138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Anae109_3485 on replicon NC_009675
Organism: Anaeromyxobacter sp. Fw109-5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007760  Adeh_3423  homogentisate 1,2-dioxygenase  83.85 
 
 
385 aa  661    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00233011  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3572  homogentisate 12-dioxygenase  83.59 
 
 
385 aa  660    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3485  homogentisate 12-dioxygenase  100 
 
 
385 aa  771    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.306053  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3504  homogentisate 12-dioxygenase  83.85 
 
 
385 aa  663    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.142046  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6552  homogentisate 12-dioxygenase  64.01 
 
 
389 aa  489  1e-137  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0724494  normal  0.194858 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0215  homogentisate 1,2-dioxygenase  39.84 
 
 
390 aa  295  1e-78  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0217  homogentisate 1,2-dioxygenase  39.84 
 
 
390 aa  295  1e-78  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2762  homogentisate 12-dioxygenase  43.01 
 
 
385 aa  294  1e-78  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000862823  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0255  putative homogentisate 1,2-dioxygenase  39.84 
 
 
390 aa  295  1e-78  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0228  homogentisate 1,2-dioxygenase  39.84 
 
 
390 aa  293  2e-78  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0242  homogentisate 1,2-dioxygenase  39.84 
 
 
390 aa  293  2e-78  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0221  homogentisate 12-dioxygenase  39.84 
 
 
390 aa  294  2e-78  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0276  putative homogentisate 1,2-dioxygenase  39.58 
 
 
390 aa  293  3e-78  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000242533  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0262  homogentisate 1,2-dioxygenase, putative  39.58 
 
 
390 aa  293  4e-78  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00729386  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0257  putative homogentisate 1,2-dioxygenase  39.05 
 
 
392 aa  292  6e-78  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000636938  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5068  putative homogentisate 1,2-dioxygenase  39.05 
 
 
390 aa  292  8e-78  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00282868  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0230  homogentisate 12-dioxygenase  38.52 
 
 
390 aa  290  3e-77  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2106  homogentisate 12-dioxygenase  42.22 
 
 
385 aa  287  2e-76  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0415029  normal  0.565208 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5427  homogentisate 12-dioxygenase  41.21 
 
 
385 aa  284  2.0000000000000002e-75  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0911564  normal  0.337883 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3280  homogentisate 12-dioxygenase  39.32 
 
 
385 aa  279  8e-74  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.524985 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0728  homogentisate 1,2-dioxygenase  38.32 
 
 
385 aa  278  1e-73  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02595  homogentisate 1,2-dioxygenase  39.21 
 
 
386 aa  276  5e-73  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6321  homogentisate 12-dioxygenase  39.13 
 
 
396 aa  274  2.0000000000000002e-72  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3805  homogentisate 12-dioxygenase  41.64 
 
 
388 aa  269  5e-71  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00200515  normal  0.427722 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8845  homogentisate 1,2-dioxygenase, putative  40.05 
 
 
389 aa  260  3e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.57227 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1569  homogentisate 1,2-dioxygenase  37.89 
 
 
386 aa  255  1.0000000000000001e-66  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1684  homogentisate 12-dioxygenase  40.99 
 
 
395 aa  253  4.0000000000000004e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0657  homogentisate 1,2-dioxygenase  40.31 
 
 
404 aa  251  1e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2291  homogentisate 1,2-dioxygenase  37.24 
 
 
386 aa  250  3e-65  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000437513  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4688  homogentisate 12-dioxygenase  41.55 
 
 
388 aa  249  6e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.378892  normal  0.704415 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07000  homogentisate 1,2-dioxygenase  40.77 
 
 
399 aa  249  8e-65  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.126563 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0088  homogentisate 12-dioxygenase  40.61 
 
 
400 aa  248  1e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0709  homogentisate 12-dioxygenase  40.71 
 
 
397 aa  248  1e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2363  homogentisate 1,2-dioxygenase  36.98 
 
 
386 aa  247  2e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.445339  normal  0.275941 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1107  homogentisate 12-dioxygenase  40.26 
 
 
399 aa  247  2e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.141602 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6468  homogentisate 12-dioxygenase  39.64 
 
 
394 aa  247  3e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.213717 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2154  homogentisate 1,2-dioxygenase  35.64 
 
 
386 aa  245  9e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.634063 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1732  homogentisate 12-dioxygenase  35.68 
 
 
386 aa  245  9e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00561061 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1963  hypothetical protein  36.72 
 
 
386 aa  245  9.999999999999999e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2481  homogentisate 1,2-dioxygenase  36.72 
 
 
386 aa  245  9.999999999999999e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.59318  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4258  homogentisate 1,2-dioxygenase  41.27 
 
 
388 aa  245  9.999999999999999e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0597877 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1874  homogentisate 12-dioxygenase  35.82 
 
 
386 aa  243  3e-63  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2615  homogentisate 12-dioxygenase  35.42 
 
 
386 aa  243  3.9999999999999997e-63  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0308121  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1671  homogentisate 1,2-dioxygenase  35.42 
 
 
386 aa  243  3.9999999999999997e-63  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.991879  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2653  homogentisate 12-dioxygenase  35.16 
 
 
386 aa  242  7.999999999999999e-63  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.51516  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3787  homogentisate 12-dioxygenase  41.69 
 
 
407 aa  241  1e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2728  homogentisate 12-dioxygenase  35.16 
 
 
386 aa  241  2e-62  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.315515  normal  0.247333 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2162  homogentisate 1,2-dioxygenase  35.94 
 
 
386 aa  240  2.9999999999999997e-62  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2326  homogentisate 1,2-dioxygenase  34.9 
 
 
386 aa  239  5e-62  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1868  homogentisate 12-dioxygenase  38.93 
 
