76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1069 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_1069  Cupin 2 conserved barrel domain protein  100 
 
 		 117 aa  241  3e-63  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.486556 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0452  Cupin 2 conserved barrel domain protein  65.09 
 
 		 136 aa  153  9e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2778  Cupin 2 conserved barrel domain protein  55.56 
 
 		 111 aa  129  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.936799 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5708  cupin 2 domain-containing protein  55.1 
 
 		 111 aa  115  9.999999999999999e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.203885  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0445  Cupin 2 conserved barrel domain protein  51.4 
 
 		 123 aa  111  3e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.205887 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0262  Cupin 2 conserved barrel domain protein  41 
 
 		 121 aa  74.7  0.0000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.11735 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2831  cupin 2 domain-containing protein  38.04 
 
 		 117 aa  65.9  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2044  hypothetical protein  37 
 
 		 128 aa  65.5  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0884  cupin 2, barrel  50 
 
 		 191 aa  59.7  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0347  Mannose-1-phosphate guanylyltransferase  31.82 
 
 		 476 aa  49.7  0.00001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2327  cupin 2 domain-containing protein  39.06 
 
 		 150 aa  48.5  0.00003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000139899 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0895  cupin 2 domain-containing protein  30.3 
 
 		 125 aa  48.1  0.00004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1558  cupin 2 domain-containing protein  33 
 
 		 180 aa  48.1  0.00004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0888  mannose-1-phosphate guanylyltransferase-like  33.33 
 
 		 119 aa  47.4  0.00006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.749299  hitchhiker  0.000147914 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3140  conserved hypothetical phosphomannose protein  37.5 
 
 		 137 aa  47.4  0.00007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1709  cupin 2, barrel  33.67 
 
 		 163 aa  47  0.00008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.448021 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3902  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.1 
 
 		 166 aa  47  0.00009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.760355  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1181  Cupin 2 conserved barrel domain protein  42.19 
 
 		 192 aa  47  0.00009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.229288 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2810  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.45 
 
 		 191 aa  46.6  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.597474  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3707  cupin 2, barrel  37.68 
 
 		 138 aa  46.6  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.52835  normal  0.602346 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1041  cupin 2 domain-containing protein  35.62 
 
 		 311 aa  46.6  0.0001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.421449  normal  0.0580221 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000921  putative pectin degradation protein  28.57 
 
 		 109 aa  45.8  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2629  Cupin 2 conserved barrel domain protein  39.39 
 
 		 138 aa  46.2  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1023  cupin 2 domain-containing protein  28.42 
 
 		 120 aa  45.4  0.0002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0134  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.92 
 
 		 118 aa  45.4  0.0003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0602  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.94 
 
 		 118 aa  45.1  0.0004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0780  cupin 2 domain-containing protein  45.65 
 
 		 106 aa  43.9  0.0007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5302  Cupin 2 conserved barrel domain protein  26.53 
 
 		 153 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0105  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.43 
 
 		 204 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3197  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.03 
 
 		 191 aa  43.1  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.229687  normal  0.39078 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3746  cupin 2 domain-containing protein  30.11 
 
 		 124 aa  43.5  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0102  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.43 
 
 		 204 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.66506 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8205  hypothetical protein  36 
 
 		 136 aa  43.5  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3287  cupin 2 domain-containing protein  40 
 
 		 107 aa  43.5  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.927122  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0440  cupin 2, barrel  26.26 
 
 		 149 aa  42.4  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.351298  normal  0.537185 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17330  cupin domain-containing protein  32.04 
 
 		 148 aa  42.4  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.017863  normal  0.0817952 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6135  hypothetical protein  38.71 
 
 		 155 aa  42.4  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.715074  normal  0.381762 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2249  cupin 2, barrel  30.88 
 
 		 143 aa  41.6  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5381  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.98 
 
 		 132 aa  42  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2778  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.67 
 
 		 128 aa  42  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.492542  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1009  cupin family protein  31.58 
 
 		 119 aa  41.6  0.003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0206  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.21 
 
 		 115 aa  42  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1904  cupin region  31.82 
 
 		 120 aa  41.6  0.004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1228  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.33 
 
 		 135 aa  41.6  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.066401  normal  0.685252 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3988  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.9 
 
 		 146 aa  41.2  0.004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.507618  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01287  hypothetical protein  28.04 
 
 		 185 aa  41.2  0.005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5098  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.62 
 
 		 124 aa  41.2  0.005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1535  DNA-binding transcriptional repressor PuuR  28.04 
 
 		 185 aa  41.2  0.005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2347  transcriptional regulator, XRE family  28.04 
 
 		 185 aa  41.2  0.005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.204857  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1414  DNA-binding transcriptional repressor PuuR  28.04 
 
 		 185 aa  41.2  0.005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1509  DNA-binding transcriptional repressor PuuR  28.04 
 
 		 185 aa  41.2  0.005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2326  DNA-binding transcriptional repressor PuuR  28.04 
 
 		 185 aa  41.2  0.005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1823  DNA-binding transcriptional repressor PuuR  28.04 
 
 		 185 aa  41.2  0.005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0706879 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01276  DNA-binding transcriptional repressor  28.04 
 
 		 185 aa  41.2  0.005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4381  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.23 
 
 		 117 aa  40.8  0.006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.588155  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0535  cupin 2 domain-containing protein  33.78 
 
 		 147 aa  40.8  0.006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.293275  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1923  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.12 
 
 		 145 aa  40.8  0.006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0356258  normal  0.456316 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1428  transcriptional regulator, AraC family  35.71 
 
 		 285 aa  40.8  0.006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1700  cupin 2 domain-containing protein  33.78 
 
 		 147 aa  40.4  0.007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.792463 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0633  cupin 2 domain-containing protein  36.36 
 
 		 158 aa  40.8  0.007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.643791  normal  0.229137 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1675  cupin 2, barrel  33.78 
 
 		 147 aa  40.4  0.007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5649  cupin 2 domain-containing protein  33.78 
 
 		 147 aa  40.4  0.007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1941  DNA-binding transcriptional repressor PuuR  28.04 
 
 		 185 aa  40.8  0.007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.385308 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1649  cupin 2 domain-containing protein  33.78 
 
 		 147 aa  40.4  0.007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.316822  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0548  cupin 2 domain-containing protein  33.78 
 
 		 147 aa  40.4  0.007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.915131  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0630  cupin 2 domain-containing protein  33.78 
 
 		 147 aa  40.4  0.007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1444  cupin 2 domain-containing protein  36.23 
 
 		 132 aa  40.4  0.008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4108  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.88 
 
 		 165 aa  40.4  0.008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0432  cupin region  32.31 
 
 		 117 aa  40.4  0.008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.583729  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0468  cupin 2 domain-containing protein  27.52 
 
 		 157 aa  40.4  0.009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1827  hypothetical protein  30 
 
 		 121 aa  40.4  0.009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5299  hypothetical protein  43.14 
 
 		 166 aa  40  0.01  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148055  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1481  Cupin 2 conserved barrel domain protein  43.64 
 
 		 118 aa  40  0.01  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000853515 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1856  Cupin 2 conserved barrel domain protein  43.64 
 
 		 118 aa  40  0.01  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0185849  hitchhiker  0.0000000000536602 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6339  Cupin 2 conserved barrel domain-containing protein  43.64 
 
 		 160 aa  40  0.01  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000000399971  hitchhiker  0.000000968106 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4483  Cupin 2 conserved barrel domain protein  43.64 
 
 		 160 aa  40  0.01  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000935764 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>