144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BAS0228 on replicon NC_005945
Organism: Bacillus anthracis str. Sterne



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003909  BCE_0262  homogentisate 1,2-dioxygenase, putative  98.97 
 
 
390 aa  803    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00729386  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0228  homogentisate 1,2-dioxygenase  100 
 
 
390 aa  807    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0215  homogentisate 1,2-dioxygenase  99.74 
 
 
390 aa  806    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0217  homogentisate 1,2-dioxygenase  99.23 
 
 
390 aa  802    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0242  homogentisate 1,2-dioxygenase  100 
 
 
390 aa  807    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0257  putative homogentisate 1,2-dioxygenase  97.95 
 
 
392 aa  797    Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000636938  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5068  putative homogentisate 1,2-dioxygenase  97.95 
 
 
390 aa  798    Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00282868  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0276  putative homogentisate 1,2-dioxygenase  99.23 
 
 
390 aa  803    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000242533  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0255  putative homogentisate 1,2-dioxygenase  99.49 
 
 
390 aa  803    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0230  homogentisate 12-dioxygenase  92.82 
 
 
390 aa  763    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0221  homogentisate 12-dioxygenase  97.69 
 
 
390 aa  796    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2762  homogentisate 12-dioxygenase  64.57 
 
 
385 aa  525  1e-148  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000862823  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3805  homogentisate 12-dioxygenase  61.05 
 
 
388 aa  491  9.999999999999999e-139  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00200515  normal  0.427722 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5427  homogentisate 12-dioxygenase  54.97 
 
 
385 aa  448  1e-125  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0911564  normal  0.337883 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3280  homogentisate 12-dioxygenase  54.71 
 
 
385 aa  432  1e-120  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.524985 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2106  homogentisate 12-dioxygenase  53.4 
 
 
385 aa  428  1e-118  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0415029  normal  0.565208 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0728  homogentisate 1,2-dioxygenase  52.74 
 
 
385 aa  424  1e-117  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02595  homogentisate 1,2-dioxygenase  51.7 
 
 
386 aa  418  1e-116  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6321  homogentisate 12-dioxygenase  52.16 
 
 
396 aa  420  1e-116  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6468  homogentisate 12-dioxygenase  51.03 
 
 
394 aa  391  1e-107  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.213717 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2154  homogentisate 1,2-dioxygenase  47.66 
 
 
386 aa  385  1e-106  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.634063 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2162  homogentisate 1,2-dioxygenase  46.77 
 
 
386 aa  382  1e-105  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0088  homogentisate 12-dioxygenase  47.24 
 
 
400 aa  381  1e-105  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2326  homogentisate 1,2-dioxygenase  47.41 
 
 
386 aa  380  1e-104  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4258  homogentisate 1,2-dioxygenase  49.23 
 
 
388 aa  379  1e-104  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0597877 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4688  homogentisate 12-dioxygenase  49.74 
 
 
388 aa  379  1e-104  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.378892  normal  0.704415 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1684  homogentisate 12-dioxygenase  49.24 
 
 
395 aa  378  1e-103  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2615  homogentisate 12-dioxygenase  46.77 
 
 
386 aa  376  1e-103  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0308121  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1671  homogentisate 1,2-dioxygenase  46.77 
 
 
386 aa  377  1e-103  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.991879  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2653  homogentisate 12-dioxygenase  47.03 
 
 
386 aa  378  1e-103  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.51516  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1874  homogentisate 12-dioxygenase  47.53 
 
 
386 aa  375  1e-103  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2728  homogentisate 12-dioxygenase  47.03 
 
 
386 aa  377  1e-103  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.315515  normal  0.247333 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1732  homogentisate 12-dioxygenase  46.77 
 
 
386 aa  377  1e-103  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00561061 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8845  homogentisate 1,2-dioxygenase, putative  47.16 
 
 
389 aa  375  1e-103  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.57227 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2291  homogentisate 1,2-dioxygenase  46.63 
 
 
386 aa  371  1e-101  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000437513  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2363  homogentisate 1,2-dioxygenase  46.11 
 
 
386 aa  370  1e-101  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.445339  normal  0.275941 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1868  homogentisate 12-dioxygenase  47.62 
 
 
402 aa  366  1e-100  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.501601  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1918  homogentisate 12-dioxygenase  47.12 
 
 
401 aa  367  1e-100  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0204233  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2481  homogentisate 1,2-dioxygenase  45.85 
 
 
386 aa  365  1e-100  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.59318  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0657  homogentisate 1,2-dioxygenase  46.68 
 
 
404 aa  366  1e-100  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0530  homogentisate 12-dioxygenase  47.28 
 
 
406 aa  366  1e-100  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1569  homogentisate 1,2-dioxygenase  45.48 
 
 
386 aa  363  2e-99  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1963  hypothetical protein  45.43 
 
 
386 aa  363  3e-99  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0709  homogentisate 12-dioxygenase  46.17 
 
 
397 aa  361  1e-98  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18910  homogentisate 1,2-dioxygenase  47.84 
 
 
406 aa  360  2e-98  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0108464  normal  0.652013 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0812  homogentisate 12-dioxygenase  46.53 
 
 
393 aa  359  5e-98  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07000  homogentisate 1,2-dioxygenase  45.96 
 
 
399 aa  358  9e-98  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.126563 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1107  homogentisate 12-dioxygenase  45.32 
 
 
399 aa  353  2e-96  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.141602 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10650  homogentisate 1,2-dioxygenase  44.01 
 
 
434 aa  350  3e-95  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.233818  normal  0.424884 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3787  homogentisate 12-dioxygenase  45.41 
 
