146 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3787 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_3787  homogentisate 12-dioxygenase  100 
 
 		 407 aa  823    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07000  homogentisate 1,2-dioxygenase  73.05 
 
 		 399 aa  600  1e-170  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.126563 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1868  homogentisate 12-dioxygenase  70.78 
 
 		 402 aa  584  1.0000000000000001e-165  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.501601  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1107  homogentisate 12-dioxygenase  70.47 
 
 		 399 aa  579  1e-164  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.141602 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1918  homogentisate 12-dioxygenase  70.03 
 
 		 401 aa  573  1.0000000000000001e-162  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0204233  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0530  homogentisate 12-dioxygenase  66.42 
 
 		 406 aa  540  9.999999999999999e-153  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1684  homogentisate 12-dioxygenase  67.83 
 
 		 395 aa  541  9.999999999999999e-153  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18910  homogentisate 1,2-dioxygenase  66.08 
 
 		 406 aa  534  1e-150  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0108464  normal  0.652013 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0657  homogentisate 1,2-dioxygenase  66.5 
 
 		 404 aa  534  1e-150  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10650  homogentisate 1,2-dioxygenase  64.42 
 
 		 434 aa  525  1e-148  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.233818  normal  0.424884 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6468  homogentisate 12-dioxygenase  61.62 
 
 		 394 aa  501  1e-141  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.213717 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4688  homogentisate 12-dioxygenase  64.48 
 
 		 388 aa  495  1e-139  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.378892  normal  0.704415 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4258  homogentisate 1,2-dioxygenase  64.23 
 
 		 388 aa  490  1e-137  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0597877 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0088  homogentisate 12-dioxygenase  62.03 
 
 		 400 aa  488  1e-136  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8845  homogentisate 1,2-dioxygenase, putative  61.04 
 
 		 389 aa  479  1e-134  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.57227 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0709  homogentisate 12-dioxygenase  56.97 
 
 		 397 aa  446  1.0000000000000001e-124  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0812  homogentisate 12-dioxygenase  54.66 
 
 		 393 aa  417  9.999999999999999e-116  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2762  homogentisate 12-dioxygenase  48.26 
 
 		 385 aa  366  1e-100  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000862823  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5068  putative homogentisate 1,2-dioxygenase  45.14 
 
 		 390 aa  355  1e-96  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00282868  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0230  homogentisate 12-dioxygenase  45.45 
 
 		 390 aa  354  1e-96  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0217  homogentisate 1,2-dioxygenase  45.14 
 
 		 390 aa  354  2e-96  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0262  homogentisate 1,2-dioxygenase, putative  45.71 
 
 		 390 aa  353  2.9999999999999997e-96  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00729386  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0215  homogentisate 1,2-dioxygenase  45.71 
 
 		 390 aa  353  2.9999999999999997e-96  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0276  putative homogentisate 1,2-dioxygenase  45.71 
 
 		 390 aa  353  2.9999999999999997e-96  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000242533  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0257  putative homogentisate 1,2-dioxygenase  44.89 
 
 		 392 aa  353  2.9999999999999997e-96  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000636938  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0228  homogentisate 1,2-dioxygenase  45.14 
 
 		 390 aa  353  4e-96  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0242  homogentisate 1,2-dioxygenase  45.14 
 
 		 390 aa  353  4e-96  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0255  putative homogentisate 1,2-dioxygenase  45.71 
 
 		 390 aa  353  4e-96  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0221  homogentisate 12-dioxygenase  45.45 
 
 		 390 aa  351  1e-95  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5427  homogentisate 12-dioxygenase  46.04 
 
 		 385 aa  350  3e-95  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0911564  normal  0.337883 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3280  homogentisate 12-dioxygenase  45.5 
 
 		 385 aa  340  4e-92  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.524985 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3805  homogentisate 12-dioxygenase  47.75 
 
