136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_0105 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011726  PCC8801_0105  Cupin 2 conserved barrel domain protein  100 
 
 		 204 aa  422  1e-117  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0102  Cupin 2 conserved barrel domain protein  99.02 
 
 		 204 aa  418  1e-116  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.66506 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1181  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.13 
 
 		 192 aa  115  3e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.229288 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3189  cupin 2, barrel  36.49 
 
 		 190 aa  115  3e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00000805068  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4108  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.67 
 
 		 165 aa  115  3.9999999999999997e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2964  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.99 
 
 		 160 aa  107  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.75352  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2969  cupin 2  32.19 
 
 		 171 aa  85.5  5e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3191  cupin 2, barrel  35.65 
 
 		 179 aa  84.3  0.000000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000053457  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0692  cupin 2 domain-containing protein  29.66 
 
 		 163 aa  83.6  0.000000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1709  cupin 2, barrel  33.1 
 
 		 163 aa  78.2  0.00000000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.448021 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7008  hypothetical protein  26.14 
 
 		 163 aa  76.6  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0126624  hitchhiker  0.000933462 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3363  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.81 
 
 		 181 aa  75.5  0.0000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.331871 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2790  cupin 2 domain-containing protein  32.48 
 
 		 153 aa  75.1  0.0000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3620  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.04 
 
 		 159 aa  73.9  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.517442  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3647  cupin 2 domain-containing protein  30.3 
 
 		 149 aa  73.6  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3908  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.89 
 
 		 186 aa  73.2  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.399642  normal  0.0760956 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3902  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.94 
 
 		 166 aa  72.8  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.760355  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2609  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.78 
 
 		 160 aa  72  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.629  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3197  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.32 
 
 		 191 aa  68.6  0.00000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.229687  normal  0.39078 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3503  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.83 
 
 		 182 aa  68.2  0.00000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6348  cupin 2 domain-containing protein  30.93 
 
 		 163 aa  66.2  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3556  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.19 
 
 		 169 aa  66.2  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5435  Cupin 2 conserved barrel domain protein  25.17 
 
 		 149 aa  66.2  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.657648 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3706  Cupin 2 conserved barrel domain protein  26.54 
 
 		 163 aa  63.5  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4406  Cupin 2 conserved barrel domain protein  26.42 
 
 		 169 aa  59.7  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0295153  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4239  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.46 
 
 		 163 aa  58.2  0.00000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.637233  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4562  Cupin 2 conserved barrel domain protein  24.49 
 
 		 153 aa  58.2  0.00000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3608  cupin 2 domain-containing protein  26.83 
 
 		 159 aa  57  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.13649  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3113  cupin 2 domain-containing protein  24.62 
 
 		 174 aa  55.5  0.0000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.487782  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0884  cupin 2, barrel  25.76 
 
 		 191 aa  55.1  0.0000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0134  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.82 
 
 		 118 aa  55.1  0.0000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6281  hypothetical protein  27.12 
 
 		 149 aa  55.1  0.0000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1827  hypothetical protein  36.25 
 
 		 121 aa  54.7  0.0000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2778  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.29 
 
 		 111 aa  54.3  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.936799 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2141  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32 
 
 		 159 aa  53.5  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3791  Cupin 2 conserved barrel domain protein  24.62 
 
 		 159 aa  53.9  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.302037  normal  0.0222415 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5178  XRE family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 199 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.174471  normal  0.155373 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2295  Cupin 2 conserved barrel domain protein  25.36 
 
 		 166 aa  53.9  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3140  conserved hypothetical phosphomannose protein  33.75 
 
 		 137 aa  53.9  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5268  Cro/CI family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 182 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0565  hypothetical protein  31.51 
 
 		 155 aa  52.8  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.916683  normal  0.52627 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0320  cupin 2 domain-containing protein  26.62 
 
 		 146 aa  52.8  0.000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.864661  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5320  XRE family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 182 aa  52.8  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.8166  normal  0.310919 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2327  cupin 2 domain-containing protein  31.25 
 
 		 150 aa  52.8  0.000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000139899 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6634  cupin 2 domain-containing protein  25.93 
 
 		 189 aa  52.8  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.718615  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1207  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.25 
 
 		 152 aa  52  0.000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.830198  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2878  Cupin 2 conserved barrel domain-containing protein  29.67 
 
 		 161 aa  51.2  0.000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.505096  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0950  Cupin 2 conserved barrel domain protein  23.78 
 
 		 389 aa  50.8  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5299  hypothetical protein  33.73 
 
 		 166 aa  50.8  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148055  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5708  cupin 2 domain-containing protein  30.21 
 
 		 111 aa  50.8  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.203885  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0202  XRE family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 182 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.614203  hitchhiker  0.00167713 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0144  cupin 2 domain-containing protein  32.29 
 
