101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcE24377A_4777 on replicon NC_009801
Organism: Escherichia coli E24377A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_04081  predicted regulator of cell morphogenesis and cell wall metabolism  100 
 
 
220 aa  455  1e-127  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00617951  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3784  protein of unknown function DUF542 ScdA domain protein  100 
 
 
220 aa  455  1e-127  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0015085  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4463  iron-sulfur cluster repair di-iron protein  100 
 
 
220 aa  455  1e-127  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00510158  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4777  iron-sulfur cluster repair di-iron protein  100 
 
 
220 aa  455  1e-127  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00129664  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3797  iron-sulfur cluster repair di-iron protein  100 
 
 
220 aa  455  1e-127  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000715657  normal  0.850161 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4750  iron-sulfur cluster repair di-iron protein  100 
 
 
220 aa  455  1e-127  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.020864  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04044  hypothetical protein  100 
 
 
220 aa  455  1e-127  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00616403  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4688  iron-sulfur cluster repair di-iron protein  99.09 
 
 
220 aa  452  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.041656  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5726  iron-sulfur cluster repair di-iron protein  99.09 
 
 
220 aa  451  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0664368  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4762  iron-sulfur cluster repair di-iron protein  89.09 
 
 
220 aa  421  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4817  iron-sulfur cluster repair di-iron protein  89.09 
 
 
220 aa  421  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.452254  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4677  iron-sulfur cluster repair di-iron protein  89.09 
 
 
220 aa  421  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0601381  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4797  iron-sulfur cluster repair di-iron protein  89.09 
 
 
220 aa  421  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0379  iron-sulfur cluster repair di-iron protein  90.45 
 
 
220 aa  419  1e-116  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000130602  normal  0.725738 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4667  iron-sulfur cluster repair di-iron protein  88.64 
 
 
220 aa  418  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.651941  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0782  iron-sulfur cluster repair di-iron protein  66.97 
 
 
221 aa  321  4e-87  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0196066  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3584  iron-sulfur cluster repair di-iron protein  65.61 
 
 
221 aa  308  5e-83  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0000456078  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3427  iron-sulfur cluster repair di-iron protein  65.61 
 
 
221 aa  307  6.999999999999999e-83  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0534408  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0815  iron-sulfur cluster repair di-iron protein  63.35 
 
 
222 aa  304  7e-82  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0339092  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3632  iron-sulfur cluster repair di-iron protein  61.99 
 
 
221 aa  298  4e-80  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3777  iron-sulfur cluster repair di-iron protein  61.99 
 
 
221 aa  298  4e-80  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3955  iron-sulfur cluster repair di-iron protein  61.54 
 
 
221 aa  296  1e-79  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5056  iron-sulfur cluster repair di-iron protein  51.63 
 
 
225 aa  239  2e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02289  iron-sulfur cluster repair di-iron protein  49.33 
 
 
223 aa  226  2e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.104095 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4655  iron-sulfur cluster repair di-iron protein  50.23 
 
 
223 aa  220  9.999999999999999e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.84876  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3578  iron-sulfur cluster repair di-iron protein  50.23 
 
 
223 aa  220  9.999999999999999e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.670531 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3164  hypothetical protein  48.6 
 
 
240 aa  212  3.9999999999999995e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2511  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  48.6 
 
 
240 aa  211  4.9999999999999996e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1571  hypothetical protein  49.05 
 
 
249 aa  193  1e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0611813  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03871  regulator of cell morphogenesis and NO signaling  45.93 
 
 
229 aa  193  2e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4224  hypothetical protein  46.3 
 
 
226 aa  186  2e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1841  hypothetical protein  42.65 
 
 
242 aa  182  4.0000000000000006e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3025  hypothetical protein  45.02 
 
 
223 aa  181  7e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2399  hypothetical protein  43.6 
 
 
224 aa  178  4.999999999999999e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0283392  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0328  hypothetical protein  39.11 
 
 
238 aa  169  3e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0203423  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0492  hypothetical protein  36.84 
 
 
238 aa  157  1e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4124  hypothetical protein  35.68 
 
 
236 aa  156  2e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.403684 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3236  hypothetical protein  39.73 
 
 
234 aa  155  7e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.891566 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0383  hypothetical protein  37.73 
 
 
240 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1582  iron-sulfur cluster repair di-iron protein  37.39 
 
 
235 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3627  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  36.04 
 
 
248 aa  144  8.000000000000001e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000046912  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3989  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  37.73 
 
 
269 aa  144  8.000000000000001e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0730  protein of unknown function DUF542 ScdA domain protein  38.46 
 
 
236 aa  144  8.000000000000001e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000123482  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1998  ScdA protein  36.16 
 
 
235 aa  144  9e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00228936  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1950  cell division and morphogenesis-related protein  36.16 
 
 
235 aa  144  9e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0219264  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2147  ScdA protein  36.16 
 
 
235 aa  144  9e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.910173  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2178  ScdA protein  36.16 
 
