144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_3652 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_3652  homogentisate 1,2-dioxygenase  100 
 
 		 427 aa  877    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.207248 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3864  homogentisate 1,2-dioxygenase  70.63 
 
 		 442 aa  618  1e-176  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.412305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2005  homogentisate 1,2-dioxygenase  67.69 
 
 		 429 aa  601  1.0000000000000001e-171  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.436695  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3738  homogentisate 1,2-dioxygenase  66.59 
 
 		 432 aa  572  1.0000000000000001e-162  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.333429  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3923  homogentisate 1,2-dioxygenase  65.56 
 
 		 468 aa  570  1e-161  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3462  homogentisate 1,2-dioxygenase  66.27 
 
 		 448 aa  571  1e-161  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.311936  normal  0.0988393 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4534  homogentisate 1,2-dioxygenase  66.27 
 
 		 448 aa  571  1e-161  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.233345  normal  0.576048 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0691  homogentisate 1,2-dioxygenase  65.56 
 
 		 448 aa  564  1e-160  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.398963 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0337  homogentisate 1,2-dioxygenase  66.82 
 
 		 444 aa  565  1e-160  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38510  homogentisate 1,2-dioxygenase  65.64 
 
 		 432 aa  567  1e-160  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00419964  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0820  homogentisate 1,2-dioxygenase  66.82 
 
 		 444 aa  565  1e-160  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.623719  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3280  homogentisate 1,2-dioxygenase  65.64 
 
 		 432 aa  566  1e-160  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.645052  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3913  homogentisate 1,2-dioxygenase  66.35 
 
 		 444 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2725  homogentisate 1,2-dioxygenase  64.94 
 
 		 431 aa  561  1.0000000000000001e-159  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00241736  normal  0.0920445 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04215  homogentisate 1,2-dioxygenase  65.72 
 
 		 441 aa  562  1.0000000000000001e-159  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0789  homogentisate 1,2-dioxygenase  66.59 
 
 		 444 aa  561  1.0000000000000001e-159  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.211762  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0910  homogentisate 1,2-dioxygenase  64.61 
 
 		 431 aa  560  1e-158  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0701  homogentisate 1,2-dioxygenase  65.41 
 
 		 444 aa  555  1e-157  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0876  homogentisate 1,2-dioxygenase  65.01 
 
 		 443 aa  557  1e-157  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0480084  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0718  homogentisate 1,2-dioxygenase  65.65 
 
 		 444 aa  556  1e-157  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.10992  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3900  homogentisate 1,2-dioxygenase  64.93 
 
 		 448 aa  553  1e-156  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.187148 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4374  homogentisate 1,2-dioxygenase  64.22 
 
 		 442 aa  553  1e-156  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000328355  normal  0.761675 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2563  homogentisate 1,2-dioxygenase  64.94 
 
 		 444 aa  554  1e-156  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2435  homogentisate 1,2-dioxygenase  64.69 
 
 		 440 aa  553  1e-156  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.125362  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0780  homogentisate 1,2-dioxygenase  64.69 
 
 		 448 aa  551  1e-155  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.90704  normal  0.708148 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4621  homogentisate 1,2-dioxygenase  63.29 
 
 		 433 aa  544  1e-154  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.356023  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2056  homogentisate 1,2-dioxygenase  64.47 
 
 		 450 aa  547  1e-154  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3228  homogentisate 1,2-dioxygenase  64.47 
 
 		 450 aa  547  1e-154  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1397  homogentisate 1,2-dioxygenase  64.71 
 
 		 450 aa  547  1e-154  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.762264  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0856  homogentisate 1,2-dioxygenase  64.47 
 
 		 450 aa  547  1e-154  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.789962  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2688  homogentisate 1,2-dioxygenase  64.47 
 
 		 450 aa  547  1e-154  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.515143  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3174  homogentisate 1,2-dioxygenase  64.47 
 
 		 444 aa  546  1e-154  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.666135  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3213  homogentisate 1,2-dioxygenase  64.47 
 
