102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_0812 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_0812  homogentisate 12-dioxygenase  100 
 
 		 393 aa  799    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1684  homogentisate 12-dioxygenase  59.19 
 
 		 395 aa  464  1e-129  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0088  homogentisate 12-dioxygenase  59.4 
 
 		 400 aa  452  1.0000000000000001e-126  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8845  homogentisate 1,2-dioxygenase, putative  58.42 
 
 		 389 aa  448  1e-125  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.57227 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4258  homogentisate 1,2-dioxygenase  60.05 
 
 		 388 aa  444  1e-123  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0597877 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4688  homogentisate 12-dioxygenase  59.69 
 
 		 388 aa  441  1e-123  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.378892  normal  0.704415 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6468  homogentisate 12-dioxygenase  57.54 
 
 		 394 aa  438  9.999999999999999e-123  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.213717 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1868  homogentisate 12-dioxygenase  55.7 
 
 		 402 aa  434  1e-120  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.501601  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1918  homogentisate 12-dioxygenase  54.11 
 
 		 401 aa  425  1e-118  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0204233  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0657  homogentisate 1,2-dioxygenase  54.8 
 
 		 404 aa  417  9.999999999999999e-116  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0709  homogentisate 12-dioxygenase  55.05 
 
 		 397 aa  418  9.999999999999999e-116  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07000  homogentisate 1,2-dioxygenase  53.15 
 
 		 399 aa  410  1e-113  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.126563 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18910  homogentisate 1,2-dioxygenase  52.3 
 
 		 406 aa  409  1e-113  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0108464  normal  0.652013 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1107  homogentisate 12-dioxygenase  53.27 
 
 		 399 aa  410  1e-113  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.141602 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3787  homogentisate 12-dioxygenase  54.59 
 
 		 407 aa  404  1e-111  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0530  homogentisate 12-dioxygenase  51.47 
 
 		 406 aa  404  1e-111  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10650  homogentisate 1,2-dioxygenase  49.64 
 
 		 434 aa  389  1e-107  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.233818  normal  0.424884 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2762  homogentisate 12-dioxygenase  49.22 
 
 		 385 aa  364  1e-99  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000862823  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0217  homogentisate 1,2-dioxygenase  46.53 
 
 		 390 aa  360  3e-98  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5068  putative homogentisate 1,2-dioxygenase  46.39 
 
 		 390 aa  360  3e-98  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00282868  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0215  homogentisate 1,2-dioxygenase  46.53 
 
 		 390 aa  359  4e-98  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0257  putative homogentisate 1,2-dioxygenase  46.53 
 
 		 392 aa  359  4e-98  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000636938  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0228  homogentisate 1,2-dioxygenase  46.53 
 
 		 390 aa  359  5e-98  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0242  homogentisate 1,2-dioxygenase  46.53 
 
 		 390 aa  359  5e-98  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0255  putative homogentisate 1,2-dioxygenase  46.53 
 
 		 390 aa  358  6e-98  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0221  homogentisate 12-dioxygenase  46.53 
 
 		 390 aa  358  7e-98  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0276  putative homogentisate 1,2-dioxygenase  46.53 
 
 		 390 aa  358  9e-98  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000242533  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0262  homogentisate 1,2-dioxygenase, putative  46.27 
 
 		 390 aa  357  1.9999999999999998e-97  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00729386  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0230  homogentisate 12-dioxygenase  46.75 
 
 		 390 aa  357  1.9999999999999998e-97  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3805  homogentisate 12-dioxygenase  47.18 
 
 		 388 aa  333  4e-90  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00200515  normal  0.427722 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5427  homogentisate 12-dioxygenase  44.67 
 
 		 385 aa  326  5e-88  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0911564  normal  0.337883 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3280  homogentisate 12-dioxygenase  43.37 
 
 		 385 aa  322  5e-87  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.524985 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02595  homogentisate 1,2-dioxygenase  42.75 
 
