142 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_2369 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_2369  homogentisate 12-dioxygenase  100 
 
 		 384 aa  793    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1569  homogentisate 1,2-dioxygenase  44.56 
 
 		 386 aa  337  1.9999999999999998e-91  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2615  homogentisate 12-dioxygenase  44.3 
 
 		 386 aa  334  2e-90  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0308121  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1732  homogentisate 12-dioxygenase  44.04 
 
 		 386 aa  333  2e-90  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00561061 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2291  homogentisate 1,2-dioxygenase  44.04 
 
 		 386 aa  332  5e-90  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000437513  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2363  homogentisate 1,2-dioxygenase  44.04 
 
 		 386 aa  332  6e-90  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.445339  normal  0.275941 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1671  homogentisate 1,2-dioxygenase  44.04 
 
 		 386 aa  332  7.000000000000001e-90  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.991879  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2653  homogentisate 12-dioxygenase  43.78 
 
 		 386 aa  331  1e-89  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.51516  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2728  homogentisate 12-dioxygenase  44.04 
 
 		 386 aa  332  1e-89  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.315515  normal  0.247333 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2762  homogentisate 12-dioxygenase  42.86 
 
 		 385 aa  330  2e-89  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000862823  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1963  hypothetical protein  43.78 
 
 		 386 aa  330  3e-89  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2154  homogentisate 1,2-dioxygenase  43.78 
 
 		 386 aa  329  4e-89  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.634063 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2481  homogentisate 1,2-dioxygenase  43.52 
 
 		 386 aa  327  2.0000000000000001e-88  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.59318  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3805  homogentisate 12-dioxygenase  43.38 
 
 		 388 aa  327  2.0000000000000001e-88  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00200515  normal  0.427722 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2326  homogentisate 1,2-dioxygenase  43.01 
 
 		 386 aa  323  4e-87  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1874  homogentisate 12-dioxygenase  42.67 
 
 		 386 aa  321  9.999999999999999e-87  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2162  homogentisate 1,2-dioxygenase  43.52 
 
 		 386 aa  321  1.9999999999999998e-86  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5427  homogentisate 12-dioxygenase  42.34 
 
 		 385 aa  318  1e-85  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0911564  normal  0.337883 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2106  homogentisate 12-dioxygenase  43.64 
 
 		 385 aa  318  1e-85  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0415029  normal  0.565208 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3280  homogentisate 12-dioxygenase  42.86 
 
 		 385 aa  317  2e-85  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.524985 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0257  putative homogentisate 1,2-dioxygenase  42.45 
 
 		 392 aa  315  7e-85  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000636938  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5068  putative homogentisate 1,2-dioxygenase  42.45 
 
 		 390 aa  315  8e-85  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00282868  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0217  homogentisate 1,2-dioxygenase  42.19 
 
 		 390 aa  315  9.999999999999999e-85  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0262  homogentisate 1,2-dioxygenase, putative  41.93 
 
 		 390 aa  313  1.9999999999999998e-84  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00729386  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0215  homogentisate 1,2-dioxygenase  42.19 
 
 		 390 aa  314  1.9999999999999998e-84  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0276  putative homogentisate 1,2-dioxygenase  42.19 
 
 		 390 aa  314  1.9999999999999998e-84  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000242533  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0221  homogentisate 12-dioxygenase  42.19 
 
 		 390 aa  313  1.9999999999999998e-84  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0255  putative homogentisate 1,2-dioxygenase  42.19 
 
 		 390 aa  314  1.9999999999999998e-84  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0228  homogentisate 1,2-dioxygenase  42.19 
 
 		 390 aa  313  2.9999999999999996e-84  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0242  homogentisate 1,2-dioxygenase  42.19 
 
 		 390 aa  313  2.9999999999999996e-84  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0230  homogentisate 12-dioxygenase  41.41 
 
 		 390 aa  312  4.999999999999999e-84  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6321  homogentisate 12-dioxygenase  41.16 
 
