143 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AnaeK_3504 on replicon NC_011145
Organism: Anaeromyxobacter sp. K



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007760  Adeh_3423  homogentisate 1,2-dioxygenase  99.48 
 
 
385 aa  773    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00233011  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3572  homogentisate 12-dioxygenase  99.22 
 
 
385 aa  771    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3504  homogentisate 12-dioxygenase  100 
 
 
385 aa  776    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.142046  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3485  homogentisate 12-dioxygenase  83.85 
 
 
385 aa  663    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.306053  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6552  homogentisate 12-dioxygenase  65.72 
 
 
389 aa  516  1.0000000000000001e-145  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0724494  normal  0.194858 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0217  homogentisate 1,2-dioxygenase  41.27 
 
 
390 aa  299  7e-80  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0215  homogentisate 1,2-dioxygenase  41.27 
 
 
390 aa  298  8e-80  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0255  putative homogentisate 1,2-dioxygenase  41.27 
 
 
390 aa  298  9e-80  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0257  putative homogentisate 1,2-dioxygenase  40.48 
 
 
392 aa  297  2e-79  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000636938  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0228  homogentisate 1,2-dioxygenase  41.01 
 
 
390 aa  297  2e-79  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0276  putative homogentisate 1,2-dioxygenase  41.01 
 
 
390 aa  297  2e-79  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000242533  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0242  homogentisate 1,2-dioxygenase  41.01 
 
 
390 aa  297  2e-79  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0221  homogentisate 12-dioxygenase  40.74 
 
 
390 aa  297  2e-79  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0262  homogentisate 1,2-dioxygenase, putative  41.01 
 
 
390 aa  297  3e-79  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00729386  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0230  homogentisate 12-dioxygenase  40.48 
 
 
390 aa  296  4e-79  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5068  putative homogentisate 1,2-dioxygenase  40.48 
 
 
390 aa  296  6e-79  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00282868  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2762  homogentisate 12-dioxygenase  43.16 
 
 
385 aa  295  1e-78  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000862823  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2106  homogentisate 12-dioxygenase  40.94 
 
 
385 aa  279  6e-74  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0415029  normal  0.565208 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3280  homogentisate 12-dioxygenase  40.36 
 
 
385 aa  277  2e-73  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.524985 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5427  homogentisate 12-dioxygenase  39.42 
 
 
385 aa  272  7e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0911564  normal  0.337883 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3805  homogentisate 12-dioxygenase  42.18 
 
 
388 aa  271  1e-71  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00200515  normal  0.427722 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02595  homogentisate 1,2-dioxygenase  38.68 
 
 
386 aa  265  7e-70  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1569  homogentisate 1,2-dioxygenase  38.18 
 
 
386 aa  265  1e-69  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6321  homogentisate 12-dioxygenase  38.32 
 
 
396 aa  265  1e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1684  homogentisate 12-dioxygenase  41.28 
 
 
395 aa  263  4.999999999999999e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0728  homogentisate 1,2-dioxygenase  36.58 
 
 
385 aa  263  6e-69  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4688  homogentisate 12-dioxygenase  42.82 
 
 
388 aa  260  4e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.378892  normal  0.704415 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2291  homogentisate 1,2-dioxygenase  38.38 
 
 
386 aa  259  5.0000000000000005e-68  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000437513  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0657  homogentisate 1,2-dioxygenase  40.31 
 
 
404 aa  259  8e-68  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2154  homogentisate 1,2-dioxygenase  37.08 
 
 
386 aa  258  2e-67  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.634063 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8845  homogentisate 1,2-dioxygenase, putative  40.78 
 
 
389 aa  256  3e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.57227 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2363  homogentisate 1,2-dioxygenase  38.12 
 
 
386 aa  256  4e-67  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.445339  normal  0.275941 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2481  homogentisate 1,2-dioxygenase  37.76 
 
 
386 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.59318  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07000  homogentisate 1,2-dioxygenase  40.1 
 
 
399 aa  254  2.0000000000000002e-66  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.126563 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1732  homogentisate 12-dioxygenase  36.46 
 
 
386 aa  253  3e-66  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00561061 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4258  homogentisate 1,2-dioxygenase  42.27 
 
 
388 aa  253  3e-66  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0597877 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1963  hypothetical protein  37.76 
 
 
386 aa  253  5.000000000000001e-66  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1874  homogentisate 12-dioxygenase  36.18 
 
 
386 aa  252  9.000000000000001e-66  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1107  homogentisate 12-dioxygenase  39.79 
 
 
399 aa  251  1e-65  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.141602 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2615  homogentisate 12-dioxygenase  36.03 
 
 
386 aa  251  1e-65  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0308121  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0088  homogentisate 12-dioxygenase  40.72 
 
 
400 aa  251  1e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1671  homogentisate 1,2-dioxygenase  36.2 
 
 
386 aa  251  2e-65  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.991879  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2162  homogentisate 1,2-dioxygenase  36.03 
 
 
386 aa  249  5e-65  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2653  homogentisate 12-dioxygenase  35.94 
 
 
386 aa  249  5e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.51516  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3787  homogentisate 12-dioxygenase  41.28 
 
 
407 aa  249  8e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2728  homogentisate 12-dioxygenase  36.2 
 
 
386 aa  249  8e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.315515  normal  0.247333 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2326  homogentisate 1,2-dioxygenase  35.25 
 
 
386 aa  245  8e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2369  homogentisate 12-dioxygenase  35.01 
 
 
384 aa  244  1.9999999999999999e-63  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18910  homogentisate 1,2-dioxygenase  38.83 
 
 
406 aa  243  3.9999999999999997e-63  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0108464  normal  0.652013 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6468  homogentisate 12-dioxygenase  39.11 
 
