22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_8205 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_8205  hypothetical protein  100 
 
 		 136 aa  268  2e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7502  Cupin 2 conserved barrel domain protein  45.19 
 
 		 127 aa  114  6e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5804  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.84 
 
 		 123 aa  75.5  0.0000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5971  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.7 
 
 		 130 aa  56.6  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5098  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.05 
 
 		 124 aa  55.1  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4632  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.3 
 
 		 123 aa  50.4  0.000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0666075 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1603  cupin 2 domain-containing protein  29.27 
 
 		 123 aa  47  0.00008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2414  hypothetical protein  31.36 
 
 		 155 aa  46.2  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.478977  normal  0.947675 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1504  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.67 
 
 		 111 aa  45.8  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.220487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5708  cupin 2 domain-containing protein  29.13 
 
 		 111 aa  45.1  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.203885  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1723  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.85 
 
 		 132 aa  44.3  0.0005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.410123  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0303  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.73 
 
 		 121 aa  43.9  0.0008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1069  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36 
 
 		 117 aa  43.5  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.486556 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3065  mannose-1-phosphate guanylyltransferase/mannose-6-phosphate isomerase  34.15 
 
 		 450 aa  43.5  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.861502  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0692  cupin 2 domain-containing protein  39.22 
 
 		 163 aa  42.4  0.002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2610  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30 
 
 		 199 aa  42.7  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2327  cupin 2 domain-containing protein  28.57 
 
 		 150 aa  42  0.003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000139899 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3363  Cupin 2 conserved barrel domain protein  25.27 
 
 		 181 aa  42  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.331871 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1368  hypothetical protein  33.33 
 
 		 116 aa  41.2  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.505892  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0452  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.38 
 
 		 136 aa  41.2  0.005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2778  Cupin 2 conserved barrel domain protein  25.81 
 
 		 111 aa  40  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.936799 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7008  hypothetical protein  36.36 
 
 		 163 aa  40  0.01  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0126624  hitchhiker  0.000933462 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>