26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_1648 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_1648  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  100 
 
 
224 aa  467  1.0000000000000001e-131  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.371191  normal  0.835393 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1838  hemerythrin HHE cation binding region  46.27 
 
 
145 aa  134  9.999999999999999e-31  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.49812  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0493  hemerythrin HHE cation binding region  49.25 
 
 
146 aa  129  4.0000000000000003e-29  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0996  hemerythrin HHE cation binding region  47.06 
 
 
148 aa  128  9.000000000000001e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2172  hypothetical protein  49.28 
 
 
146 aa  122  5e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0485385  hitchhiker  0.00000439184 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0699  hypothetical protein  44.53 
 
 
146 aa  118  7e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1891  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  47.41 
 
 
152 aa  118  9e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3512  hemerythrin HHE cation binding protein  35.45 
 
 
240 aa  108  8.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0549925  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3600  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  35.75 
 
 
240 aa  102  6e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3669  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  35.23 
 
 
240 aa  100  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2085  hemerythrin HHE cation binding region  37.8 
 
 
148 aa  93.2  3e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.297499 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5064  hemerythrin HHE cation binding region  36.09 
 
 
141 aa  89.4  4e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.650384  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03879  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  39.08 
 
 
146 aa  67.8  0.0000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0752  hypothetical protein  31.15 
 
 
270 aa  52  0.000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00690211  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1614  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  22.22 
 
 
254 aa  51.2  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00121654 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1942  hypothetical protein  22.22 
 
 
254 aa  51.2  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0776  hypothetical protein  27.97 
 
 
270 aa  51.2  0.00001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000379179  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0494  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  32.95 
 
 
168 aa  49.7  0.00004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.235058  normal  0.242573 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31370  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  30.6 
 
 
164 aa  47.8  0.0001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1648  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  28.17 
 
 
171 aa  46.6  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2937  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  34.02 
 
 
184 aa  47  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2489  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  29.84 
 
 
153 aa  45.4  0.0006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2868  hypothetical protein  29.84 
 
 
153 aa  45.4  0.0006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1527  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  29.35 
 
 
177 aa  43.5  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000541236  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0473  hypothetical protein  25.55 
 
 
174 aa  41.6  0.009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.499498  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1791  hypothetical protein  34.38 
 
 
126 aa  41.6  0.009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.146981  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>