144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_1438 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_1438  homogentisate 1,2-dioxygenase  100 
 
 		 372 aa  772    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02178  hypothetical protein  60.7 
 
 		 376 aa  481  1e-135  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0961  putative oxidoreductase  60.7 
 
 		 378 aa  477  1e-133  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003654  homogentisate 1,2-dioxygenase  59.94 
 
 		 364 aa  464  9.999999999999999e-131  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1697  homogentisate 1,2-dioxygenase  58.65 
 
 		 379 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.196029 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5427  homogentisate 12-dioxygenase  34.82 
 
 		 385 aa  207  3e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0911564  normal  0.337883 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0728  homogentisate 1,2-dioxygenase  33.89 
 
 		 385 aa  202  9.999999999999999e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02595  homogentisate 1,2-dioxygenase  33.33 
 
 		 386 aa  196  4.0000000000000005e-49  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0957  homogentisate 12-dioxygenase  33.61 
 
 		 373 aa  192  6e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.490105  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3805  homogentisate 12-dioxygenase  35.08 
 
 		 388 aa  192  6e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00200515  normal  0.427722 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2106  homogentisate 12-dioxygenase  33.89 
 
 		 385 aa  189  5.999999999999999e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0415029  normal  0.565208 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6321  homogentisate 12-dioxygenase  33.61 
 
 		 396 aa  186  4e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0230  homogentisate 12-dioxygenase  33.33 
 
 		 390 aa  186  4e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2762  homogentisate 12-dioxygenase  34.07 
 
 		 385 aa  186  8e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000862823  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3280  homogentisate 12-dioxygenase  32.12 
 
 		 385 aa  184  3e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.524985 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8845  homogentisate 1,2-dioxygenase, putative  33.68 
 
 		 389 aa  182  6e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.57227 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0709  homogentisate 12-dioxygenase  34.86 
 
 		 397 aa  182  9.000000000000001e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0217  homogentisate 1,2-dioxygenase  33.25 
 
 		 390 aa  181  2e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0257  putative homogentisate 1,2-dioxygenase  32.82 
 
 		 392 aa  181  2e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000636938  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0221  homogentisate 12-dioxygenase  32.82 
 
 		 390 aa  181  2e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0255  putative homogentisate 1,2-dioxygenase  33.25 
 
 		 390 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0276  putative homogentisate 1,2-dioxygenase  33.25 
 
 		 390 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000242533  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1897  homogentisate 1,2-dioxygenase  32.28 
 
 		 363 aa  180  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0262  homogentisate 1,2-dioxygenase, putative  33.25 
 
 		 390 aa  180  4e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00729386  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5068  putative homogentisate 1,2-dioxygenase  33.25 
 
 		 390 aa  179  5.999999999999999e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00282868  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0812  homogentisate 12-dioxygenase  33.88 
 
 		 393 aa  179  9e-44  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0228  homogentisate 1,2-dioxygenase  32.99 
 
 		 390 aa  178  1e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0215  homogentisate 1,2-dioxygenase  32.99 
 
 		 390 aa  178  1e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0242  homogentisate 1,2-dioxygenase  32.99 
 
 		 390 aa  178  1e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4463  homogentisate 1,2-dioxygenase  32.48 
 
 		 367 aa  176  5e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.100375 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1591  homogentisate 1,2-dioxygenase  31.81 
 
 		 368 aa  173  5e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1615  homogentisate 1,2-dioxygenase  31.81 
 
 		 368 aa  173  5e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.904651 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1561  homogentisate 1,2-dioxygenase  31.52 
 
 		 368 aa  172  6.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0088  homogentisate 12-dioxygenase  34.01 
 
 		 400 aa  171  2e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2369  homogentisate 12-dioxygenase  28.73 
 
 		 384 aa  170  4e-41  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1684  homogentisate 12-dioxygenase  33.51 
 
 		 395 aa  168  1e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07000  homogentisate 1,2-dioxygenase  32.28 
 
 		 399 aa  164  2.0000000000000002e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.126563 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1732  homogentisate 12-dioxygenase  31.09 
 
 		 386 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00561061 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2154  homogentisate 1,2-dioxygenase  30.65 
 
 		 386 aa  164  3e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.634063 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1671  homogentisate 1,2-dioxygenase  31.09 
 
 		 386 aa  164  3e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.991879  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2653  homogentisate 12-dioxygenase  31.59 
 
 		 386 aa  163  4.0000000000000004e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.51516  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2728  homogentisate 12-dioxygenase  31.87 
 
 		 386 aa  163  6e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.315515  normal  0.247333 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2615  homogentisate 12-dioxygenase  30.83 
 
 		 386 aa  162  7e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0308121  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1107  homogentisate 12-dioxygenase  32.45 
 
 		 399 aa  159  8e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.141602 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1874  homogentisate 12-dioxygenase  30.13 
 
 		 386 aa  159  8e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1868  homogentisate 12-dioxygenase  32.51 
 
 		 402 aa  158  2e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.501601  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18910  homogentisate 1,2-dioxygenase  32.27 
 
 		 406 aa  157  2e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0108464  normal  0.652013 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6468  homogentisate 12-dioxygenase  31.62 
 
 		 394 aa  158  2e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.213717 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0657  homogentisate 1,2-dioxygenase  32.71 
 
 		 404 aa  157  4e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2162  homogentisate 1,2-dioxygenase  30.29 
 
 		 386 aa  155  1e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1569  homogentisate 1,2-dioxygenase  30.48 
 
 		 386 aa  154  2e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2363  homogentisate 1,2-dioxygenase  31.88 
 
