48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_03879 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_03879  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  100 
 
 		 146 aa  296  8e-80  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3512  hemerythrin HHE cation binding protein  40 
 
 		 240 aa  82.4  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0549925  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3669  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  40.46 
 
 		 240 aa  82.4  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3600  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  40.46 
 
 		 240 aa  82  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1648  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  36.92 
 
 		 224 aa  80.1  0.00000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.371191  normal  0.835393 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2172  hypothetical protein  35.07 
 
 		 146 aa  79.3  0.00000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0485385  hitchhiker  0.00000439184 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0996  hemerythrin HHE cation binding region  35.11 
 
 		 148 aa  71.6  0.000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0493  hemerythrin HHE cation binding region  32.81 
 
 		 146 aa  71.2  0.000000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1838  hemerythrin HHE cation binding region  33.59 
 
 		 145 aa  68.9  0.00000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.49812  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1891  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  32.84 
 
 		 152 aa  67  0.00000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0699  hypothetical protein  31.88 
 
 		 146 aa  66.6  0.00000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5064  hemerythrin HHE cation binding region  41.49 
 
 		 141 aa  62.4  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.650384  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0494  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  39.18 
 
 		 168 aa  58.5  0.00000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.235058  normal  0.242573 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2085  hemerythrin HHE cation binding region  40.43 
 
 		 148 aa  56.6  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.297499 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31370  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  32.84 
 
 		 164 aa  55.5  0.0000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4302  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  38.14 
 
 		 168 aa  53.1  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4655  iron-sulfur cluster repair di-iron protein  31.11 
 
 		 223 aa  52  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.84876  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3578  iron-sulfur cluster repair di-iron protein  31.11 
 
 		 223 aa  52  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.670531 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1749  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  32.82 
 
 		 238 aa  51.6  0.000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.280527 
 
 
-
 
NC_003296  RS02289  iron-sulfur cluster repair di-iron protein  32.22 
 
 		 223 aa  50.4  0.000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.104095 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0473  hypothetical protein  31.78 
 
 		 174 aa  49.7  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.499498  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2489  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  29.51 
 
 		 153 aa  49.3  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2868  hypothetical protein  29.51 
 
 		 153 aa  49.3  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1648  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  27.34 
 
 		 171 aa  48.9  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0478  hypothetical protein  31.01 
 
 		 174 aa  45.8  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3137  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  29.77 
 
 		 239 aa  44.7  0.0004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0445  hypothetical protein  30.4 
 
 		 179 aa  44.3  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.981965  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3777  iron-sulfur cluster repair di-iron protein  32.88 
 
 		 221 aa  42.7  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3955  iron-sulfur cluster repair di-iron protein  32.88 
 
 		 221 aa  42.7  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3632  iron-sulfur cluster repair di-iron protein  32.88 
 
 		 221 aa  42.7  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4688  iron-sulfur cluster repair di-iron protein  34 
 
 		 220 aa  41.6  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.041656  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0782  iron-sulfur cluster repair di-iron protein  29 
 
 		 221 aa  41.6  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0196066  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1199  hypothetical protein  28.36 
 
 		 226 aa  42  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5726  iron-sulfur cluster repair di-iron protein  34 
 
 		 220 aa  42  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0664368  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04044  hypothetical protein  34 
 
 		 220 aa  41.6  0.004  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00616403  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3797  iron-sulfur cluster repair di-iron protein  34 
 
 		 220 aa  41.6  0.004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000715657  normal  0.850161 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4750  iron-sulfur cluster repair di-iron protein  34 
 
 		 220 aa  41.6  0.004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.020864  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04081  predicted regulator of cell morphogenesis and cell wall metabolism  34 
 
 		 220 aa  41.6  0.004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00617951  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4777  iron-sulfur cluster repair di-iron protein  34 
 
 		 220 aa  41.6  0.004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00129664  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4463  iron-sulfur cluster repair di-iron protein  34 
 
 		 220 aa  41.6  0.004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00510158  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3784  protein of unknown function DUF542 ScdA domain protein  34 
 
 		 220 aa  41.6  0.004  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0015085  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1685  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  28.79 
 
 		 154 aa  40.4  0.009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7183  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  29.2 
 
 		 190 aa  40.4  0.009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4797  iron-sulfur cluster repair di-iron protein  30 
 
 		 220 aa  40  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4677  iron-sulfur cluster repair di-iron protein  30 
 
 		 220 aa  40  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0601381  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4817  iron-sulfur cluster repair di-iron protein  30 
 
 		 220 aa  40  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.452254  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4762  iron-sulfur cluster repair di-iron protein  30 
 
 		 220 aa  40  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5056  iron-sulfur cluster repair di-iron protein  31.78 
 
 		 225 aa  40  0.01  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>