 
407 aa  345  7e-94  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2369  homogentisate 12-dioxygenase  42.19 
 
 
384 aa  313  2.9999999999999996e-84  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6552  homogentisate 12-dioxygenase  39.95 
 
 
389 aa  303  4.0000000000000003e-81  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0724494  normal  0.194858 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3423  homogentisate 1,2-dioxygenase  41.01 
 
 
385 aa  298  1e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00233011  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3572  homogentisate 12-dioxygenase  41.01 
 
 
385 aa  297  2e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3504  homogentisate 12-dioxygenase  41.01 
 
 
385 aa  297  2e-79  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.142046  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3485  homogentisate 12-dioxygenase  39.84 
 
 
385 aa  293  2e-78  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.306053  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02178  hypothetical protein  32.57 
 
 
376 aa  187  2e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1697  homogentisate 1,2-dioxygenase  33.97 
 
 
379 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.196029 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003654  homogentisate 1,2-dioxygenase  34.9 
 
 
364 aa  184  3e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1438  homogentisate 1,2-dioxygenase  32.99 
 
 
372 aa  178  1e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0961  putative oxidoreductase  34.8 
 
 
378 aa  179  1e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1897  homogentisate 1,2-dioxygenase  29.12 
 
 
363 aa  137  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4463  homogentisate 1,2-dioxygenase  29.94 
 
 
367 aa  136  8e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.100375 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0957  homogentisate 12-dioxygenase  30.93 
 
 
373 aa  134  3.9999999999999996e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.490105  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1591  homogentisate 1,2-dioxygenase  28.7 
 
 
368 aa  125  1e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1615  homogentisate 1,2-dioxygenase  28.7 
 
 
368 aa  125  1e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.904651 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1561  homogentisate 1,2-dioxygenase  28.7 
 
 
368 aa  124  2e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0566  homogentisate 1,2-dioxygenase  28.67 
 
 
449 aa  76.6  0.0000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.11982  normal  0.485064 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0921  homogentisate 1,2-dioxygenase  29.28 
 
 
448 aa  76.6  0.0000000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3333  homogentisate 1,2-dioxygenase  26.04 
 
 
455 aa  75.1  0.000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1025  homogentisate 1,2-dioxygenase  24.32 
 
 
429 aa  73.2  0.000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.243336  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06390  homogentisate 1,2-dioxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G10810)  24.58 
 
 
462 aa  71.2  0.00000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.224544  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3462  homogentisate 1,2-dioxygenase  23.91 
 
 
448 aa  70.5  0.00000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.311936  normal  0.0988393 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1193  homogentisate 1,2-dioxygenase  26.57 
 
 
453 aa  70.5  0.00000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.814651  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4534  homogentisate 1,2-dioxygenase  23.91 
 
 
448 aa  70.5  0.00000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.233345  normal  0.576048 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1018  homogentisate 1,2-dioxygenase  26.99 
 
 
448 aa  70.1  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.266165 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2833  homogentisate 1,2-dioxygenase  25.09 
 
 
453 aa  69.7  0.00000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.385298  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1043  homogentisate 1,2-dioxygenase  26.13 
 
 
450 aa  69.7  0.00000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0907  homogentisate 1,2-dioxygenase  26.33 
 
 
448 aa  68.9  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.78575  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3913  homogentisate 1,2-dioxygenase  25.47 
 
 
444 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2456  homogentisate 1,2-dioxygenase  28.57 
 
 
452 aa  67.8  0.0000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1511  homogentisate 1,2-dioxygenase  25.17 
 
 
453 aa  67.4  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.000621512  normal  0.470006 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4374  homogentisate 1,2-dioxygenase  25 
 
 
442 aa  67.4  0.0000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000328355  normal  0.761675 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2435  homogentisate 1,2-dioxygenase  25.13 
 
 
440 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.125362  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1407  homogentisate 1,2-dioxygenase  24.75 
 
 
453 aa  67.4  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.818209 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0891  homogentisate 1,2-dioxygenase  26.12 
 
 
448 aa  66.6  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.669112  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0994  homogentisate 1,2-dioxygenase  23.32 
 
 
454 aa  66.2  0.0000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3738  homogentisate 1,2-dioxygenase  25.18 
 
 
432 aa  66.2  0.000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.333429  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02539  homogentisate 1,2-dioxygenase  25.25 
 
 
454 aa  65.9  0.000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000365945  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0691  homogentisate 1,2-dioxygenase  25.84 
 
 
448 aa  65.5  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.398963 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1557  homogentisate 1,2-dioxygenase  24.29 
 
 
438 aa  65.9  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.474294 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3900  homogentisate 1,2-dioxygenase  25.47 
 
 
448 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.187148 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0337  homogentisate 1,2-dioxygenase  25.09 
 
 
444 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0820  homogentisate 1,2-dioxygenase  25.09 
 
 
444 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.623719  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0913  homogentisate 1,2-dioxygenase  25.25 
 
 
453 aa  65.1  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.994604  normal  0.237981 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3547  homogentisate 1,2-dioxygenase  25.25 
 
 
453 aa  65.1  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.294103 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0789  homogentisate 1,2-dioxygenase  24.82 
 
 
444 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.211762  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2532  homogentisate 1,2-dioxygenase  26.39 
 
 
453 aa  65.5  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5153  homogentisate 1,2-dioxygenase  25.95 
 
 
448 aa  64.3  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.424959  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3923  homogentisate 1,2-dioxygenase  25.32 
 
 
468 aa  64.7  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>