93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_3512 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007760  Adeh_3512  hemerythrin HHE cation binding protein  100 
 
 
240 aa  486  1e-136  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0549925  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3600  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  92.5 
 
 
240 aa  407  1e-113  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3669  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  92.08 
 
 
240 aa  405  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1648  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  35.45 
 
 
224 aa  117  9.999999999999999e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.371191  normal  0.835393 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1891  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  40.88 
 
 
152 aa  112  7.000000000000001e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0996  hemerythrin HHE cation binding region  44.78 
 
 
148 aa  105  4e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0493  hemerythrin HHE cation binding region  35.92 
 
 
146 aa  97.1  2e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1838  hemerythrin HHE cation binding region  36.99 
 
 
145 aa  97.1  2e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.49812  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2172  hypothetical protein  38.93 
 
 
146 aa  95.1  9e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0485385  hitchhiker  0.00000439184 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0699  hypothetical protein  40.65 
 
 
146 aa  94  2e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2295  hypothetical protein  52.7 
 
 
80 aa  89.7  3e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.0000100325  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2085  hemerythrin HHE cation binding region  37.69 
 
 
148 aa  87.8  1e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.297499 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5064  hemerythrin HHE cation binding region  40 
 
 
141 aa  82  0.000000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.650384  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2848  hypothetical protein  45.83 
 
 
99 aa  80.1  0.00000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2337  hypothetical protein  45.83 
 
 
99 aa  80.1  0.00000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00153734  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0266  Protein of unknown function DUF2249  47.44 
 
 
96 aa  79.7  0.00000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4922  hypothetical protein  47.89 
 
 
95 aa  79.3  0.00000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0412944 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0511  hypothetical protein  48.1 
 
 
79 aa  77.8  0.0000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.477977  normal  0.740895 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4014  hypothetical protein  44.74 
 
 
96 aa  76.6  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.500413  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4127  hypothetical protein  44.74 
 
 
96 aa  76.6  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1614  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  28.7 
 
 
254 aa  75.5  0.0000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00121654 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1474  hypothetical protein  40.45 
 
 
89 aa  75.5  0.0000000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0782723 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1942  hypothetical protein  28.7 
 
 
254 aa  75.5  0.0000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1791  hypothetical protein  44 
 
 
126 aa  75.1  0.0000000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.146981  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4720  hypothetical protein  41.86 
 
 
95 aa  75.1  0.0000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6283  hypothetical protein  41.86 
 
 
105 aa  73.9  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0295771  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0469  hypothetical protein  37.84 
 
 
75 aa  73.6  0.000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000487548  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2767  hypothetical protein  41.33 
 
 
132 aa  72.8  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.197859  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2709  hypothetical protein  41.33 
 
 
132 aa  72.8  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.9011  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2884  hypothetical protein  41.33 
 
 
132 aa  72.8  0.000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2405  hypothetical protein  41.33 
 
 
132 aa  72.8  0.000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1718  hypothetical protein  41.33 
 
 
132 aa  72.8  0.000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0745976  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2829  hypothetical protein  41.33 
 
 
132 aa  72.8  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0137  hypothetical protein  43.66 
 
 
98 aa  71.2  0.00000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00160252  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1674  hypothetical protein  47.95 
 
 
82 aa  71.2  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.477386  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3486  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  41.43 
 
 
254 aa  70.5  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.167785 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0902  hypothetical protein  35.83 
 
 
174 aa  69.3  0.00000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.73345 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03879  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  40.59 
 
 
146 aa  68.9  0.00000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4036  hypothetical protein  45.21 
 
 
83 aa  68.9  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0121  hypothetical protein  43.48 
 
 
80 aa  68.2  0.0000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.0000914401  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1562  Protein of unknown function DUF2249  48.44 
 
 
77 aa  68.2  0.0000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3790  hypothetical protein  44.16 
 
 
82 aa  67  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.142548 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1456  hypothetical protein  44.29 
 
 
86 aa  67  0.0000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.508764  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2348  hypothetical protein  45.68 
 
 
89 aa  66.6  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3980  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  40.58 
 
 
279 aa  66.6  0.0000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.166749  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0228  hypothetical protein  46.48 
 
 
94 aa  66.6  0.0000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4375  hypothetical protein  45.07 
 