 		 396 aa  311  9e-84  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02595  homogentisate 1,2-dioxygenase  42.34 
 
 		 386 aa  305  7e-82  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0728  homogentisate 1,2-dioxygenase  40.26 
 
 		 385 aa  292  7e-78  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0812  homogentisate 12-dioxygenase  41.28 
 
 		 393 aa  284  2.0000000000000002e-75  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18910  homogentisate 1,2-dioxygenase  40.15 
 
 		 406 aa  283  4.0000000000000003e-75  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0108464  normal  0.652013 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0657  homogentisate 1,2-dioxygenase  39.69 
 
 		 404 aa  279  5e-74  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1868  homogentisate 12-dioxygenase  38.85 
 
 		 402 aa  277  3e-73  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.501601  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0709  homogentisate 12-dioxygenase  37.82 
 
 		 397 aa  276  4e-73  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1684  homogentisate 12-dioxygenase  38.38 
 
 		 395 aa  276  4e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8845  homogentisate 1,2-dioxygenase, putative  37.79 
 
 		 389 aa  274  2.0000000000000002e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.57227 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4688  homogentisate 12-dioxygenase  38.44 
 
 		 388 aa  272  7e-72  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.378892  normal  0.704415 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3787  homogentisate 12-dioxygenase  38.38 
 
 		 407 aa  272  8.000000000000001e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1918  homogentisate 12-dioxygenase  39.7 
 
 		 401 aa  271  2e-71  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0204233  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07000  homogentisate 1,2-dioxygenase  38.54 
 
 		 399 aa  270  4e-71  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.126563 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0530  homogentisate 12-dioxygenase  37.32 
 
 		 406 aa  266  5.999999999999999e-70  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4258  homogentisate 1,2-dioxygenase  38.44 
 
 		 388 aa  265  1e-69  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0597877 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0088  homogentisate 12-dioxygenase  37.44 
 
 		 400 aa  264  2e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1107  homogentisate 12-dioxygenase  37.28 
 
 		 399 aa  263  3e-69  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.141602 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6468  homogentisate 12-dioxygenase  36.48 
 
 		 394 aa  258  1e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.213717 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10650  homogentisate 1,2-dioxygenase  35.49 
 
 		 434 aa  250  3e-65  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.233818  normal  0.424884 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3423  homogentisate 1,2-dioxygenase  35.01 
 
 		 385 aa  244  1.9999999999999999e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00233011  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3504  homogentisate 12-dioxygenase  35.01 
 
 		 385 aa  244  1.9999999999999999e-63  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.142046  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3572  homogentisate 12-dioxygenase  34.92 
 
 		 385 aa  244  3e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6552  homogentisate 12-dioxygenase  34.38 
 
 		 389 aa  233  3e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0724494  normal  0.194858 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3485  homogentisate 12-dioxygenase  33.07 
 
 		 385 aa  228  1e-58  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.306053  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1697  homogentisate 1,2-dioxygenase  31.33 
 
 		 379 aa  178  2e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.196029 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0961  putative oxidoreductase  29.38 
 
 		 378 aa  177  3e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003654  homogentisate 1,2-dioxygenase  29.82 
 
 		 364 aa  173  3.9999999999999995e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02178  hypothetical protein  28.79 
 
 		 376 aa  173  5e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1438  homogentisate 1,2-dioxygenase  28.73 
 
 		 372 aa  170  4e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0957  homogentisate 12-dioxygenase  29.17 
 
 		 373 aa  113  5e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.490105  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1897  homogentisate 1,2-dioxygenase  24.46 
 
 		 363 aa  102  1e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4463  homogentisate 1,2-dioxygenase  24.2 
 
 		 367 aa  93.2  7e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.100375 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1561  homogentisate 1,2-dioxygenase  24.53 
 
 		 368 aa  92.8  9e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1591  homogentisate 1,2-dioxygenase  24.53 
 
 		 368 aa  91.7  2e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1615  homogentisate 1,2-dioxygenase  24.53 
 
