144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_0566 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_0907  homogentisate 1,2-dioxygenase  83.26 
 
 		 448 aa  787    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.78575  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0891  homogentisate 1,2-dioxygenase  83.48 
 
 		 448 aa  794    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.669112  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1018  homogentisate 1,2-dioxygenase  84.6 
 
 		 448 aa  805    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.266165 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0921  homogentisate 1,2-dioxygenase  83.04 
 
 		 448 aa  798    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5153  homogentisate 1,2-dioxygenase  84.6 
 
 		 448 aa  809    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.424959  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2456  homogentisate 1,2-dioxygenase  71.59 
 
 		 452 aa  688    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1043  homogentisate 1,2-dioxygenase  70 
 
 		 450 aa  659    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0566  homogentisate 1,2-dioxygenase  100 
 
 		 449 aa  938    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.11982  normal  0.485064 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1193  homogentisate 1,2-dioxygenase  71.85 
 
 		 453 aa  666    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.814651  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3333  homogentisate 1,2-dioxygenase  73.29 
 
 		 455 aa  668    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2532  homogentisate 1,2-dioxygenase  70.41 
 
 		 453 aa  639    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1407  homogentisate 1,2-dioxygenase  69.07 
 
 		 453 aa  633  1e-180  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.818209 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2833  homogentisate 1,2-dioxygenase  67.79 
 
 		 453 aa  631  1e-180  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.385298  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1511  homogentisate 1,2-dioxygenase  66.82 
 
 		 453 aa  629  1e-179  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.000621512  normal  0.470006 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0913  homogentisate 1,2-dioxygenase  63.98 
 
 		 453 aa  611  9.999999999999999e-175  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.994604  normal  0.237981 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3547  homogentisate 1,2-dioxygenase  63.98 
 
 		 453 aa  611  9.999999999999999e-175  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.294103 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2621  homogentisate 1,2-dioxygenase  64.65 
 
 		 451 aa  594  1e-168  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.783486 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1439  homogentisate 1,2-dioxygenase  63.64 
 
 		 460 aa  582  1.0000000000000001e-165  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3812  homogentisate 1,2-dioxygenase  63.09 
 
 		 451 aa  584  1.0000000000000001e-165  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.283332  normal  0.618849 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2005  homogentisate 1,2-dioxygenase  60.76 
 
 		 429 aa  531  1e-149  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.436695  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0701  homogentisate 1,2-dioxygenase  58.05 
 
 		 444 aa  519  1e-146  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3652  homogentisate 1,2-dioxygenase  60.81 
 
 		 427 aa  521  1e-146  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.207248 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2336  homogentisate 1,2-dioxygenase  58.39 
 
 		 430 aa  520  1e-146  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.829883  normal  0.673279 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4374  homogentisate 1,2-dioxygenase  58.77 
 
 		 442 aa  517  1.0000000000000001e-145  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000328355  normal  0.761675 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0337  homogentisate 1,2-dioxygenase  57.73 
 
 		 444 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0820  homogentisate 1,2-dioxygenase  57.73 
 
 		 444 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.623719  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0718  homogentisate 1,2-dioxygenase  57.73 
 
 		 444 aa  515  1.0000000000000001e-145  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.10992  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3913  homogentisate 1,2-dioxygenase  57.5 
 
 		 444 aa  513  1e-144  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2563  homogentisate 1,2-dioxygenase  57.5 
 
 		 444 aa  514  1e-144  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0789  homogentisate 1,2-dioxygenase  57.5 
 
 		 444 aa  511  1e-144  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.211762  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0780  homogentisate 1,2-dioxygenase  56.04 
 
 		 448 aa  511  1e-144  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.90704  normal  0.708148 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3923  homogentisate 1,2-dioxygenase  58.18 
 
 		 468 aa  508  1e-143  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3900  homogentisate 1,2-dioxygenase  55.82 
 
 		 448 aa  509  1e-143  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.187148 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3462  homogentisate 1,2-dioxygenase  58.33 
 