 
95 aa  66.6  0.0000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.674673  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2154  hypothetical protein  42.86 
 
 
83 aa  67  0.0000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0252  hypothetical protein  46.48 
 
 
94 aa  66.2  0.0000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.303183  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3969  hypothetical protein  42.86 
 
 
96 aa  66.2  0.0000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.956951  normal  0.0519683 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0698  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  40.85 
 
 
318 aa  66.2  0.0000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.249196  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0723  hypothetical protein  47.62 
 
 
77 aa  65.5  0.0000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1527  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  38.53 
 
 
177 aa  65.9  0.0000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000541236  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03037  hypothetical protein  42.03 
 
 
100 aa  64.7  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.374942  normal  0.0219122 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1236  hypothetical protein  42.86 
 
 
85 aa  65.1  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.000489654  unclonable  0.0000000165083 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1765  Protein of unknown function DUF2249  46.48 
 
 
104 aa  63.9  0.000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.552267  hitchhiker  0.0052734 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2100  hypothetical protein  42.47 
 
 
78 aa  63.5  0.000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.123165  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1637  hypothetical protein  45.83 
 
 
106 aa  63.2  0.000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.613783  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1749  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  24.19 
 
 
238 aa  62.4  0.000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.280527 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3274  hypothetical protein  36.26 
 
 
354 aa  61.2  0.00000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.100795 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4862  hypothetical protein  37.68 
 
 
204 aa  60.5  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.902851  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0153  hypothetical protein  35.71 
 
 
99 aa  60.1  0.00000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.75101 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0494  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  36.92 
 
 
168 aa  58.2  0.0000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.235058  normal  0.242573 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0493  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  37.84 
 
 
255 aa  57  0.0000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.253924  normal  0.340868 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5785  protein of unknown function DUF542 ScdA domain protein  35.35 
 
 
312 aa  55.8  0.0000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2489  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  29.03 
 
 
153 aa  55.1  0.0000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2868  hypothetical protein  29.03 
 
 
153 aa  55.1  0.0000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2175  hypothetical protein  39.44 
 
 
84 aa  53.5  0.000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0360985  hitchhiker  0.00000399577 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0752  hypothetical protein  26.88 
 
 
270 aa  53.5  0.000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00690211  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0776  hypothetical protein  28.46 
 
 
270 aa  52.8  0.000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000379179  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23290  hypothetical protein  34.72 
 
 
105 aa  52.8  0.000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0104  hypothetical protein  50 
 
 
85 aa  51.6  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1607  hypothetical protein  50 
 
 
85 aa  51.6  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1524  hypothetical protein  50 
 
 
85 aa  51.6  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.789174  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1269  hypothetical protein  50 
 
 
85 aa  51.6  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.171987  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1973  hypothetical protein  44.44 
 
 
77 aa  50.8  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.768292  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1329  hypothetical protein  40 
 
 
87 aa  49.7  0.00004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.266381  normal  0.659886 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2509  hypothetical protein  50 
 
 
89 aa  49.3  0.00006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.646613  normal  0.568324 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1764  Protein of unknown function DUF2249  43.18 
 
 
77 aa  47.8  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4145  hypothetical protein  40 
 
 
86 aa  47.4  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.441445  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4723  hypothetical protein  44.23 
 
 
101 aa  47.4  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0032  hypothetical protein  42.22 
 
 
98 aa  45.8  0.0005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0241551  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31370  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  33.33 
 
 
164 aa  46.2  0.0005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2660  putative PAS/PAC sensor protein  24.26 
 
 
395 aa  45.8  0.0005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3137  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  23.93 
 
 
239 aa  46.2  0.0005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4302  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  29.73 
 
 
168 aa  46.2  0.0005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2384  hypothetical protein  35.38 
 
 
91 aa  45.8  0.0006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1580  putative PAS/PAC sensor protein  24.71 
 
 
406 aa  44.7  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0956  Cupin 2 conserved barrel domain protein  41.86 
 
 
180 aa  44.3  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2518  hypothetical protein  36.67 
 
 
108 aa  44.3  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1436  hypothetical protein  28.06 
 
 
154 aa  42.4  0.006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1685  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  32.88 
 
 
154 aa  42  0.009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2610  Cupin 2 conserved barrel domain protein  41.46 
 
 
199 aa  41.6  0.01  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>