134 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_1561 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_1591  homogentisate 1,2-dioxygenase  98.91 
 
 		 368 aa  751    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1615  homogentisate 1,2-dioxygenase  98.91 
 
 		 368 aa  751    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.904651 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1897  homogentisate 1,2-dioxygenase  84.55 
 
 		 363 aa  643    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1561  homogentisate 1,2-dioxygenase  100 
 
 		 368 aa  755    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4463  homogentisate 1,2-dioxygenase  83.11 
 
 		 367 aa  636    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.100375 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0957  homogentisate 12-dioxygenase  65.19 
 
 		 373 aa  463  1e-129  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.490105  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1697  homogentisate 1,2-dioxygenase  34.94 
 
 		 379 aa  188  1e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.196029 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1438  homogentisate 1,2-dioxygenase  31.52 
 
 		 372 aa  172  6.999999999999999e-42  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02178  hypothetical protein  31.3 
 
 		 376 aa  169  8e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003654  homogentisate 1,2-dioxygenase  31.53 
 
 		 364 aa  168  1e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0961  putative oxidoreductase  32.11 
 
 		 378 aa  167  2e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0221  homogentisate 12-dioxygenase  28.4 
 
 		 390 aa  126  5e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0657  homogentisate 1,2-dioxygenase  31.09 
 
 		 404 aa  126  6e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1107  homogentisate 12-dioxygenase  29.07 
 
 		 399 aa  125  1e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.141602 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0262  homogentisate 1,2-dioxygenase, putative  28.11 
 
 		 390 aa  124  2e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00729386  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0228  homogentisate 1,2-dioxygenase  28.7 
 
 		 390 aa  124  2e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0215  homogentisate 1,2-dioxygenase  28.11 
 
 		 390 aa  124  2e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0217  homogentisate 1,2-dioxygenase  28.11 
 
 		 390 aa  125  2e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0242  homogentisate 1,2-dioxygenase  28.7 
 
 		 390 aa  124  2e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0255  putative homogentisate 1,2-dioxygenase  28.11 
 
 		 390 aa  124  2e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0230  homogentisate 12-dioxygenase  28.91 
 
 		 390 aa  125  2e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0276  putative homogentisate 1,2-dioxygenase  28.11 
 
 		 390 aa  125  2e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000242533  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07000  homogentisate 1,2-dioxygenase  30.19 
 
 		 399 aa  123  4e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.126563 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0257  putative homogentisate 1,2-dioxygenase  28.7 
 
 		 392 aa  124  4e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000636938  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5068  putative homogentisate 1,2-dioxygenase  28.4 
 
 		 390 aa  122  8e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00282868  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1684  homogentisate 12-dioxygenase  28.84 
 
 		 395 aa  122  9.999999999999999e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0088  homogentisate 12-dioxygenase  28.89 
 
 		 400 aa  122  9.999999999999999e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2762  homogentisate 12-dioxygenase  29.82 
 
 		 385 aa  121  1.9999999999999998e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000862823  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6321  homogentisate 12-dioxygenase  27.4 
 
 		 396 aa  119  6e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2093  Homogentisate 1 2-dioxygenase-like protein  29.76 
 
 		 393 aa  119  7e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.6516  normal  0.270951 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4258  homogentisate 1,2-dioxygenase  30.57 
 
 		 388 aa  117  3e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0597877 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18910  homogentisate 1,2-dioxygenase  30.39 
 
 		 406 aa  116  6e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0108464  normal  0.652013 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4688  homogentisate 12-dioxygenase  29.46 
 
 		 388 aa  116  6.9999999999999995e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.378892  normal  0.704415 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02595  homogentisate 1,2-dioxygenase  26.65 
 
 		 386 aa  116  7.999999999999999e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0728  homogentisate 1,2-dioxygenase  25.97 
 
 		 385 aa  115  1.0000000000000001e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1918  homogentisate 12-dioxygenase  29.74 
 
 		 401 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0204233  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5427  homogentisate 12-dioxygenase  27.2 
 
 		 385 aa  115  2.0000000000000002e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0911564  normal  0.337883 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0530  homogentisate 12-dioxygenase  29.41 
 
 		 406 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2106  homogentisate 12-dioxygenase  26.85 
 
 		 385 aa  111  2.0000000000000002e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0415029  normal  0.565208 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6468  homogentisate 12-dioxygenase  28.18 
 
 		 394 aa  110  3e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.213717 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0709  homogentisate 12-dioxygenase  27.7 
 
 		 397 aa  109  9.000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2154  homogentisate 1,2-dioxygenase  26.99 
 
 		 386 aa  108  1e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.634063 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0812  homogentisate 12-dioxygenase  27.84 
 
 		 393 aa  108  1e-22  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1569  homogentisate 1,2-dioxygenase  26.05 
 
 		 386 aa  108  2e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3280  homogentisate 12-dioxygenase  24.12 
 
 		 385 aa  108  2e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.524985 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2481  homogentisate 1,2-dioxygenase  26.78 
 
 		 386 aa  107  4e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.59318  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2291  homogentisate 1,2-dioxygenase  26.78 
 
 		 386 aa  107  5e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000437513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1874  homogentisate 12-dioxygenase  25.5 
 
 		 386 aa  106  5e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1732  homogentisate 12-dioxygenase  25.85 
 
 		 386 aa  106  6e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00561061 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10650  homogentisate 1,2-dioxygenase  27.06 
 
 		 434 aa  105  1e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.233818  normal  0.424884 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2162  homogentisate 1,2-dioxygenase  26.57 
 