 		 386 aa  312  5.999999999999999e-84  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6321  homogentisate 12-dioxygenase  42.68 
 
 		 396 aa  308  2.0000000000000002e-82  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2154  homogentisate 1,2-dioxygenase  41.18 
 
 		 386 aa  301  1e-80  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.634063 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2106  homogentisate 12-dioxygenase  43.94 
 
 		 385 aa  301  2e-80  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0415029  normal  0.565208 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1874  homogentisate 12-dioxygenase  40.66 
 
 		 386 aa  299  5e-80  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1732  homogentisate 12-dioxygenase  41.33 
 
 		 386 aa  299  7e-80  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00561061 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0728  homogentisate 1,2-dioxygenase  40.05 
 
 		 385 aa  297  2e-79  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2653  homogentisate 12-dioxygenase  41.33 
 
 		 386 aa  297  2e-79  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.51516  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1671  homogentisate 1,2-dioxygenase  41.07 
 
 		 386 aa  296  5e-79  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.991879  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2728  homogentisate 12-dioxygenase  41.07 
 
 		 386 aa  296  5e-79  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.315515  normal  0.247333 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2363  homogentisate 1,2-dioxygenase  41.45 
 
 		 386 aa  294  1e-78  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.445339  normal  0.275941 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2162  homogentisate 1,2-dioxygenase  40.41 
 
 		 386 aa  294  2e-78  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2615  homogentisate 12-dioxygenase  41.07 
 
 		 386 aa  294  2e-78  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0308121  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2291  homogentisate 1,2-dioxygenase  41.09 
 
 		 386 aa  293  4e-78  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000437513  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1569  homogentisate 1,2-dioxygenase  42.51 
 
 		 386 aa  293  4e-78  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2326  homogentisate 1,2-dioxygenase  38.87 
 
 		 386 aa  292  7e-78  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1963  hypothetical protein  41.43 
 
 		 386 aa  290  4e-77  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2481  homogentisate 1,2-dioxygenase  40.83 
 
 		 386 aa  289  7e-77  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.59318  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2369  homogentisate 12-dioxygenase  41.28 
 
 		 384 aa  284  2.0000000000000002e-75  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3572  homogentisate 12-dioxygenase  41.91 
 
 		 385 aa  244  1.9999999999999999e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3423  homogentisate 1,2-dioxygenase  41.64 
 
 		 385 aa  243  6e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00233011  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6552  homogentisate 12-dioxygenase  40.68 
 
 		 389 aa  243  6e-63  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0724494  normal  0.194858 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3504  homogentisate 12-dioxygenase  41.64 
 
 		 385 aa  242  7e-63  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.142046  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3485  homogentisate 12-dioxygenase  40.16 
 
 		 385 aa  224  2e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.306053  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003654  homogentisate 1,2-dioxygenase  34.23 
 
 		 364 aa  181  2e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1697  homogentisate 1,2-dioxygenase  34.95 
 
 		 379 aa  180  4e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.196029 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0961  putative oxidoreductase  31.69 
 
 		 378 aa  179  5.999999999999999e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1438  homogentisate 1,2-dioxygenase  33.88 
 
 		 372 aa  179  1e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02178  hypothetical protein  34.34 
 
 		 376 aa  177  2e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0957  homogentisate 12-dioxygenase  29.97 
 
 		 373 aa  126  5e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.490105  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4463  homogentisate 1,2-dioxygenase  28.16 
 
 		 367 aa  120  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.100375 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1897  homogentisate 1,2-dioxygenase  28.23 
 
 		 363 aa  118  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1591  homogentisate 1,2-dioxygenase  28.35 
 
 		 368 aa  110  3e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1615  homogentisate 1,2-dioxygenase  28.35 
 
 		 368 aa  110  3e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.904651 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1561  homogentisate 1,2-dioxygenase  27.84 
 
