40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_0996 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007298  Daro_0996  hemerythrin HHE cation binding region  100 
 
 
148 aa  305  2.0000000000000002e-82  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0699  hypothetical protein  57.25 
 
 
146 aa  153  8e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2172  hypothetical protein  50.7 
 
 
146 aa  140  5e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0485385  hitchhiker  0.00000439184 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1838  hemerythrin HHE cation binding region  45.89 
 
 
145 aa  138  1.9999999999999998e-32  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.49812  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0493  hemerythrin HHE cation binding region  44.76 
 
 
146 aa  131  3e-30  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1891  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  49.62 
 
 
152 aa  129  1.0000000000000001e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1648  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  47.06 
 
 
224 aa  128  3e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.371191  normal  0.835393 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2085  hemerythrin HHE cation binding region  38.89 
 
 
148 aa  104  5e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.297499 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3600  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  41.98 
 
 
240 aa  101  3e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3669  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  41.98 
 
 
240 aa  101  3e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3512  hemerythrin HHE cation binding protein  41.98 
 
 
240 aa  101  3e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0549925  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5064  hemerythrin HHE cation binding region  36.15 
 
 
141 aa  101  4e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.650384  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2489  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  31.39 
 
 
153 aa  63.9  0.0000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2868  hypothetical protein  31.39 
 
 
153 aa  63.9  0.0000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4302  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  32.59 
 
 
168 aa  54.3  0.0000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03879  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  35.16 
 
 
146 aa  53.5  0.000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1527  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  33.33 
 
 
177 aa  49.3  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000541236  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1917  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  41.38 
 
 
179 aa  49.3  0.00002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0478  hypothetical protein  27.66 
 
 
174 aa  49.3  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0473  hypothetical protein  28.37 
 
 
174 aa  48.1  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.499498  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1648  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  28.77 
 
 
171 aa  47.8  0.00005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31370  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  35.87 
 
 
164 aa  47.4  0.00007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1402  hemerythrin HHE cation binding protein  33.56 
 
 
201 aa  45.8  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2661  hypothetical protein  37.37 
 
 
188 aa  45.1  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3145  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  28.37 
 
 
316 aa  45.1  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0752  hypothetical protein  30.95 
 
 
270 aa  45.4  0.0003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00690211  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0776  hypothetical protein  30.95 
 
 
270 aa  45.4  0.0003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000379179  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2455  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  34.25 
 
 
202 aa  44.7  0.0004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.704463  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0494  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  36.9 
 
 
168 aa  44.7  0.0004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.235058  normal  0.242573 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0445  hypothetical protein  27.59 
 
 
179 aa  43.5  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.981965  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2614  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  29.25 
 
 
176 aa  43.1  0.001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.587772  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0221  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  32.97 
 
 
182 aa  42.4  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000313734  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2428  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  34.06 
 
 
202 aa  42  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0824334 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1580  putative PAS/PAC sensor protein  30.11 
 
 
406 aa  41.6  0.004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2551  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  32.88 
 
 
202 aa  41.6  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2937  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  33.33 
 
 
184 aa  41.2  0.005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1749  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  27.13 
 
 
238 aa  41.2  0.005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.280527 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2669  protein of unknown function DUF438  30.39 
 
 
410 aa  40.8  0.006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000266849  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2650  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  33.33 
 
 
182 aa  40.8  0.007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.567158  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1931  hypothetical protein  28.23 
 
 
407 aa  40  0.01  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000706509  hitchhiker  0.00330228 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>