 		 386 aa  105  1e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2615  homogentisate 12-dioxygenase  25.57 
 
 		 386 aa  104  2e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0308121  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2728  homogentisate 12-dioxygenase  25.57 
 
 		 386 aa  104  2e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.315515  normal  0.247333 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8845  homogentisate 1,2-dioxygenase, putative  26.75 
 
 		 389 aa  103  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.57227 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1963  hypothetical protein  26.42 
 
 		 386 aa  104  3e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3423  homogentisate 1,2-dioxygenase  30.7 
 
 		 385 aa  104  3e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00233011  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1671  homogentisate 1,2-dioxygenase  25.57 
 
 		 386 aa  104  3e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.991879  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2653  homogentisate 12-dioxygenase  25.28 
 
 		 386 aa  104  3e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.51516  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3504  homogentisate 12-dioxygenase  30.7 
 
 		 385 aa  103  3e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.142046  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3787  homogentisate 12-dioxygenase  27.61 
 
 		 407 aa  103  4e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2363  homogentisate 1,2-dioxygenase  26.5 
 
 		 386 aa  103  7e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.445339  normal  0.275941 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3572  homogentisate 12-dioxygenase  30.14 
 
 		 385 aa  101  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1868  homogentisate 12-dioxygenase  27.44 
 
 		 402 aa  101  2e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.501601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3485  homogentisate 12-dioxygenase  31.05 
 
 		 385 aa  100  4e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.306053  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2326  homogentisate 1,2-dioxygenase  25.14 
 
 		 386 aa  100  5e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3805  homogentisate 12-dioxygenase  26.04 
 
 		 388 aa  95.5  1e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00200515  normal  0.427722 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2369  homogentisate 12-dioxygenase  24.53 
 
 		 384 aa  92.8  9e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6552  homogentisate 12-dioxygenase  27.27 
 
 		 389 aa  90.1  6e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0724494  normal  0.194858 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2725  homogentisate 1,2-dioxygenase  26.96 
 
 		 431 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00241736  normal  0.0920445 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3738  homogentisate 1,2-dioxygenase  26.96 
 
 		 432 aa  63.9  0.000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.333429  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0876  homogentisate 1,2-dioxygenase  24.5 
 
 		 443 aa  62.8  0.000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0480084  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3913  homogentisate 1,2-dioxygenase  25.89 
 
 		 444 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0337  homogentisate 1,2-dioxygenase  26.79 
 
 		 444 aa  62  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0820  homogentisate 1,2-dioxygenase  26.79 
 
 		 444 aa  62  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.623719  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0789  homogentisate 1,2-dioxygenase  26.79 
 
 		 444 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.211762  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3900  homogentisate 1,2-dioxygenase  26.22 
 
 		 448 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.187148 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0701  homogentisate 1,2-dioxygenase  25.89 
 
 		 444 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0718  homogentisate 1,2-dioxygenase  25.89 
 
 		 444 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.10992  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0780  homogentisate 1,2-dioxygenase  25.84 
 
 		 448 aa  60.1  0.00000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.90704  normal  0.708148 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1557  homogentisate 1,2-dioxygenase  24.72 
 
 		 438 aa  59.7  0.00000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.474294 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4605  homogentisate 1,2-dioxygenase  23.6 
 
 		 433 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0198539  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2563  homogentisate 1,2-dioxygenase  25.45 
 
 		 444 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1397  homogentisate 1,2-dioxygenase  25.11 
 
 		 450 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.762264  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0691  homogentisate 1,2-dioxygenase  25.11 
 
 		 448 aa  57  0.0000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.398963 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1248  homogentisate 1,2-dioxygenase  24.79 
 
 		 416 aa  57  0.0000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4621  homogentisate 1,2-dioxygenase  23.72 
 
 		 433 aa  57  0.0000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.356023  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3462  homogentisate 1,2-dioxygenase  25.56 
 
 		 448 aa  56.2  0.0000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.311936  normal  0.0988393 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2056  homogentisate 1,2-dioxygenase  25.11 
 
 		 450 aa  56.2  0.0000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3228  homogentisate 1,2-dioxygenase  25.11 
 
 		 450 aa  56.2  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0856  homogentisate 1,2-dioxygenase  25.11 
 
 		 450 aa  56.2  0.0000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.789962  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2688  homogentisate 1,2-dioxygenase  25.11 
 
 		 450 aa  56.2  0.0000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.515143  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3174  homogentisate 1,2-dioxygenase  25.11 
 
 		 444 aa  56.2  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.666135  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3213  homogentisate 1,2-dioxygenase  25.11 
 
 		 450 aa  56.2  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1921  homogentisate 1,2-dioxygenase  25.11 
 
 		 450 aa  56.2  0.0000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.884358  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0817  homogentisate 1,2-dioxygenase  23.74 
 
 		 433 aa  56.2  0.0000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.633132  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4534  homogentisate 1,2-dioxygenase  25.56 
 
 		 448 aa  56.2  0.0000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.233345  normal  0.576048 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06390  homogentisate 1,2-dioxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G10810)  26.58 
 
 		 462 aa  55.5  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.224544  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1248  homogentisate 1,2-dioxygenase  24.36 
 
 		 416 aa  55.8  0.000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3923  homogentisate 1,2-dioxygenase  25 
 
 		 468 aa  55.8  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2435  homogentisate 1,2-dioxygenase  25 
 
 		 440 aa  55.8  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.125362  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>