 		 448 aa  510  1e-143  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.311936  normal  0.0988393 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4534  homogentisate 1,2-dioxygenase  58.33 
 
 		 448 aa  510  1e-143  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.233345  normal  0.576048 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02539  homogentisate 1,2-dioxygenase  57.48 
 
 		 454 aa  504  9.999999999999999e-143  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000365945  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2435  homogentisate 1,2-dioxygenase  56.85 
 
 		 440 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.125362  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0691  homogentisate 1,2-dioxygenase  57.91 
 
 		 448 aa  502  1e-141  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.398963 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2056  homogentisate 1,2-dioxygenase  57.37 
 
 		 450 aa  503  1e-141  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3228  homogentisate 1,2-dioxygenase  57.37 
 
 		 450 aa  503  1e-141  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1397  homogentisate 1,2-dioxygenase  57.37 
 
 		 450 aa  502  1e-141  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.762264  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0856  homogentisate 1,2-dioxygenase  57.37 
 
 		 450 aa  503  1e-141  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.789962  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2688  homogentisate 1,2-dioxygenase  57.37 
 
 		 450 aa  503  1e-141  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.515143  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3174  homogentisate 1,2-dioxygenase  57.37 
 
 		 444 aa  503  1e-141  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.666135  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3213  homogentisate 1,2-dioxygenase  57.37 
 
 		 450 aa  503  1e-141  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1921  homogentisate 1,2-dioxygenase  57.37 
 
 		 450 aa  503  1e-141  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.884358  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3738  homogentisate 1,2-dioxygenase  57.41 
 
 		 432 aa  498  1e-140  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.333429  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2997  homogentisate 1,2-dioxygenase  55.61 
 
 		 434 aa  495  1e-139  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.45322 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04215  homogentisate 1,2-dioxygenase  56.31 
 
 		 441 aa  495  1e-139  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0289  homogentisate 1,2-dioxygenase  55.48 
 
 		 437 aa  496  1e-139  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.36661  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2725  homogentisate 1,2-dioxygenase  56.78 
 
 		 431 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00241736  normal  0.0920445 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0876  homogentisate 1,2-dioxygenase  56.78 
 
 		 443 aa  494  9.999999999999999e-139  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0480084  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3864  homogentisate 1,2-dioxygenase  56.61 
 
 		 442 aa  493  9.999999999999999e-139  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.412305  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0994  homogentisate 1,2-dioxygenase  55.37 
 
 		 454 aa  488  1e-136  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38510  homogentisate 1,2-dioxygenase  55.35 
 
 		 432 aa  474  1e-132  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00419964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3280  homogentisate 1,2-dioxygenase  55.12 
 
 		 432 aa  473  1e-132  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.645052  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15350  homogentisate 1,2-dioxygenase  53.48 
 
 		 461 aa  472  1e-132  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0817  homogentisate 1,2-dioxygenase  53.02 
 
 		 433 aa  468  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.633132  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3551  homogentisate 1,2-dioxygenase  53.99 
 
 		 434 aa  468  9.999999999999999e-131  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.518718  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0910  homogentisate 1,2-dioxygenase  54.44 
 
 		 431 aa  468  9.999999999999999e-131  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1557  homogentisate 1,2-dioxygenase  54.34 
 
 		 438 aa  467  9.999999999999999e-131  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.474294 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4605  homogentisate 1,2-dioxygenase  53.02 
 
 		 433 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0198539  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4621  homogentisate 1,2-dioxygenase  53.01 
 
 		 433 aa  464  1e-129  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.356023  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3326  homogentisate 1,2-dioxygenase  52.14 
 
 		 434 aa  462  1e-129  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0214185 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4481  homogentisate 1,2-dioxygenase  53.01 
 
 		 433 aa  463  1e-129  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.518935  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4302  homogentisate 1,2-dioxygenase  53.32 
 
