107 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_0692 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008578  Acel_0692  cupin 2 domain-containing protein  100 
 
 		 163 aa  320  4e-87  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7008  hypothetical protein  63.98 
 
 		 163 aa  207  5e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0126624  hitchhiker  0.000933462 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2969  cupin 2  40 
 
 		 171 aa  105  2e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1181  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.93 
 
 		 192 aa  105  2e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.229288 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3620  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.51 
 
 		 159 aa  93.6  9e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.517442  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3189  cupin 2, barrel  40.94 
 
 		 190 aa  90.1  1e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00000805068  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2964  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.69 
 
 		 160 aa  85.9  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.75352  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2295  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.94 
 
 		 166 aa  83.6  0.000000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0105  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.66 
 
 		 204 aa  83.6  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0102  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.66 
 
 		 204 aa  83.2  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.66506 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4108  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.99 
 
 		 165 aa  79  0.00000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3191  cupin 2, barrel  33.13 
 
 		 179 aa  71.6  0.000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000053457  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2781  cupin 2, barrel  32.28 
 
 		 338 aa  67.8  0.00000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.402218  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4562  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.94 
 
 		 153 aa  67.8  0.00000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3902  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.48 
 
 		 166 aa  67.4  0.00000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.760355  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5062  hypothetical protein  38 
 
 		 157 aa  66.6  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.421326  normal  0.406339 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3706  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.54 
 
 		 163 aa  65.1  0.0000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2609  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.4 
 
 		 160 aa  64.3  0.0000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.629  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3503  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.66 
 
 		 182 aa  63.9  0.0000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3908  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.77 
 
 		 186 aa  62.4  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.399642  normal  0.0760956 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3113  cupin 2 domain-containing protein  31.17 
 
 		 174 aa  62.4  0.000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.487782  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3363  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.14 
 
 		 181 aa  62  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.331871 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4239  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.55 
 
 		 163 aa  62  0.000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.637233  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3647  cupin 2 domain-containing protein  35.29 
 
 		 149 aa  61.6  0.000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4406  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.25 
 
 		 169 aa  61.6  0.000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0295153  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6348  cupin 2 domain-containing protein  32.28 
 
 		 163 aa  61.2  0.000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2790  cupin 2 domain-containing protein  28.32 
 
 		 153 aa  59.7  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3791  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.48 
 
 		 159 aa  60.5  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.302037  normal  0.0222415 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0565  hypothetical protein  29.61 
 
 		 155 aa  59.3  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.916683  normal  0.52627 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5435  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.58 
 
 		 149 aa  58.5  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.657648 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3556  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.33 
 
 		 169 aa  58.2  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4882  hypothetical protein  32.08 
 
 		 145 aa  57.4  0.00000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.192272  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3197  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.45 
 
 		 191 aa  55.8  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.229687  normal  0.39078 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5084  cupin superfamily protein  39.02 
 
 		 147 aa  53.1  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0259637  normal  0.536671 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6634  cupin 2 domain-containing protein  31.74 
 
 		 189 aa  53.5  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.718615  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0378  cupin region  38.2 
 
 		 153 aa  53.1  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.930622  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3067  cupin 2 domain-containing protein  29.25 
 
 		 145 aa  53.1  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1923  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32 
 
 		 145 aa  52.8  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0356258  normal  0.456316 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6233  Cupin 2 conserved barrel domain protein  39.39 
 
 		 163 aa  53.1  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.398434  normal  0.379299 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2309  hypothetical protein  32.14 
 
 		 139 aa  52.4  0.000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.5332  hitchhiker  0.00622303 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1228  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.93 
 
 		 135 aa  51.6  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.066401  normal  0.685252 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3153  cupin 2 domain-containing protein  32.98 
 
 		 135 aa  50.8  0.000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2327  cupin 2 domain-containing protein  35.53 
 
 		 150 aa  50.4  0.000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000139899 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3707  cupin 2, barrel  30.95 
 
 		 138 aa  49.7  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.52835  normal  0.602346 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1355  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.8 
 
 		 195 aa  49.3  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.646374  normal  0.0330672 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3773  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.67 
 
 		 421 aa  49.7  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.239832  normal  0.155443 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0837  cupin 2 domain-containing protein  36.56 
 
 		 125 aa  48.9  0.00003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.168826 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0454  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.17 
 
 		 356 aa  48.9  0.00003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2685  hypothetical protein  34.51 
 
 		 152 aa  48.1  0.00005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.273941  normal  0.254874 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0320  cupin 2 domain-containing protein  30.1 
 
 		 146 aa  47.8  0.00006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.864661  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0747  cupin-like protein  39.39 
 
