38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_3352 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_3352  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  100 
 
 		 342 aa  702    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1509  hypothetical protein  66.67 
 
 		 411 aa  468  1.0000000000000001e-131  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2669  protein of unknown function DUF438  58.7 
 
 		 410 aa  406  1.0000000000000001e-112  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000266849  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1931  hypothetical protein  50.44 
 
 		 407 aa  359  4e-98  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000706509  hitchhiker  0.00330228 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1718  hypothetical protein  43.54 
 
 		 485 aa  285  1.0000000000000001e-75  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2660  putative PAS/PAC sensor protein  41.47 
 
 		 395 aa  273  5.000000000000001e-72  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00460  hypothetical protein  41.59 
 
 		 517 aa  264  2e-69  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0658  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  36.92 
 
 		 521 aa  261  1e-68  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3191  hypothetical protein  38.69 
 
 		 421 aa  255  7e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3310  protein of unknown function DUF438  37.97 
 
 		 415 aa  254  1.0000000000000001e-66  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0755  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  43.3 
 
 		 398 aa  253  3e-66  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1059  putative PAS/PAC sensor protein  37.14 
 
 		 536 aa  250  2e-65  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1580  putative PAS/PAC sensor protein  40.75 
 
 		 406 aa  243  3e-63  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0510  putative PAS/PAC sensor protein  36.26 
 
 		 532 aa  234  1.0000000000000001e-60  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.0555672 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1669  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  35.45 
 
 		 540 aa  233  4.0000000000000004e-60  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.80491  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1165  protein of unknown function DUF438  35.45 
 
 		 491 aa  228  1e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.310279  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0141  hypothetical protein  39.17 
 
 		 398 aa  219  5e-56  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.546361 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0661  putative PAS/PAC sensor protein  38.46 
 
 		 322 aa  216  4e-55  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2103  sensory box protein  35.98 
 
 		 321 aa  208  1e-52  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1777  putative PAS/PAC sensor protein  35.77 
 
 		 432 aa  202  6e-51  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00046622  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1545  putative PAS/PAC sensor protein  37.22 
 
 		 391 aa  201  9.999999999999999e-51  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1746  putative PAS/PAC sensor protein  36.86 
 
 		 433 aa  199  7e-50  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000524256  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1800  putative PAS/PAC sensor protein  36.81 
 
 		 433 aa  198  1.0000000000000001e-49  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000159886  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0115  protein of unknown function DUF438  34.38 
 
 		 438 aa  192  9e-48  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0686  hypothetical protein  30.34 
 
 		 517 aa  173  2.9999999999999996e-42  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00119299 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3145  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  28.52 
 
 		 316 aa  126  4.0000000000000003e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0010  hypothetical protein  28.47 
 
 		 434 aa  117  3e-25  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000457156  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0401  hypothetical protein  30.58 
 
 		 140 aa  83.6  0.000000000000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000776425  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0091  NADPH-dependent FMN reductase  27.66 
 
 		 416 aa  83.6  0.000000000000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000139902  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0166  hypothetical protein  30.37 
 
 		 148 aa  75.1  0.000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000989028  hitchhiker  8.66499e-20 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0752  hypothetical protein  28.31 
 
 		 270 aa  67  0.0000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00690211  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1365  Domain of unknown function DUF1858  34.03 
 
 		 295 aa  65.9  0.000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0776  hypothetical protein  26.51 
 
 		 270 aa  65.5  0.000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000379179  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0966  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.56 
 
 		 615 aa  47.8  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.595194  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1083  hypothetical protein  24.18 
 
 		 411 aa  47.8  0.0003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0200825  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1659  flavoprotein  25.52 
 
 		 227 aa  45.4  0.001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000241633  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1806  oxidoreductase, putative, truncated  27.62 
 
 		 241 aa  44.3  0.003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1054  PAS modulated sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  22.94 
 
 		 463 aa  43.1  0.006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.91979  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>