 		 388 aa  332  8e-90  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00200515  normal  0.427722 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02595  homogentisate 1,2-dioxygenase  43.21 
 
 		 386 aa  313  4.999999999999999e-84  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2106  homogentisate 12-dioxygenase  44.75 
 
 		 385 aa  309  6.999999999999999e-83  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0415029  normal  0.565208 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6321  homogentisate 12-dioxygenase  42.48 
 
 		 396 aa  302  6.000000000000001e-81  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0728  homogentisate 1,2-dioxygenase  40.45 
 
 		 385 aa  299  8e-80  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2154  homogentisate 1,2-dioxygenase  39.85 
 
 		 386 aa  298  2e-79  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.634063 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2291  homogentisate 1,2-dioxygenase  41.1 
 
 		 386 aa  296  4e-79  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000437513  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2363  homogentisate 1,2-dioxygenase  41.75 
 
 		 386 aa  296  6e-79  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.445339  normal  0.275941 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1732  homogentisate 12-dioxygenase  40.35 
 
 		 386 aa  295  8e-79  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00561061 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1671  homogentisate 1,2-dioxygenase  40.35 
 
 		 386 aa  295  1e-78  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.991879  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2615  homogentisate 12-dioxygenase  40.35 
 
 		 386 aa  293  3e-78  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0308121  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2481  homogentisate 1,2-dioxygenase  40.85 
 
 		 386 aa  293  5e-78  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.59318  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2653  homogentisate 12-dioxygenase  40.1 
 
 		 386 aa  292  6e-78  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.51516  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2728  homogentisate 12-dioxygenase  40.1 
 
 		 386 aa  292  6e-78  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.315515  normal  0.247333 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1963  hypothetical protein  41.25 
 
 		 386 aa  292  8e-78  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2326  homogentisate 1,2-dioxygenase  38.75 
 
 		 386 aa  291  2e-77  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2162  homogentisate 1,2-dioxygenase  40.25 
 
 		 386 aa  290  3e-77  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1569  homogentisate 1,2-dioxygenase  40.1 
 
 		 386 aa  287  2e-76  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1874  homogentisate 12-dioxygenase  39.7 
 
 		 386 aa  286  5e-76  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2369  homogentisate 12-dioxygenase  38.9 
 
 		 384 aa  277  2e-73  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3504  homogentisate 12-dioxygenase  40.86 
 
 		 385 aa  250  3e-65  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.142046  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3572  homogentisate 12-dioxygenase  40.61 
 
 		 385 aa  249  6e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3423  homogentisate 1,2-dioxygenase  40.86 
 
 		 385 aa  249  9e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00233011  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3485  homogentisate 12-dioxygenase  41.27 
 
 		 385 aa  242  7.999999999999999e-63  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.306053  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6552  homogentisate 12-dioxygenase  38.58 
 
 		 389 aa  232  8.000000000000001e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0724494  normal  0.194858 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0961  putative oxidoreductase  31.35 
 
 		 378 aa  159  1e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02178  hypothetical protein  34.42 
 
 		 376 aa  156  8e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003654  homogentisate 1,2-dioxygenase  35.07 
 
 		 364 aa  154  2e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1438  homogentisate 1,2-dioxygenase  32.82 
 
 		 372 aa  154  2.9999999999999998e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1697  homogentisate 1,2-dioxygenase  32.23 
 
 		 379 aa  152  1e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.196029 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1897  homogentisate 1,2-dioxygenase  30.48 
 
 		 363 aa  124  3e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0957  homogentisate 12-dioxygenase  31.94 
 
 		 373 aa  124  4e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.490105  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4463  homogentisate 1,2-dioxygenase  29.3 
 
 		 367 aa  112  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.100375 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1591  homogentisate 1,2-dioxygenase  27.42 
 
 		 368 aa  106  8e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1615  homogentisate 1,2-dioxygenase  27.42 
 
 		 368 aa  106  8e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.904651 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1561  homogentisate 1,2-dioxygenase  27.61 
 