 		 368 aa  91.7  2e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.904651 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1025  homogentisate 1,2-dioxygenase  24.57 
 
 		 429 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.243336  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2336  homogentisate 1,2-dioxygenase  24.83 
 
 		 430 aa  78.6  0.0000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.829883  normal  0.673279 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2456  homogentisate 1,2-dioxygenase  23.45 
 
 		 452 aa  77.4  0.0000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1193  homogentisate 1,2-dioxygenase  24.11 
 
 		 453 aa  76.3  0.0000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.814651  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2833  homogentisate 1,2-dioxygenase  24.09 
 
 		 453 aa  75.5  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.385298  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0566  homogentisate 1,2-dioxygenase  23.26 
 
 		 449 aa  74.7  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.11982  normal  0.485064 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2532  homogentisate 1,2-dioxygenase  23.84 
 
 		 453 aa  73.2  0.000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1043  homogentisate 1,2-dioxygenase  26.81 
 
 		 450 aa  72.8  0.00000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0891  homogentisate 1,2-dioxygenase  23.02 
 
 		 448 aa  70.9  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.669112  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1018  homogentisate 1,2-dioxygenase  22.6 
 
 		 448 aa  71.2  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.266165 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1248  homogentisate 1,2-dioxygenase  21.56 
 
 		 416 aa  70.5  0.00000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2093  Homogentisate 1 2-dioxygenase-like protein  24.92 
 
 		 393 aa  70.5  0.00000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.6516  normal  0.270951 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0921  homogentisate 1,2-dioxygenase  25 
 
 		 448 aa  70.1  0.00000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0913  homogentisate 1,2-dioxygenase  25.28 
 
 		 453 aa  69.3  0.00000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.994604  normal  0.237981 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3547  homogentisate 1,2-dioxygenase  25.28 
 
 		 453 aa  69.3  0.00000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.294103 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1248  homogentisate 1,2-dioxygenase  21.56 
 
 		 416 aa  68.9  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3923  homogentisate 1,2-dioxygenase  24.55 
 
 		 468 aa  69.3  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1511  homogentisate 1,2-dioxygenase  24.45 
 
 		 453 aa  68.2  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.000621512  normal  0.470006 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3333  homogentisate 1,2-dioxygenase  22.83 
 
 		 455 aa  68.2  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1407  homogentisate 1,2-dioxygenase  25 
 
 		 453 aa  68.2  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.818209 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4374  homogentisate 1,2-dioxygenase  24.64 
 
 		 442 aa  67.8  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000328355  normal  0.761675 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1557  homogentisate 1,2-dioxygenase  26.09 
 
 		 438 aa  67.4  0.0000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.474294 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5153  homogentisate 1,2-dioxygenase  22.96 
 
 		 448 aa  67  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.424959  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3652  homogentisate 1,2-dioxygenase  24.1 
 
 		 427 aa  67  0.0000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.207248 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2725  homogentisate 1,2-dioxygenase  23.55 
 
 		 431 aa  67  0.0000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00241736  normal  0.0920445 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3913  homogentisate 1,2-dioxygenase  23.83 
 
 		 444 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0907  homogentisate 1,2-dioxygenase  22.52 
 
 		 448 aa  65.5  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.78575  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1439  homogentisate 1,2-dioxygenase  24.31 
 
 		 460 aa  65.9  0.000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2621  homogentisate 1,2-dioxygenase  24.8 
 
 		 451 aa  65.5  0.000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.783486 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0289  homogentisate 1,2-dioxygenase  23.72 
 
 		 437 aa  65.1  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.36661  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02539  homogentisate 1,2-dioxygenase  23.14 
 
 		 454 aa  64.7  0.000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000365945  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2435  homogentisate 1,2-dioxygenase  23.47 
 
 		 440 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.125362  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2997  homogentisate 1,2-dioxygenase  24.91 
 
 		 434 aa  64.7  0.000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.45322 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>