 
402 aa  233  4.0000000000000004e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.501601  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1918  homogentisate 12-dioxygenase  39.07 
 
 
401 aa  233  6e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0204233  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18910  homogentisate 1,2-dioxygenase  36.13 
 
 
406 aa  230  3e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0108464  normal  0.652013 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2369  homogentisate 12-dioxygenase  33.07 
 
 
384 aa  228  1e-58  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0812  homogentisate 12-dioxygenase  40.16 
 
 
393 aa  224  2e-57  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0530  homogentisate 12-dioxygenase  35.93 
 
 
406 aa  218  1e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10650  homogentisate 1,2-dioxygenase  34.95 
 
 
434 aa  214  1.9999999999999998e-54  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.233818  normal  0.424884 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1438  homogentisate 1,2-dioxygenase  30.83 
 
 
372 aa  146  6e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0961  putative oxidoreductase  30.23 
 
 
378 aa  141  1.9999999999999998e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1697  homogentisate 1,2-dioxygenase  34.93 
 
 
379 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.196029 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003654  homogentisate 1,2-dioxygenase  30.11 
 
 
364 aa  135  9.999999999999999e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02178  hypothetical protein  30.41 
 
 
376 aa  134  3.9999999999999996e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4463  homogentisate 1,2-dioxygenase  29.8 
 
 
367 aa  105  2e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.100375 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1591  homogentisate 1,2-dioxygenase  31.34 
 
 
368 aa  102  1e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1615  homogentisate 1,2-dioxygenase  31.34 
 
 
368 aa  102  1e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.904651 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0957  homogentisate 12-dioxygenase  30.81 
 
 
373 aa  101  2e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.490105  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1897  homogentisate 1,2-dioxygenase  29.36 
 
 
363 aa  100  4e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1561  homogentisate 1,2-dioxygenase  31.05 
 
 
368 aa  100  4e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0566  homogentisate 1,2-dioxygenase  25.37 
 
 
449 aa  62.4  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.11982  normal  0.485064 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0913  homogentisate 1,2-dioxygenase  24.82 
 
 
453 aa  61.6  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.994604  normal  0.237981 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3547  homogentisate 1,2-dioxygenase  24.82 
 
 
453 aa  61.6  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.294103 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3812  homogentisate 1,2-dioxygenase  26.35 
 
 
451 aa  61.2  0.00000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.283332  normal  0.618849 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2621  homogentisate 1,2-dioxygenase  25.09 
 
 
451 aa  60.8  0.00000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.783486 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3333  homogentisate 1,2-dioxygenase  24.86 
 
 
455 aa  60.8  0.00000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1439  homogentisate 1,2-dioxygenase  25.59 
 
 
460 aa  60.5  0.00000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0921  homogentisate 1,2-dioxygenase  25.28 
 
 
448 aa  59.7  0.00000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2456  homogentisate 1,2-dioxygenase  23.94 
 
 
452 aa  58.9  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1193  homogentisate 1,2-dioxygenase  24.41 
 
 
453 aa  59.3  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.814651  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3864  homogentisate 1,2-dioxygenase  26.02 
 
 
442 aa  58.5  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.412305  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2833  homogentisate 1,2-dioxygenase  22.45 
 
 
453 aa  57.8  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.385298  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0891  homogentisate 1,2-dioxygenase  25.66 
 
 
448 aa  57.8  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.669112  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2532  homogentisate 1,2-dioxygenase  24.3 
 
 
453 aa  57.8  0.0000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01897  Homogentisate 1,2-dioxygenase (EC 1.13.11.5)(Homogentisic acid oxidase)(Homogentisate oxygenase)(Homogentisicase) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q00667]  25 
 
 
448 aa  56.2  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0994  homogentisate 1,2-dioxygenase  25.26 
 
 
454 aa  55.1  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49112  predicted protein  24.66 
 
 
494 aa  55.5  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00796178  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0817  homogentisate 1,2-dioxygenase  24.82 
 
 
433 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.633132  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2093  Homogentisate 1 2-dioxygenase-like protein  27.52 
 
 
393 aa  54.3  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.6516  normal  0.270951 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1025  homogentisate 1,2-dioxygenase  23.95 
 
 
429 aa  54.7  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.243336  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1018  homogentisate 1,2-dioxygenase  24.63 
 
 
448 aa  54.7  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.266165 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2005  homogentisate 1,2-dioxygenase  24.88 
 
 
429 aa  53.5  0.000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.436695  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06390  homogentisate 1,2-dioxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G10810)  25 
 
 
462 aa  53.1  0.000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.224544  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5153  homogentisate 1,2-dioxygenase  23.51 
 
 
448 aa  53.1  0.000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.424959  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4621  homogentisate 1,2-dioxygenase  25.43 
 
 
433 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.356023  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1511  homogentisate 1,2-dioxygenase  21.74 
 
 
453 aa  52.4  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.000621512  normal  0.470006 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1407  homogentisate 1,2-dioxygenase  22.73 
 
 
453 aa  52.8  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.818209 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5825  homogentisate 1,2-dioxygenase  34.25 
 
 
848 aa  52  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0876183  normal  0.90273 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4605  homogentisate 1,2-dioxygenase  24.88 
 
 
433 aa  52  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0198539  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0907  homogentisate 1,2-dioxygenase  24.56 
 
 
448 aa  51.2  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.78575  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4302  homogentisate 1,2-dioxygenase  25.15 
 
 
443 aa  51.6  0.00003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0289  homogentisate 1,2-dioxygenase  25.93 
 
 
437 aa  50.8  0.00004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.36661  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1043  homogentisate 1,2-dioxygenase  24.15 
 
 
450 aa  50.8  0.00004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>