 
235 aa  144  9e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1971  cell division and morphogenesis-related protein  36.12 
 
 
235 aa  143  2e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0041532  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0398  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  35.27 
 
 
248 aa  142  3e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0161377  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0397  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  35.27 
 
 
248 aa  142  3e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000185602  normal  0.300688 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1991  hypothetical protein  35.71 
 
 
235 aa  142  4e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0217131  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2153  ScdA protein  35.84 
 
 
235 aa  141  7e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3576  hypothetical protein  36.07 
 
 
259 aa  141  9e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.421101  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2294  ScdA protein  35.27 
 
 
235 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.208436  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3161  ScdA protein  35.27 
 
 
235 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.284126  normal  0.196192 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4649  protein of unknown function DUF542 ScdA domain protein  37.89 
 
 
236 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0767221  normal  0.343196 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3890  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  36.36 
 
 
269 aa  139  3.9999999999999997e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00188883 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3967  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  35.24 
 
 
269 aa  138  4.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.348218  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4302  hypothetical protein  35.16 
 
 
222 aa  137  8.999999999999999e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4083  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  35.68 
 
 
269 aa  137  8.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0155994 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2293  protein of unknown function DUF542 ScdA domain protein  36.49 
 
 
238 aa  136  2e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00571035  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2769  protein of unknown function DUF542, ScdA-like protein  34.67 
 
 
251 aa  134  8e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.381543  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0365  protein of unknown function DUF542, ScdA-like  33.76 
 
 
242 aa  133  1.9999999999999998e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.65621  normal  0.814826 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5785  protein of unknown function DUF542 ScdA domain protein  35.19 
 
 
312 aa  130  2.0000000000000002e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1338  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  33.04 
 
 
241 aa  129  4.0000000000000003e-29  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.164705  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1206  hypothetical protein  29.65 
 
 
317 aa  124  1e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1168  protein of unknown function DUF542 ScdA domain protein  29.07 
 
 
232 aa  124  1e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000104641  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2414  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  32.61 
 
 
243 aa  123  2e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.597571  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2304  putative regulator of cell morphogenesis and NO signaling  43.36 
 
 
162 aa  123  2e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.904148  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0600  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  42.55 
 
 
162 aa  120  1.9999999999999998e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000823613 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3857  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  42.14 
 
 
199 aa  119  3e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0199  protein of unknown function DUF542 ScdA domain protein  29.39 
 
 
236 aa  118  4.9999999999999996e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4057  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  30.43 
 
 
243 aa  118  6e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1827  iron-sulfur cluster repair di-iron protein  32.75 
 
 
242 aa  118  7e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.467017 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0698  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  32.31 
 
 
318 aa  116  3e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.249196  normal 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3700  hypothetical protein  26.87 
 
 
235 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1188  protein of unknown function DUF542, ScdA-like protein  35.09 
 
 
234 aa  113  3e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0450  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  41.29 
 
 
177 aa  112  4.0000000000000004e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0849  hypothetical protein  26.11 
 
 
249 aa  112  5e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0432  hypothetical protein  28.7 
 
 
236 aa  112  5e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0203257  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3494  hemerythrin HHE cation binding region  26.55 
 
 
249 aa  111  7.000000000000001e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1251  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  28.32 
 
 
243 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.964193  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3032  protein of unknown function DUF542 ScdA domain protein  29.2 
 
 
243 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2035  iron-sulfur cluster repair di-iron protein  30.73 
 
 
238 aa  106  2e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0574  hypothetical protein  34.64 
 
 
213 aa  102  4e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.157203 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1686  hypothetical protein  30.29 
 
 
231 aa  102  6e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0753  scdA protein, putative  32.89 
 
 
232 aa  97.8  1e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00120988  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0777  putative scdA protein  32 
 
 
232 aa  95.5  6e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000142333  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1824  protein of unknown function DUF542 ScdA domain protein  28.84 
 
 
231 aa  93.2  3e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2133  hemerythrin HHE cation binding protein  28.84 
 
 
231 aa  92  6e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.270785  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1742  protein of unknown function DUF542 ScdA domain protein  28.84 
 
 
231 aa  92  6e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0584287  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0324  cell wall biosynthesis protein ScdA  25.78 
 
 
224 aa  91.3  9e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.896  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0244  cell wall biosynthesis protein ScdA  27.83 
 
 
224 aa  91.3  1e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0250  cell wall biosynthesis protein ScdA  27.83 
 
 
224 aa  91.3  1e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.887141  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1698  hypothetical protein  28.77 
 
 
206 aa  50.1  0.00003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.203983  normal  0.249154 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2937  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  28.93 
 
 
184 aa  47  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1527  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  35.11 
 
 
177 aa  45.8  0.0005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000541236  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2614  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  34.07 
 
 
176 aa  43.1  0.003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.587772  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0755  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  30.77 
 
 
398 aa  42.7  0.005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03879  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  39.62 
 
 
146 aa  42  0.007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>