 		 450 aa  547  1e-154  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1921  homogentisate 1,2-dioxygenase  64.47 
 
 		 450 aa  547  1e-154  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.884358  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0817  homogentisate 1,2-dioxygenase  62.88 
 
 		 433 aa  546  1e-154  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.633132  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3551  homogentisate 1,2-dioxygenase  62.03 
 
 		 434 aa  543  1e-153  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.518718  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4605  homogentisate 1,2-dioxygenase  63.12 
 
 		 433 aa  544  1e-153  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0198539  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3326  homogentisate 1,2-dioxygenase  61.85 
 
 		 434 aa  540  9.999999999999999e-153  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0214185 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2997  homogentisate 1,2-dioxygenase  61.7 
 
 		 434 aa  540  9.999999999999999e-153  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.45322 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4481  homogentisate 1,2-dioxygenase  63.29 
 
 		 433 aa  539  9.999999999999999e-153  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.518935  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15350  homogentisate 1,2-dioxygenase  62.38 
 
 		 461 aa  532  1e-150  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0891  homogentisate 1,2-dioxygenase  62.23 
 
 		 448 aa  527  1e-148  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.669112  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0921  homogentisate 1,2-dioxygenase  61.52 
 
 		 448 aa  526  1e-148  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2336  homogentisate 1,2-dioxygenase  58.96 
 
 		 430 aa  526  1e-148  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.829883  normal  0.673279 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0907  homogentisate 1,2-dioxygenase  61.52 
 
 		 448 aa  521  1e-147  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.78575  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0994  homogentisate 1,2-dioxygenase  58.63 
 
 		 454 aa  523  1e-147  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0289  homogentisate 1,2-dioxygenase  61.28 
 
 		 437 aa  524  1e-147  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.36661  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1018  homogentisate 1,2-dioxygenase  61.76 
 
 		 448 aa  520  1e-146  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.266165 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0566  homogentisate 1,2-dioxygenase  60.81 
 
 		 449 aa  521  1e-146  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.11982  normal  0.485064 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1193  homogentisate 1,2-dioxygenase  62.23 
 
 		 453 aa  519  1e-146  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.814651  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5153  homogentisate 1,2-dioxygenase  61.37 
 
 		 448 aa  521  1e-146  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.424959  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1043  homogentisate 1,2-dioxygenase  61.02 
 
 		 450 aa  511  1e-144  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2532  homogentisate 1,2-dioxygenase  62.41 
 
 		 453 aa  513  1e-144  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02539  homogentisate 1,2-dioxygenase  57.98 
 
 		 454 aa  508  1e-143  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000365945  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2456  homogentisate 1,2-dioxygenase  60.24 
 
 		 452 aa  511  1e-143  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1407  homogentisate 1,2-dioxygenase  58.92 
 
 		 453 aa  502  1e-141  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.818209 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1557  homogentisate 1,2-dioxygenase  61 
 
 		 438 aa  502  1e-141  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.474294 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1511  homogentisate 1,2-dioxygenase  57.98 
 
 		 453 aa  495  1e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.000621512  normal  0.470006 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4302  homogentisate 1,2-dioxygenase  58.81 
 
 		 443 aa  498  1e-139  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3333  homogentisate 1,2-dioxygenase  59.1 
 
 		 455 aa  493  9.999999999999999e-139  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2833  homogentisate 1,2-dioxygenase  57.58 
 
 		 453 aa  484  1e-135  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.385298  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0913  homogentisate 1,2-dioxygenase  56.87 
 
 		 453 aa  479  1e-134  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.994604  normal  0.237981 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3547  homogentisate 1,2-dioxygenase  56.87 
 
 		 453 aa  479  1e-134  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.294103 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01897  Homogentisate 1,2-dioxygenase (EC 1.13.11.5)(Homogentisic acid oxidase)(Homogentisate oxygenase)(Homogentisicase) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q00667]  57.24 
 
 		 448 aa  473  1e-132  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1439  homogentisate 1,2-dioxygenase  55.21 
 
