54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_2172 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_2172  hypothetical protein  100 
 
 		 146 aa  303  5.0000000000000004e-82  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0485385  hitchhiker  0.00000439184 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0996  hemerythrin HHE cation binding region  50.7 
 
 		 148 aa  149  1e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0699  hypothetical protein  53.44 
 
 		 146 aa  145  1.0000000000000001e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0493  hemerythrin HHE cation binding region  47.22 
 
 		 146 aa  139  9.999999999999999e-33  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1838  hemerythrin HHE cation binding region  48.23 
 
 		 145 aa  137  3.9999999999999997e-32  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.49812  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1648  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  49.28 
 
 		 224 aa  131  3.9999999999999996e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.371191  normal  0.835393 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1891  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  43.85 
 
 		 152 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2085  hemerythrin HHE cation binding region  41.27 
 
 		 148 aa  105  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.297499 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5064  hemerythrin HHE cation binding region  40.48 
 
 		 141 aa  103  9e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.650384  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3669  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  40.46 
 
 		 240 aa  100  6e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3600  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  40.46 
 
 		 240 aa  100  6e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3512  hemerythrin HHE cation binding protein  38.93 
 
 		 240 aa  97.1  8e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0549925  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2489  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  30.95 
 
 		 153 aa  65.9  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2868  hypothetical protein  30.95 
 
 		 153 aa  65.9  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03879  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  34.78 
 
 		 146 aa  64.3  0.0000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31370  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  33.66 
 
 		 164 aa  55.1  0.0000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1199  hypothetical protein  25.74 
 
 		 226 aa  53.9  0.0000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0494  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  29.25 
 
 		 168 aa  52.4  0.000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.235058  normal  0.242573 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4302  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  34.02 
 
 		 168 aa  52.4  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0776  hypothetical protein  25.68 
 
 		 270 aa  50.8  0.000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000379179  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0752  hypothetical protein  31.25 
 
 		 270 aa  49.7  0.00001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00690211  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1942  hypothetical protein  28.79 
 
 		 254 aa  48.1  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1614  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  28.79 
 
 		 254 aa  48.1  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00121654 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4394  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  28.36 
 
 		 147 aa  47.4  0.00007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.001025  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1527  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  29.67 
 
 		 177 aa  46.2  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000541236  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2614  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  34.74 
 
 		 176 aa  46.2  0.0002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.587772  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4762  iron-sulfur cluster repair di-iron protein  30.93 
 
 		 220 aa  45.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4817  iron-sulfur cluster repair di-iron protein  30.93 
 
 		 220 aa  45.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.452254  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4677  iron-sulfur cluster repair di-iron protein  30.93 
 
 		 220 aa  45.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0601381  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4797  iron-sulfur cluster repair di-iron protein  30.93 
 
 		 220 aa  45.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2937  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  36.73 
 
 		 184 aa  44.7  0.0004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1436  hypothetical protein  26.15 
 
 		 154 aa  43.9  0.0007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4614  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  28.23 
 
 		 185 aa  43.5  0.0009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.178279  normal  0.138326 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3145  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  26.92 
 
 		 316 aa  43.5  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4688  iron-sulfur cluster repair di-iron protein  29.9 
 
 		 220 aa  43.1  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.041656  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1597  hemerythrin HHE cation binding region  31.07 
 
 		 177 aa  43.1  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.768096  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4667  iron-sulfur cluster repair di-iron protein  29.9 
 
 		 220 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.651941  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1580  putative PAS/PAC sensor protein  25.18 
 
 		 406 aa  42  0.003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04044  hypothetical protein  29.9 
 
 		 220 aa  42  0.003  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00616403  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3784  protein of unknown function DUF542 ScdA domain protein  29.9 
 
 		 220 aa  42  0.003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0015085  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4750  iron-sulfur cluster repair di-iron protein  29.9 
 
 		 220 aa  42  0.003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.020864  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3797  iron-sulfur cluster repair di-iron protein  29.9 
 
 		 220 aa  42  0.003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000715657  normal  0.850161 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4777  iron-sulfur cluster repair di-iron protein  29.9 
 
 		 220 aa  42  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00129664  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4463  iron-sulfur cluster repair di-iron protein  29.9 
 
 		 220 aa  42  0.003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00510158  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04081  predicted regulator of cell morphogenesis and cell wall metabolism  29.9 
 
 		 220 aa  42  0.003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00617951  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0379  iron-sulfur cluster repair di-iron protein  29.9 
 
 		 220 aa  41.6  0.004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000130602  normal  0.725738 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1509  hypothetical protein  28.95 
 
 		 411 aa  41.2  0.004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02289  iron-sulfur cluster repair di-iron protein  37.08 
 
 		 223 aa  41.2  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.104095 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5726  iron-sulfur cluster repair di-iron protein  29.9 
 
 		 220 aa  41.2  0.005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0664368  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3137  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  26.62 
 
 		 239 aa  41.2  0.005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2034  hemerythrin hhE cation binding domain-containing protein  30.33 
 
 		 216 aa  40.8  0.006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.568645 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0221  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  35.34 
 
 		 182 aa  40.4  0.007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000313734  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3352  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  26.92 
 
 		 342 aa  40.8  0.007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0815  iron-sulfur cluster repair di-iron protein  33.33 
 
 		 222 aa  40.4  0.008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0339092  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>