143 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_18910 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_18910  homogentisate 1,2-dioxygenase  100 
 
 		 406 aa  833    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0108464  normal  0.652013 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07000  homogentisate 1,2-dioxygenase  73.79 
 
 		 399 aa  607  9.999999999999999e-173  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.126563 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1868  homogentisate 12-dioxygenase  73.12 
 
 		 402 aa  602  1.0000000000000001e-171  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.501601  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1918  homogentisate 12-dioxygenase  73.42 
 
 		 401 aa  598  1e-170  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0204233  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0657  homogentisate 1,2-dioxygenase  73.48 
 
 		 404 aa  587  1e-167  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1107  homogentisate 12-dioxygenase  70.2 
 
 		 399 aa  577  1.0000000000000001e-163  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.141602 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0530  homogentisate 12-dioxygenase  69.73 
 
 		 406 aa  570  1e-161  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10650  homogentisate 1,2-dioxygenase  65.37 
 
 		 434 aa  553  1e-156  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.233818  normal  0.424884 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1684  homogentisate 12-dioxygenase  64.02 
 
 		 395 aa  515  1.0000000000000001e-145  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3787  homogentisate 12-dioxygenase  66.15 
 
 		 407 aa  516  1.0000000000000001e-145  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0088  homogentisate 12-dioxygenase  62.31 
 
 		 400 aa  498  1e-140  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4688  homogentisate 12-dioxygenase  62.88 
 
 		 388 aa  487  1e-136  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.378892  normal  0.704415 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4258  homogentisate 1,2-dioxygenase  62.18 
 
 		 388 aa  478  1e-134  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0597877 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6468  homogentisate 12-dioxygenase  58.73 
 
 		 394 aa  475  1e-133  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.213717 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8845  homogentisate 1,2-dioxygenase, putative  60.05 
 
 		 389 aa  474  1e-133  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.57227 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0709  homogentisate 12-dioxygenase  55.69 
 
 		 397 aa  439  9.999999999999999e-123  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0812  homogentisate 12-dioxygenase  52.3 
 
 		 393 aa  409  1e-113  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2762  homogentisate 12-dioxygenase  47.72 
 
 		 385 aa  372  1e-102  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000862823  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0230  homogentisate 12-dioxygenase  48.35 
 
 		 390 aa  363  3e-99  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5068  putative homogentisate 1,2-dioxygenase  47.19 
 
 		 390 aa  362  9e-99  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00282868  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0276  putative homogentisate 1,2-dioxygenase  47.84 
 
 		 390 aa  361  1e-98  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000242533  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0215  homogentisate 1,2-dioxygenase  47.84 
 
 		 390 aa  361  1e-98  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0217  homogentisate 1,2-dioxygenase  47.84 
 
 		 390 aa  361  1e-98  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0257  putative homogentisate 1,2-dioxygenase  47.58 
 
 		 392 aa  361  1e-98  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000636938  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0255  putative homogentisate 1,2-dioxygenase  47.84 
 
 		 390 aa  360  2e-98  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0262  homogentisate 1,2-dioxygenase, putative  47.84 
 
 		 390 aa  360  2e-98  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00729386  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0228  homogentisate 1,2-dioxygenase  47.84 
 
 		 390 aa  360  2e-98  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0242  homogentisate 1,2-dioxygenase  47.84 
 
 		 390 aa  360  2e-98  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0221  homogentisate 12-dioxygenase  47.84 
 
 		 390 aa  359  4e-98  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3805  homogentisate 12-dioxygenase  47.86 
 
 		 388 aa  349  6e-95  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00200515  normal  0.427722 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5427  homogentisate 12-dioxygenase  46.35 
 
 		 385 aa  346  5e-94  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0911564  normal  0.337883 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3280  homogentisate 12-dioxygenase  46.1 
 
 		 385 aa  341  1e-92  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.524985 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02595  homogentisate 1,2-dioxygenase  43.29 
 
 		 386 aa  326  5e-88  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6321  homogentisate 12-dioxygenase  42.89 
 
 		 396 aa  321  9.999999999999999e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2106  homogentisate 12-dioxygenase  45.14 
 
 		 385 aa  314  9.999999999999999e-85  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0415029  normal  0.565208 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0728  homogentisate 1,2-dioxygenase  42.46 
 
 		 385 aa  307  2.0000000000000002e-82  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2154  homogentisate 1,2-dioxygenase  40.82 
 
 		 386 aa  300  3e-80  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.634063 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1874  homogentisate 12-dioxygenase  41.33 
 
 		 386 aa  299  7e-80  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2363  homogentisate 1,2-dioxygenase  42.21 
 
 		 386 aa  297  2e-79  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.445339  normal  0.275941 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2291  homogentisate 1,2-dioxygenase  41.31 
 