 		 460 aa  459  9.999999999999999e-129  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1025  homogentisate 1,2-dioxygenase  53.16 
 
 		 429 aa  457  1e-127  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.243336  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2621  homogentisate 1,2-dioxygenase  55.69 
 
 		 451 aa  456  1e-127  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.783486 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3812  homogentisate 1,2-dioxygenase  55.92 
 
 		 451 aa  457  1e-127  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.283332  normal  0.618849 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1248  homogentisate 1,2-dioxygenase  54.42 
 
 		 416 aa  444  1e-123  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1248  homogentisate 1,2-dioxygenase  54.18 
 
 		 416 aa  440  9.999999999999999e-123  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2738  homogentisate 1,2-dioxygenase  49.16 
 
 		 441 aa  406  1.0000000000000001e-112  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06390  homogentisate 1,2-dioxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G10810)  48.24 
 
 		 462 aa  396  1e-109  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.224544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5825  homogentisate 1,2-dioxygenase  47.64 
 
 		 848 aa  388  1e-106  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0876183  normal  0.90273 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49112  predicted protein  48.03 
 
 		 494 aa  378  1e-103  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00796178  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00477  conserved hypothetical protein  43.47 
 
 		 458 aa  309  5.9999999999999995e-83  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.727152  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04012  conserved hypothetical protein  41.06 
 
 		 533 aa  301  2e-80  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.383665  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8845  homogentisate 1,2-dioxygenase, putative  29.06 
 
 		 389 aa  92  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.57227 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0709  homogentisate 12-dioxygenase  28.84 
 
 		 397 aa  90.9  4e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1438  homogentisate 1,2-dioxygenase  26.57 
 
 		 372 aa  80.9  0.00000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0530  homogentisate 12-dioxygenase  28.24 
 
 		 406 aa  72  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3787  homogentisate 12-dioxygenase  28.01 
 
 		 407 aa  72  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1684  homogentisate 12-dioxygenase  28.26 
 
 		 395 aa  68.6  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0088  homogentisate 12-dioxygenase  27.4 
 
 		 400 aa  67.8  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2369  homogentisate 12-dioxygenase  24.1 
 
 		 384 aa  67  0.0000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1918  homogentisate 12-dioxygenase  28.78 
 
 		 401 aa  66.6  0.0000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0204233  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6468  homogentisate 12-dioxygenase  28.24 
 
 		 394 aa  66.6  0.0000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.213717 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6321  homogentisate 12-dioxygenase  25.19 
 
 		 396 aa  66.2  0.0000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02178  hypothetical protein  24.82 
 
 		 376 aa  66.2  0.0000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003654  homogentisate 1,2-dioxygenase  24.44 
 
 		 364 aa  65.1  0.000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1107  homogentisate 12-dioxygenase  28.36 
 
 		 399 aa  65.1  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.141602 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2162  homogentisate 1,2-dioxygenase  26.64 
 
 		 386 aa  64.3  0.000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18910  homogentisate 1,2-dioxygenase  29.83 
 
 		 406 aa  64.3  0.000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0108464  normal  0.652013 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1868  homogentisate 12-dioxygenase  27.74 
 
 		 402 aa  64.3  0.000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.501601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4688  homogentisate 12-dioxygenase  28.22 
 
 		 388 aa  63.9  0.000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.378892  normal  0.704415 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0961  putative oxidoreductase  24.56 
 
 		 378 aa  63.5  0.000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0217  homogentisate 1,2-dioxygenase  26.64 
 
 		 390 aa  63.2  0.000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2363  homogentisate 1,2-dioxygenase  24.56 
 
 		 386 aa  63.2  0.000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.445339  normal  0.275941 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0276  putative homogentisate 1,2-dioxygenase  25.86 
 
 		 390 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000242533  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3805  homogentisate 12-dioxygenase  27.16 
 
 		 388 aa  62.8  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00200515  normal  0.427722 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0221  homogentisate 12-dioxygenase  26.25 
 
 		 390 aa  62.4  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>