 		 165 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1355  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.43 
 
 		 195 aa  50.1  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.646374  normal  0.0330672 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5062  hypothetical protein  25.51 
 
 		 157 aa  49.7  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.421326  normal  0.406339 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0943  XRE family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 182 aa  49.3  0.00004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3746  cupin 2 domain-containing protein  36.23 
 
 		 124 aa  49.3  0.00004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3997  cupin 2 domain-containing protein  29.35 
 
 		 148 aa  48.9  0.00005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.439431  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3440  cupin 2 domain-containing protein  40 
 
 		 167 aa  48.5  0.00006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3638  cupin 2 domain-containing protein  29.46 
 
 		 152 aa  48.5  0.00006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.588869  normal  0.0557412 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0970  XRE family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 182 aa  48.1  0.00008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0204  Cupin 2 conserved barrel domain protein  26.8 
 
 		 160 aa  48.1  0.00009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4882  hypothetical protein  29.09 
 
 		 145 aa  47.8  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.192272  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1228  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.07 
 
 		 135 aa  47.8  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.066401  normal  0.685252 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0747  cupin-like protein  27.27 
 
 		 169 aa  47.8  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.179804  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1923  Cupin 2 conserved barrel domain protein  23.53 
 
 		 145 aa  47.4  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0356258  normal  0.456316 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2685  hypothetical protein  26.53 
 
 		 152 aa  46.6  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.273941  normal  0.254874 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3020  polyketide synthesis domain protein  36.23 
 
 		 120 aa  47  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2629  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.67 
 
 		 138 aa  47.4  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1864  Cupin 2 conserved barrel domain protein  26.12 
 
 		 144 aa  47  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3067  cupin 2 domain-containing protein  26 
 
 		 145 aa  46.2  0.0003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3153  cupin 2 domain-containing protein  24.07 
 
 		 135 aa  46.6  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0056  mannose-1-phosphate guanylyltransferase/mannose-6-phosphate isomerase  21.12 
 
 		 467 aa  46.6  0.0003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.10784  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1104  cupin 2 domain-containing protein  29.35 
 
 		 182 aa  45.8  0.0004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.183758  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0248  XRE family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 182 aa  45.8  0.0004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1163  cupin 2 domain-containing protein  29.35 
 
 		 182 aa  45.8  0.0004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.967119  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1195  XRE family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 182 aa  45.8  0.0004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.152731  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0633  cupin 2 domain-containing protein  29.81 
 
 		 158 aa  45.8  0.0004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.643791  normal  0.229137 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1714  cupin 2 domain-containing protein  25.89 
 
 		 150 aa  45.8  0.0004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.259313 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3195  transcriptional regulator, XRE family  29.35 
 
 		 182 aa  45.8  0.0004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0639399 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1447  Cupin 2 conserved barrel domain protein  25.41 
 
 		 190 aa  45.8  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.901222  normal  0.428247 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2502  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.56 
 
 		 159 aa  45.8  0.0005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.529336 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3707  cupin 2, barrel  27.43 
 
 		 138 aa  45.4  0.0006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.52835  normal  0.602346 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2672  hypothetical protein  28.91 
 
 		 159 aa  45.1  0.0007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.311364  normal  0.391613 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0238  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  33.33 
 
 		 199 aa  45.1  0.0007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0595  cupin 2 domain-containing protein  31.73 
 
 		 165 aa  45.1  0.0007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.906672  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1721  XRE family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 201 aa  45.1  0.0007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2066  DNA-binding transcriptional repressor PuuR  27.96 
 
 		 185 aa  45.1  0.0007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5523  transcriptional regulator  32.98 
 
 		 182 aa  44.7  0.0008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.22086 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0604  cupin 2, barrel  28.57 
 
 		 165 aa  45.1  0.0008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.398371  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6233  Cupin 2 conserved barrel domain protein  26.67 
 
 		 163 aa  45.1  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.398434  normal  0.379299 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0617  cupin 2 domain-containing protein  28.57 
 
 		 165 aa  45.1  0.0008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.546436  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2908  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.56 
 
 		 159 aa  45.1  0.0008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1265  transcriptional regulator, putative  29.35 
 
 		 182 aa  44.7  0.0009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0105  DNA-binding protein  33.68 
 
 		 199 aa  44.7  0.0009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0760  cupin 2 domain-containing protein  31.91 
 
 		 178 aa  44.7  0.0009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.26011  normal  0.519438 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2699  hypothetical protein  34.78 
 
 		 120 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.615203  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2921  XRE family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 208 aa  44.3  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.899455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1091  XRE family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 182 aa  44.3  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.158888  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6075  putative transcriptional regulator  30.85 
 
 		 182 aa  44.3  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2982  polyketide synthesis domain protein  34.78 
 
 		 120 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>