34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_2610 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001800  Ssol_2610  Cupin 2 conserved barrel domain protein  100 
 
 
199 aa  402  1e-111  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1439  cupin 2 domain-containing protein  64.8 
 
 
199 aa  270  8.000000000000001e-72  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.83171  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2287  Cupin 2 conserved barrel domain protein  43.3 
 
 
125 aa  84  0.000000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.709012  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1972  Cupin 2 conserved barrel domain protein  41.11 
 
 
143 aa  80.1  0.00000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3286  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.96 
 
 
124 aa  70.5  0.00000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1549  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.45 
 
 
144 aa  59.3  0.00000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0956  Cupin 2 conserved barrel domain protein  26.99 
 
 
180 aa  55.5  0.0000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1662  cupin 2 domain-containing protein  33.33 
 
 
108 aa  49.3  0.00004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000140317  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1973  hypothetical protein  35.21 
 
 
77 aa  48.9  0.00005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.768292  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2799  hypothetical protein  30 
 
 
104 aa  47  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.7832900000000002e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4862  hypothetical protein  22.16 
 
 
204 aa  46.2  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.902851  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0469  hypothetical protein  39.34 
 
 
75 aa  46.2  0.0003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000487548  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0782  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.08 
 
 
115 aa  45.8  0.0005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0960825  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1897  cupin region  30 
 
 
110 aa  45.8  0.0005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.766925  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2191  cupin region  27.5 
 
 
122 aa  45.4  0.0006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.357832  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3898  Cupin 2 conserved barrel domain protein  23.75 
 
 
113 aa  45.1  0.0006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1608  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.36 
 
 
104 aa  44.3  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00104789  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05350  cupin domain-containing protein  34.33 
 
 
119 aa  44.3  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3304  signal peptide protein  37.5 
 
 
155 aa  44.3  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0282721  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3988  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.27 
 
 
146 aa  43.1  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.507618  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1298  cupin 2 domain-containing protein  28.24 
 
 
127 aa  43.5  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2863  cupin 2, barrel  31.08 
 
 
107 aa  43.1  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0317  hypothetical protein  31.58 
 
 
132 aa  43.5  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.543351  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1550  hypothetical protein  32.88 
 
 
77 aa  43.1  0.003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0032  hypothetical protein  34.72 
 
 
98 aa  42.7  0.003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0241551  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1329  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.27 
 
 
123 aa  42.7  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08490  Cupin 2 conserved barrel domain protein  26.83 
 
 
105 aa  42.4  0.004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1828  Cupin 2 conserved barrel domain protein  25.93 
 
 
113 aa  42.4  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8205  hypothetical protein  30 
 
 
136 aa  42.7  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2919  hypothetical protein  45.24 
 
 
114 aa  42.4  0.005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000876891  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3113  cupin 2 domain-containing protein  32.91 
 
 
174 aa  42  0.006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.487782  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1689  hypothetical protein  28.33 
 
 
235 aa  42  0.007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.209957 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1764  Protein of unknown function DUF2249  30.99 
 
 
77 aa  41.6  0.008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3512  hemerythrin HHE cation binding protein  41.46 
 
 
240 aa  41.2  0.009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0549925  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>