 
394 aa  243  3.9999999999999997e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.213717 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0812  homogentisate 12-dioxygenase  41.64 
 
 
393 aa  242  7e-63  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0709  homogentisate 12-dioxygenase  40.1 
 
 
397 aa  241  2e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0530  homogentisate 12-dioxygenase  38.46 
 
 
406 aa  238  9e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1868  homogentisate 12-dioxygenase  38.19 
 
 
402 aa  238  2e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.501601  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1918  homogentisate 12-dioxygenase  37.91 
 
 
401 aa  237  3e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0204233  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10650  homogentisate 1,2-dioxygenase  36.59 
 
 
434 aa  223  4.9999999999999996e-57  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.233818  normal  0.424884 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1438  homogentisate 1,2-dioxygenase  31.17 
 
 
372 aa  148  2.0000000000000003e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0961  putative oxidoreductase  30 
 
 
378 aa  140  3.9999999999999997e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1697  homogentisate 1,2-dioxygenase  31.32 
 
 
379 aa  136  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.196029 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003654  homogentisate 1,2-dioxygenase  30.93 
 
 
364 aa  132  9e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02178  hypothetical protein  31.56 
 
 
376 aa  132  1.0000000000000001e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4463  homogentisate 1,2-dioxygenase  31.5 
 
 
367 aa  113  5e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.100375 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0957  homogentisate 12-dioxygenase  31.76 
 
 
373 aa  107  3e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.490105  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1591  homogentisate 1,2-dioxygenase  30.7 
 
 
368 aa  104  2e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1615  homogentisate 1,2-dioxygenase  30.7 
 
 
368 aa  104  2e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.904651 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1897  homogentisate 1,2-dioxygenase  30.5 
 
 
363 aa  104  2e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1561  homogentisate 1,2-dioxygenase  30.7 
 
 
368 aa  103  4e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2833  homogentisate 1,2-dioxygenase  25.51 
 
 
453 aa  66.6  0.0000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.385298  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0994  homogentisate 1,2-dioxygenase  26.74 
 
 
454 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3812  homogentisate 1,2-dioxygenase  27.36 
 
 
451 aa  64.7  0.000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.283332  normal  0.618849 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1439  homogentisate 1,2-dioxygenase  26.04 
 
 
460 aa  63.9  0.000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0921  homogentisate 1,2-dioxygenase  26.84 
 
 
448 aa  63.5  0.000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0566  homogentisate 1,2-dioxygenase  25.44 
 
 
449 aa  63.5  0.000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.11982  normal  0.485064 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2621  homogentisate 1,2-dioxygenase  25.69 
 
 
451 aa  63.2  0.000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.783486 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2456  homogentisate 1,2-dioxygenase  25.69 
 
 
452 aa  63.2  0.000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0913  homogentisate 1,2-dioxygenase  25.35 
 
 
453 aa  62.4  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.994604  normal  0.237981 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3547  homogentisate 1,2-dioxygenase  25.35 
 
 
453 aa  62.4  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.294103 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3333  homogentisate 1,2-dioxygenase  25.34 
 
 
455 aa  61.6  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2336  homogentisate 1,2-dioxygenase  26.17 
 
 
430 aa  60.8  0.00000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.829883  normal  0.673279 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4302  homogentisate 1,2-dioxygenase  25.82 
 
 
443 aa  60.8  0.00000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0289  homogentisate 1,2-dioxygenase  25.6 
 
 
437 aa  60.5  0.00000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.36661  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1193  homogentisate 1,2-dioxygenase  24.74 
 
 
453 aa  60.1  0.00000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.814651  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1025  homogentisate 1,2-dioxygenase  22.89 
 
 
429 aa  60.1  0.00000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.243336  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06390  homogentisate 1,2-dioxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G10810)  25.9 
 
 
462 aa  58.2  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.224544  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2997  homogentisate 1,2-dioxygenase  24.83 
 
 
434 aa  58.5  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.45322 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2725  homogentisate 1,2-dioxygenase  24.91 
 
 
431 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00241736  normal  0.0920445 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3462  homogentisate 1,2-dioxygenase  24.91 
 
 
448 aa  57.8  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.311936  normal  0.0988393 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4534  homogentisate 1,2-dioxygenase  24.91 
 
 
448 aa  57.8  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.233345  normal  0.576048 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2532  homogentisate 1,2-dioxygenase  24.91 
 
 
453 aa  57.4  0.0000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2056  homogentisate 1,2-dioxygenase  26.09 
 
 
450 aa  57  0.0000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3228  homogentisate 1,2-dioxygenase  26.09 
 
 
450 aa  57  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0856  homogentisate 1,2-dioxygenase  26.09 
 
 
450 aa  57  0.0000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.789962  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2688  homogentisate 1,2-dioxygenase  26.09 
 
 
450 aa  57  0.0000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.515143  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3174  homogentisate 1,2-dioxygenase  26.09 
 
 
444 aa  57  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.666135  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3213  homogentisate 1,2-dioxygenase  26.09 
 
 
450 aa  57  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1921  homogentisate 1,2-dioxygenase  26.09 
 
 
450 aa  57  0.0000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.884358  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2563  homogentisate 1,2-dioxygenase  25 
 
 
444 aa  57  0.0000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1511  homogentisate 1,2-dioxygenase  24.4 
 
 
453 aa  57  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.000621512  normal  0.470006 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1018  homogentisate 1,2-dioxygenase  25.46 
 
 
448 aa  56.6  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.266165 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4374  homogentisate 1,2-dioxygenase  24.44 
 
 
442 aa  56.6  0.0000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000328355  normal  0.761675 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>