.5  0.00005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0120  hypothetical protein  30.52 
 
 		 216 aa  48.5  0.00005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3084  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  26.67 
 
 		 191 aa  48.5  0.00005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.664175  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4688  iron-sulfur cluster repair di-iron protein  28.93 
 
 		 220 aa  47.8  0.00008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.041656  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1855  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  29.94 
 
 		 196 aa  47  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.013511  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3784  protein of unknown function DUF542 ScdA domain protein  28.93 
 
 		 220 aa  47  0.0001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0015085  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04044  hypothetical protein  28.93 
 
 		 220 aa  47  0.0001  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00616403  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4750  iron-sulfur cluster repair di-iron protein  28.93 
 
 		 220 aa  47  0.0001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.020864  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0379  iron-sulfur cluster repair di-iron protein  33.65 
 
 		 220 aa  47.4  0.0001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000130602  normal  0.725738 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3797  iron-sulfur cluster repair di-iron protein  28.93 
 
 		 220 aa  47  0.0001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000715657  normal  0.850161 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4024  hypothetical protein  28.49 
 
 		 193 aa  47.4  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.336316 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4463  iron-sulfur cluster repair di-iron protein  28.93 
 
 		 220 aa  47  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00510158  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4777  iron-sulfur cluster repair di-iron protein  28.93 
 
 		 220 aa  47  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00129664  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04081  predicted regulator of cell morphogenesis and cell wall metabolism  28.93 
 
 		 220 aa  47  0.0001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00617951  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1648  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  34.02 
 
 		 224 aa  47  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.371191  normal  0.835393 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0022  hypothetical protein  23.23 
 
 		 180 aa  47  0.0002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5726  iron-sulfur cluster repair di-iron protein  28.93 
 
 		 220 aa  46.6  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0664368  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1838  hemerythrin HHE cation binding region  32.43 
 
 		 145 aa  46.6  0.0002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.49812  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2085  hemerythrin HHE cation binding region  36.67 
 
 		 148 aa  46.2  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.297499 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4677  iron-sulfur cluster repair di-iron protein  28.93 
 
 		 220 aa  45.4  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0601381  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4797  iron-sulfur cluster repair di-iron protein  28.93 
 
 		 220 aa  45.4  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4817  iron-sulfur cluster repair di-iron protein  28.93 
 
 		 220 aa  45.4  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.452254  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4762  iron-sulfur cluster repair di-iron protein  28.93 
 
 		 220 aa  45.4  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0815  iron-sulfur cluster repair di-iron protein  33.61 
 
 		 222 aa  45.4  0.0005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0339092  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1354  rhodopsin-like G-protein  24.52 
 
 		 222 aa  45.1  0.0006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2172  hypothetical protein  36.73 
 
 		 146 aa  45.1  0.0006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0485385  hitchhiker  0.00000439184 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1527  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  29.25 
 
 		 177 aa  43.9  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000541236  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0494  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  34.38 
 
 		 168 aa  43.9  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.235058  normal  0.242573 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0782  iron-sulfur cluster repair di-iron protein  29.17 
 
 		 221 aa  42.4  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0196066  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0328  hypothetical protein  32.63 
 
 		 238 aa  42.7  0.003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0203423  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4667  iron-sulfur cluster repair di-iron protein  28.1 
 
 		 220 aa  42.7  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.651941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3632  iron-sulfur cluster repair di-iron protein  36.45 
 
 		 221 aa  42.4  0.004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3955  iron-sulfur cluster repair di-iron protein  36.45 
 
 		 221 aa  42.4  0.004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3777  iron-sulfur cluster repair di-iron protein  36.45 
 
 		 221 aa  42.4  0.004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0492  hypothetical protein  32.29 
 
 		 238 aa  42.4  0.004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4302  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  33.96 
 
 		 168 aa  42  0.004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0996  hemerythrin HHE cation binding region  33.33 
 
 		 148 aa  41.2  0.008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2382  hypothetical protein  31.19 
 
 		 767 aa  41.2  0.01  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.507042  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>