 		 368 aa  108  1e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01897  Homogentisate 1,2-dioxygenase (EC 1.13.11.5)(Homogentisic acid oxidase)(Homogentisate oxygenase)(Homogentisicase) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q00667]  22.06 
 
 		 448 aa  62.4  0.00000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1025  homogentisate 1,2-dioxygenase  25 
 
 		 429 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.243336  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1043  homogentisate 1,2-dioxygenase  25.98 
 
 		 450 aa  57  0.0000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2738  homogentisate 1,2-dioxygenase  24.7 
 
 		 441 aa  54.7  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2456  homogentisate 1,2-dioxygenase  24.3 
 
 		 452 aa  54.7  0.000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1193  homogentisate 1,2-dioxygenase  26.05 
 
 		 453 aa  54.7  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.814651  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3551  homogentisate 1,2-dioxygenase  27.56 
 
 		 434 aa  52  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.518718  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1018  homogentisate 1,2-dioxygenase  22.73 
 
 		 448 aa  51.6  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.266165 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0921  homogentisate 1,2-dioxygenase  23.02 
 
 		 448 aa  52  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1557  homogentisate 1,2-dioxygenase  23.67 
 
 		 438 aa  50.8  0.00004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.474294 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0907  homogentisate 1,2-dioxygenase  24.21 
 
 		 448 aa  50.1  0.00006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.78575  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2532  homogentisate 1,2-dioxygenase  26.04 
 
 		 453 aa  49.3  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5153  homogentisate 1,2-dioxygenase  23.71 
 
 		 448 aa  48.9  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.424959  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3326  homogentisate 1,2-dioxygenase  27.57 
 
 		 434 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0214185 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3333  homogentisate 1,2-dioxygenase  21.09 
 
 		 455 aa  48.1  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1407  homogentisate 1,2-dioxygenase  23.53 
 
 		 453 aa  48.1  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.818209 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0566  homogentisate 1,2-dioxygenase  22.83 
 
 		 449 aa  47.8  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.11982  normal  0.485064 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0891  homogentisate 1,2-dioxygenase  23.58 
 
 		 448 aa  47  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.669112  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0994  homogentisate 1,2-dioxygenase  25.91 
 
 		 454 aa  47.4  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3923  homogentisate 1,2-dioxygenase  24.77 
 
 		 468 aa  46.6  0.0007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06390  homogentisate 1,2-dioxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G10810)  23.77 
 
 		 462 aa  46.6  0.0008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.224544  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00477  conserved hypothetical protein  25 
 
 		 458 aa  46.6  0.0008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.727152  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3280  homogentisate 1,2-dioxygenase  25.55 
 
 		 432 aa  45.8  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.645052  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2336  homogentisate 1,2-dioxygenase  23.11 
 
 		 430 aa  45.8  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.829883  normal  0.673279 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1511  homogentisate 1,2-dioxygenase  23.16 
 
 		 453 aa  46.2  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.000621512  normal  0.470006 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5825  homogentisate 1,2-dioxygenase  25.52 
 
 		 848 aa  46.2  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0876183  normal  0.90273 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4374  homogentisate 1,2-dioxygenase  23.11 
 
 		 442 aa  45.1  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000328355  normal  0.761675 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38510  homogentisate 1,2-dioxygenase  25.91 
 
 		 432 aa  45.1  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00419964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3864  homogentisate 1,2-dioxygenase  25.94 
 
 		 442 aa  45.4  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.412305  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0289  homogentisate 1,2-dioxygenase  22.76 
 
 		 437 aa  45.4  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.36661  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49112  predicted protein  23.03 
 
 		 494 aa  44.3  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00796178  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3652  homogentisate 1,2-dioxygenase  27.82 
 
 		 427 aa  44.3  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.207248 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2093  Homogentisate 1 2-dioxygenase-like protein  23.76 
 
 		 393 aa  43.9  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.6516  normal  0.270951 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>