 		 443 aa  453  1.0000000000000001e-126  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2738  homogentisate 1,2-dioxygenase  52.84 
 
 		 441 aa  440  9.999999999999999e-123  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01897  Homogentisate 1,2-dioxygenase (EC 1.13.11.5)(Homogentisic acid oxidase)(Homogentisate oxygenase)(Homogentisicase) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q00667]  50.11 
 
 		 448 aa  426  1e-118  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1025  homogentisate 1,2-dioxygenase  49.4 
 
 		 429 aa  424  1e-117  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.243336  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1248  homogentisate 1,2-dioxygenase  48.47 
 
 		 416 aa  409  1e-113  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1248  homogentisate 1,2-dioxygenase  48.71 
 
 		 416 aa  410  1e-113  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06390  homogentisate 1,2-dioxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G10810)  46.44 
 
 		 462 aa  389  1e-107  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.224544  normal  1 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49112  predicted protein  46.04 
 
 		 494 aa  370  1e-101  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00796178  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5825  homogentisate 1,2-dioxygenase  43.61 
 
 		 848 aa  343  5e-93  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0876183  normal  0.90273 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00477  conserved hypothetical protein  41.73 
 
 		 458 aa  310  2e-83  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.727152  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04012  conserved hypothetical protein  38.52 
 
 		 533 aa  257  3e-67  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.383665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02178  hypothetical protein  27.41 
 
 		 376 aa  84.3  0.000000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003654  homogentisate 1,2-dioxygenase  27.41 
 
 		 364 aa  83.2  0.00000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0961  putative oxidoreductase  25.98 
 
 		 378 aa  81.3  0.00000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1697  homogentisate 1,2-dioxygenase  25.38 
 
 		 379 aa  80.1  0.00000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.196029 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1438  homogentisate 1,2-dioxygenase  25.65 
 
 		 372 aa  79  0.0000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0217  homogentisate 1,2-dioxygenase  28.62 
 
 		 390 aa  77.4  0.0000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2762  homogentisate 12-dioxygenase  25.35 
 
 		 385 aa  77.4  0.0000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000862823  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0228  homogentisate 1,2-dioxygenase  28.67 
 
 		 390 aa  76.6  0.0000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0242  homogentisate 1,2-dioxygenase  28.67 
 
 		 390 aa  76.6  0.0000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0215  homogentisate 1,2-dioxygenase  28.67 
 
 		 390 aa  76.6  0.0000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0257  putative homogentisate 1,2-dioxygenase  28.33 
 
 		 392 aa  76.6  0.0000000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000636938  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0255  putative homogentisate 1,2-dioxygenase  28.62 
 
 		 390 aa  76.6  0.0000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5068  putative homogentisate 1,2-dioxygenase  27.56 
 
 		 390 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00282868  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0276  putative homogentisate 1,2-dioxygenase  28.27 
 
 		 390 aa  76.3  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000242533  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0221  homogentisate 12-dioxygenase  28.27 
 
 		 390 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0262  homogentisate 1,2-dioxygenase, putative  27.92 
 
 		 390 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00729386  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2369  homogentisate 12-dioxygenase  23.26 
 
 		 384 aa  74.7  0.000000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0230  homogentisate 12-dioxygenase  27.4 
 
 		 390 aa  74.7  0.000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5427  homogentisate 12-dioxygenase  24.12 
 
 		 385 aa  74.7  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0911564  normal  0.337883 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0728  homogentisate 1,2-dioxygenase  25.16 
 
 		 385 aa  72.4  0.00000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6552  homogentisate 12-dioxygenase  26.22 
 
 		 389 aa  71.2  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0724494  normal  0.194858 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02595  homogentisate 1,2-dioxygenase  24.13 
 
 		 386 aa  70.5  0.00000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3805  homogentisate 12-dioxygenase  28.47 
 
 		 388 aa  69.3  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00200515  normal  0.427722 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6321  homogentisate 12-dioxygenase  26.16 
 
 		 396 aa  68.6  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>