59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_0956 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_0956  Cupin 2 conserved barrel domain protein  100 
 
 		 180 aa  354  2.9999999999999997e-97  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1764  Protein of unknown function DUF2249  73.33 
 
 		 77 aa  112  4.0000000000000004e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1550  hypothetical protein  63.51 
 
 		 77 aa  99.8  2e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1761  Cupin 2 conserved barrel domain protein  52.53 
 
 		 109 aa  99  3e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0032  hypothetical protein  57.53 
 
 		 98 aa  88.2  5e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0241551  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1973  hypothetical protein  53.52 
 
 		 77 aa  83.6  0.000000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.768292  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1974  Cupin 2 conserved barrel domain protein  50 
 
 		 100 aa  78.2  0.00000000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.490443  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0121  hypothetical protein  38.37 
 
 		 80 aa  58.2  0.00000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.0000914401  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0266  Protein of unknown function DUF2249  37.8 
 
 		 96 aa  56.2  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1439  cupin 2 domain-containing protein  27.56 
 
 		 199 aa  56.2  0.0000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.83171  normal  1 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3274  hypothetical protein  48.15 
 
 		 354 aa  56.6  0.0000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.100795 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1456  hypothetical protein  36.49 
 
 		 86 aa  55.8  0.0000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.508764  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2610  Cupin 2 conserved barrel domain protein  26.99 
 
 		 199 aa  55.5  0.0000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1474  hypothetical protein  50 
 
 		 89 aa  54.7  0.0000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0782723 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0511  hypothetical protein  50 
 
 		 79 aa  54.3  0.000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.477977  normal  0.740895 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2295  hypothetical protein  40 
 
 		 80 aa  53.5  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.0000100325  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4375  hypothetical protein  48.98 
 
 		 95 aa  53.1  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.674673  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0469  hypothetical protein  44.68 
 
 		 75 aa  53.1  0.000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000487548  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0137  hypothetical protein  35.09 
 
 		 98 aa  51.6  0.000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00160252  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4922  hypothetical protein  44.64 
 
 		 95 aa  51.2  0.000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0412944 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4720  hypothetical protein  42 
 
 		 95 aa  51.2  0.000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0902  hypothetical protein  39.66 
 
 		 174 aa  50.4  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.73345 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2337  hypothetical protein  30.93 
 
 		 99 aa  50.1  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00153734  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2100  hypothetical protein  44.68 
 
 		 78 aa  49.7  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.123165  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2848  hypothetical protein  30.93 
 
 		 99 aa  50.1  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0252  hypothetical protein  48.98 
 
 		 94 aa  49.7  0.00002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.303183  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0228  hypothetical protein  48.98 
 
 		 94 aa  49.3  0.00003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4127  hypothetical protein  41.82 
 
 		 96 aa  48.9  0.00004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6283  hypothetical protein  32.94 
 
 		 105 aa  48.9  0.00004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0295771  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4014  hypothetical protein  41.82 
 
 		 96 aa  48.9  0.00004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.500413  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4862  hypothetical protein  29.8 
 
 		 204 aa  48.1  0.00006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.902851  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3790  hypothetical protein  53.66 
 
 		 82 aa  48.1  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.142548 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3670  cupin 2 domain-containing protein  33.33 
 
 		 111 aa  48.1  0.00007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0801583 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2292  hypothetical protein  40 
 
 		 86 aa  48.1  0.00007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0146361  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2829  hypothetical protein  46.51 
 
 		 132 aa  47.8  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1718  hypothetical protein  46.51 
 
 		 132 aa  47.8  0.00008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0745976  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2767  hypothetical protein  46.51 
 
 		 132 aa  47.8  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.197859  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2709  hypothetical protein  46.51 
 
 		 132 aa  47.8  0.00008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.9011  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2405  hypothetical protein  46.51 
 
 		 132 aa  47.8  0.00008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2884  hypothetical protein  46.51 
 
 		 132 aa  47.8  0.00008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5785  protein of unknown function DUF542 ScdA domain protein  27.84 
 
 		 312 aa  47.4  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1791  hypothetical protein  32.95 
 
 		 126 aa  46.2  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.146981  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4036  hypothetical protein  48.78 
 
 		 83 aa  46.6  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3969  hypothetical protein  32.14 
 
 		 96 aa  46.6  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.956951  normal  0.0519683 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1674  hypothetical protein  48.89 
 
 		 82 aa  46.2  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.477386  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2154  hypothetical protein  43.48 
 
 		 83 aa  45.4  0.0004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2919  hypothetical protein  28.38 
 
 		 114 aa  45.1  0.0005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000876891  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3512  hemerythrin HHE cation binding protein  33.03 
 
 		 240 aa  43.9  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0549925  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03037  hypothetical protein  40 
 
 		 100 aa  43.9  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.374942  normal  0.0219122 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0698  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  31.82 
 
 		 318 aa  43.5  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.249196  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3600  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  42.86 
 
 		 240 aa  43.5  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1637  hypothetical protein  37.5 
 
 		 106 aa  42.7  0.003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.613783  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2440  hypothetical protein  30.36 
 
 		 129 aa  42  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0542121  normal  0.878166 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3669  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  40.48 
 
 		 240 aa  42  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5520  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30 
 
 		 111 aa  42  0.005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0403366  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1562  Protein of unknown function DUF2249  42.86 
 
 		 77 aa  42  0.005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4145  hypothetical protein  36.96 
 
 		 86 aa  41.6  0.006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.441445  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3718  cupin 2, barrel  28.26 
 
 		 109 aa  41.6  0.006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.275117 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0723  hypothetical protein  43.9 
 
 		 77 aa  41.2  0.007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>