 		 169 aa  47.8  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.179804  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3608  cupin 2 domain-containing protein  34.15 
 
 		 159 aa  47.8  0.00007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.13649  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0204  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.18 
 
 		 160 aa  47.4  0.00009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1350  cupin 2 domain-containing protein  37.31 
 
 		 287 aa  46.6  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.832765  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0633  cupin 2 domain-containing protein  36.9 
 
 		 158 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.643791  normal  0.229137 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5786  cupin 2 conserved barrel domain protein  30.4 
 
 		 135 aa  46.6  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.242076  normal  0.0379764 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2946  transcriptional regulator  36.23 
 
 		 197 aa  46.6  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1709  cupin 2, barrel  29.17 
 
 		 163 aa  45.8  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.448021 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4525  cupin 2 domain-containing protein  34.52 
 
 		 147 aa  46.6  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0109  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.43 
 
 		 377 aa  46.2  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.146013 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4297  cupin 2 domain-containing protein  31.63 
 
 		 144 aa  45.4  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1721  XRE family transcriptional regulator  25.22 
 
 		 201 aa  45.4  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17330  cupin domain-containing protein  36.9 
 
 		 148 aa  45.8  0.0003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.017863  normal  0.0817952 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1864  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.59 
 
 		 144 aa  44.7  0.0005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2629  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.33 
 
 		 138 aa  44.7  0.0006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4417  cupin:cupin region  30.65 
 
 		 155 aa  44.3  0.0007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1207  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.57 
 
 		 152 aa  44.3  0.0007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.830198  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5012  hypothetical protein  32.26 
 
 		 155 aa  43.9  0.0008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0120588  normal  0.173507 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5545  cupin 2 domain-containing protein  34.15 
 
 		 141 aa  44.3  0.0008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1009  cupin family protein  28.95 
 
 		 119 aa  43.5  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0884  cupin 2, barrel  32 
 
 		 191 aa  43.9  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0144  cupin 2 domain-containing protein  30.94 
 
 		 165 aa  43.9  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1468  cupin 2 domain-containing protein  37.84 
 
 		 190 aa  43.5  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3638  cupin 2 domain-containing protein  30.43 
 
 		 152 aa  43.1  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.588869  normal  0.0557412 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3140  conserved hypothetical phosphomannose protein  30 
 
 		 137 aa  43.5  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2778  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.18 
 
 		 111 aa  43.5  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.936799 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0134  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.65 
 
 		 118 aa  43.9  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2502  Cupin 2 conserved barrel domain protein  42.86 
 
 		 159 aa  43.1  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.529336 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0950  cupin 2 domain-containing protein  37.29 
 
 		 157 aa  42  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3787  homogentisate 12-dioxygenase  36.51 
 
 		 407 aa  42.4  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3674  cupin 2 domain-containing protein  32.63 
 
 		 131 aa  42.4  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.206207  normal  0.126063 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2945  cupin 2 domain-containing protein  36.62 
 
 		 171 aa  42  0.003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8205  hypothetical protein  39.22 
 
 		 136 aa  42.4  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0950  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.59 
 
 		 389 aa  42  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1305  cupin 2, barrel  33.9 
 
 		 115 aa  41.6  0.004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0335072  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2908  Cupin 2 conserved barrel domain protein  42.86 
 
 		 159 aa  42  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0262  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.38 
 
 		 121 aa  41.6  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.11735 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3405  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.74 
 
 		 156 aa  42  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3146  cupin 2 domain-containing protein  31.58 
 
 		 134 aa  41.6  0.005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6281  hypothetical protein  30.3 
 
 		 149 aa  41.6  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3997  cupin 2 domain-containing protein  28.57 
 
 		 148 aa  41.2  0.006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.439431  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1107  homogentisate 12-dioxygenase  36.76 
 
 		 399 aa  41.2  0.006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.141602 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3161  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.51 
 
 		 158 aa  41.2  0.006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1447  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.28 
 
 		 190 aa  41.2  0.006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.901222  normal  0.428247 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1711  hypothetical protein  42.22 
 
 		 126 aa  41.2  0.007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0711827  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0760  cupin domain-containing protein  42.22 
 
 		 126 aa  41.2  0.007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0558257  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2435  cupin domain-containing protein  42.22 
 
 		 126 aa  41.2  0.007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.416831  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2296  cupin domain-containing protein  42.22 
 
 		 126 aa  41.2  0.007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.686481  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1662  cupin 2 domain-containing protein  27.94 
 
 		 108 aa  41.2  0.007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000140317  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0440  cupin 2, barrel  29.79 
 
 		 149 aa  40.8  0.008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.351298  normal  0.537185 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>