 		 368 aa  105  2e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3652  homogentisate 1,2-dioxygenase  27.2 
 
 		 427 aa  76.3  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.207248 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1025  homogentisate 1,2-dioxygenase  26.03 
 
 		 429 aa  73.6  0.000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.243336  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01897  Homogentisate 1,2-dioxygenase (EC 1.13.11.5)(Homogentisic acid oxidase)(Homogentisate oxygenase)(Homogentisicase) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q00667]  25.06 
 
 		 448 aa  72.4  0.00000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0566  homogentisate 1,2-dioxygenase  28.72 
 
 		 449 aa  69.7  0.00000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.11982  normal  0.485064 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2833  homogentisate 1,2-dioxygenase  27.49 
 
 		 453 aa  69.7  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.385298  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0289  homogentisate 1,2-dioxygenase  25.12 
 
 		 437 aa  68.2  0.0000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.36661  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3333  homogentisate 1,2-dioxygenase  26.24 
 
 		 455 aa  68.2  0.0000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0921  homogentisate 1,2-dioxygenase  27.12 
 
 		 448 aa  67.4  0.0000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2456  homogentisate 1,2-dioxygenase  26.81 
 
 		 452 aa  67.4  0.0000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3864  homogentisate 1,2-dioxygenase  26.38 
 
 		 442 aa  67  0.0000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.412305  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1018  homogentisate 1,2-dioxygenase  27.55 
 
 		 448 aa  66.2  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.266165 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1193  homogentisate 1,2-dioxygenase  26.36 
 
 		 453 aa  64.7  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.814651  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0817  homogentisate 1,2-dioxygenase  26.49 
 
 		 433 aa  64.3  0.000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.633132  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2532  homogentisate 1,2-dioxygenase  25.55 
 
 		 453 aa  64.3  0.000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0891  homogentisate 1,2-dioxygenase  26.47 
 
 		 448 aa  63.5  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.669112  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0907  homogentisate 1,2-dioxygenase  27.21 
 
 		 448 aa  62.8  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.78575  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0994  homogentisate 1,2-dioxygenase  24.82 
 
 		 454 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5153  homogentisate 1,2-dioxygenase  27.95 
 
 		 448 aa  62.8  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.424959  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02539  homogentisate 1,2-dioxygenase  26.3 
 
 		 454 aa  61.6  0.00000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000365945  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1407  homogentisate 1,2-dioxygenase  25.59 
 
 		 453 aa  61.6  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.818209 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1511  homogentisate 1,2-dioxygenase  26.16 
 
 		 453 aa  60.8  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.000621512  normal  0.470006 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4302  homogentisate 1,2-dioxygenase  25.41 
 
 		 443 aa  60.5  0.00000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4621  homogentisate 1,2-dioxygenase  25.31 
 
 		 433 aa  59.7  0.00000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.356023  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1043  homogentisate 1,2-dioxygenase  25.78 
 
 		 450 aa  59.7  0.00000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2997  homogentisate 1,2-dioxygenase  26.77 
 
 		 434 aa  59.3  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.45322 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3551  homogentisate 1,2-dioxygenase  24.6 
 
 		 434 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.518718  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4481  homogentisate 1,2-dioxygenase  25.06 
 
 		 433 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.518935  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4605  homogentisate 1,2-dioxygenase  24.81 
 
 		 433 aa  57.8  0.0000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0198539  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1557  homogentisate 1,2-dioxygenase  25.33 
 
 		 438 aa  56.6  0.0000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.474294 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15350  homogentisate 1,2-dioxygenase  25 
 
 		 461 aa  55.8  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2738  homogentisate 1,2-dioxygenase  26.52 
 
 		 441 aa  55.8  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00477  conserved hypothetical protein  25.62 
 
 		 458 aa  55.1  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.727152  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3326  homogentisate 1,2-dioxygenase  24.6 
 
 		 434 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0214185 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>