 		 386 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.445339  normal  0.275941 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1963  hypothetical protein  32.15 
 
 		 386 aa  153  5e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2326  homogentisate 1,2-dioxygenase  30.33 
 
 		 386 aa  153  5e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4688  homogentisate 12-dioxygenase  32.53 
 
 		 388 aa  153  5e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.378892  normal  0.704415 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2481  homogentisate 1,2-dioxygenase  31.88 
 
 		 386 aa  152  8e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.59318  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2291  homogentisate 1,2-dioxygenase  31.61 
 
 		 386 aa  151  2e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000437513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3787  homogentisate 12-dioxygenase  32.53 
 
 		 407 aa  151  2e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3423  homogentisate 1,2-dioxygenase  30.91 
 
 		 385 aa  148  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00233011  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0530  homogentisate 12-dioxygenase  30.03 
 
 		 406 aa  148  1.0000000000000001e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3572  homogentisate 12-dioxygenase  31.43 
 
 		 385 aa  147  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3504  homogentisate 12-dioxygenase  31.17 
 
 		 385 aa  148  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.142046  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4258  homogentisate 1,2-dioxygenase  32.24 
 
 		 388 aa  147  3e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0597877 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3485  homogentisate 12-dioxygenase  30.83 
 
 		 385 aa  146  6e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.306053  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6552  homogentisate 12-dioxygenase  29.7 
 
 		 389 aa  144  2e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0724494  normal  0.194858 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10650  homogentisate 1,2-dioxygenase  30.85 
 
 		 434 aa  140  3.9999999999999997e-32  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.233818  normal  0.424884 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1918  homogentisate 12-dioxygenase  31.05 
 
 		 401 aa  139  1e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0204233  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3333  homogentisate 1,2-dioxygenase  26.76 
 
 		 455 aa  89.7  7e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2833  homogentisate 1,2-dioxygenase  25.44 
 
 		 453 aa  85.9  9e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.385298  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2738  homogentisate 1,2-dioxygenase  26.15 
 
 		 441 aa  83.6  0.000000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2456  homogentisate 1,2-dioxygenase  26.24 
 
 		 452 aa  83.2  0.000000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5153  homogentisate 1,2-dioxygenase  25.6 
 
 		 448 aa  82  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.424959  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1018  homogentisate 1,2-dioxygenase  24.57 
 
 		 448 aa  81.6  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.266165 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3652  homogentisate 1,2-dioxygenase  26.57 
 
 		 427 aa  80.9  0.00000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.207248 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1248  homogentisate 1,2-dioxygenase  23.23 
 
 		 416 aa  80.1  0.00000000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0907  homogentisate 1,2-dioxygenase  25.6 
 
 		 448 aa  80.1  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.78575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3864  homogentisate 1,2-dioxygenase  26.25 
 
 		 442 aa  80.5  0.00000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.412305  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4374  homogentisate 1,2-dioxygenase  27.72 
 
 		 442 aa  79.7  0.00000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000328355  normal  0.761675 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1248  homogentisate 1,2-dioxygenase  23.23 
 
 		 416 aa  79.3  0.00000000000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0566  homogentisate 1,2-dioxygenase  25.65 
 
 		 449 aa  79  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.11982  normal  0.485064 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1407  homogentisate 1,2-dioxygenase  24.03 
 
 		 453 aa  79  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.818209 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1025  homogentisate 1,2-dioxygenase  26.99 
 
 		 429 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.243336  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2997  homogentisate 1,2-dioxygenase  27.11 
 
 		 434 aa  77.8  0.0000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.45322 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0921  homogentisate 1,2-dioxygenase  25.68 
 
 		 448 aa  77.8  0.0000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1043  homogentisate 1,2-dioxygenase  24.74 
 
 		 450 aa  76.6  0.0000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1511  homogentisate 1,2-dioxygenase  24.48 
 
 		 453 aa  76.6  0.0000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.000621512  normal  0.470006 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3462  homogentisate 1,2-dioxygenase  28.24 
 
 		 448 aa  76.6  0.0000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.311936  normal  0.0988393 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4534  homogentisate 1,2-dioxygenase  28.24 
 
 		 448 aa  76.6  0.0000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.233345  normal  0.576048 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3923  homogentisate 1,2-dioxygenase  26.24 
 
 		 468 aa  76.3  0.0000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4621  homogentisate 1,2-dioxygenase  27.9 
 
 		 433 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.356023  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1557  homogentisate 1,2-dioxygenase  26.18 
 
 		 438 aa  75.9  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.474294 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3812  homogentisate 1,2-dioxygenase  25.51 
 
 		 451 aa  75.1  0.000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.283332  normal  0.618849 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4605  homogentisate 1,2-dioxygenase  27.54 
 
 		 433 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0198539  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0691  homogentisate 1,2-dioxygenase  26.83 
 
 		 448 aa  74.3  0.000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.398963 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0913  homogentisate 1,2-dioxygenase  25.63 
 
 		 453 aa  74.3  0.000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.994604  normal  0.237981 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3547  homogentisate 1,2-dioxygenase  25.63 
 
 		 453 aa  74.3  0.000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.294103 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1193  homogentisate 1,2-dioxygenase  24.29 
 
 		 453 aa  74.3  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.814651  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2005  homogentisate 1,2-dioxygenase  27.45 
 
 		 429 aa  73.9  0.000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.436695  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2435  homogentisate 1,2-dioxygenase  24.46 
 
 		 440 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.125362  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0910  homogentisate 1,2-dioxygenase  29.09 
 
 		 431 aa  73.6  0.000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>