 		 386 aa  296  6e-79  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000437513  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1732  homogentisate 12-dioxygenase  40.81 
 
 		 386 aa  295  1e-78  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00561061 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1963  hypothetical protein  42.21 
 
 		 386 aa  293  3e-78  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2326  homogentisate 1,2-dioxygenase  39.95 
 
 		 386 aa  293  3e-78  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1671  homogentisate 1,2-dioxygenase  40.81 
 
 		 386 aa  293  5e-78  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.991879  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2481  homogentisate 1,2-dioxygenase  41.06 
 
 		 386 aa  292  9e-78  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.59318  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2615  homogentisate 12-dioxygenase  40.55 
 
 		 386 aa  291  1e-77  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0308121  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2653  homogentisate 12-dioxygenase  40.55 
 
 		 386 aa  291  2e-77  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.51516  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2728  homogentisate 12-dioxygenase  40.55 
 
 		 386 aa  290  2e-77  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.315515  normal  0.247333 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2162  homogentisate 1,2-dioxygenase  40.35 
 
 		 386 aa  290  4e-77  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1569  homogentisate 1,2-dioxygenase  40.31 
 
 		 386 aa  287  2e-76  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2369  homogentisate 12-dioxygenase  40.15 
 
 		 384 aa  283  4.0000000000000003e-75  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3504  homogentisate 12-dioxygenase  38.83 
 
 		 385 aa  243  5e-63  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.142046  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3572  homogentisate 12-dioxygenase  38.32 
 
 		 385 aa  242  7e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3423  homogentisate 1,2-dioxygenase  38.83 
 
 		 385 aa  241  2e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00233011  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6552  homogentisate 12-dioxygenase  36.99 
 
 		 389 aa  236  5.0000000000000005e-61  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0724494  normal  0.194858 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3485  homogentisate 12-dioxygenase  36.13 
 
 		 385 aa  230  3e-59  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.306053  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1697  homogentisate 1,2-dioxygenase  34.53 
 
 		 379 aa  170  5e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.196029 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0961  putative oxidoreductase  31.16 
 
 		 378 aa  167  4e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003654  homogentisate 1,2-dioxygenase  31.81 
 
 		 364 aa  159  9e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1438  homogentisate 1,2-dioxygenase  32.27 
 
 		 372 aa  157  3e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02178  hypothetical protein  31.28 
 
 		 376 aa  156  7e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1897  homogentisate 1,2-dioxygenase  31.61 
 
 		 363 aa  131  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4463  homogentisate 1,2-dioxygenase  31.89 
 
 		 367 aa  129  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.100375 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0957  homogentisate 12-dioxygenase  31.6 
 
 		 373 aa  127  5e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.490105  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1591  homogentisate 1,2-dioxygenase  31.09 
 
 		 368 aa  117  3e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1615  homogentisate 1,2-dioxygenase  31.09 
 
 		 368 aa  117  3e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.904651 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1561  homogentisate 1,2-dioxygenase  30.39 
 
 		 368 aa  116  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4302  homogentisate 1,2-dioxygenase  27 
 
 		 443 aa  82  0.00000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2997  homogentisate 1,2-dioxygenase  28.27 
 
 		 434 aa  77  0.0000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.45322 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0289  homogentisate 1,2-dioxygenase  25.64 
 
 		 437 aa  75.9  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.36661  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01897  Homogentisate 1,2-dioxygenase (EC 1.13.11.5)(Homogentisic acid oxidase)(Homogentisate oxygenase)(Homogentisicase) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q00667]  27.24 
 
 		 448 aa  72.4  0.00000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1025  homogentisate 1,2-dioxygenase  28.35 
 
 		 429 aa  72  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.243336  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1018  homogentisate 1,2-dioxygenase  25.42 
 
 		 448 aa  68.2  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.266165 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06390  homogentisate 1,2-dioxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G10810)  27.84 
 
 		 462 aa  67.4  0.0000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.224544  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0907  homogentisate 1,2-dioxygenase  25.6 
 
 		 448 aa  67.4  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.78575  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0921  homogentisate 1,2-dioxygenase  29.55 
 
 		 448 aa  67  0.0000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02539  homogentisate 1,2-dioxygenase  29.73 
 
 		 454 aa  65.9  0.000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000365945  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4374  homogentisate 1,2-dioxygenase  25.46 
 
 		 442 aa  65.5  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000328355  normal  0.761675 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0566  homogentisate 1,2-dioxygenase  27.64 
 
 		 449 aa  65.1  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.11982  normal  0.485064 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1043  homogentisate 1,2-dioxygenase  28.91 
 
 		 450 aa  64.3  0.000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3333  homogentisate 1,2-dioxygenase  26.79 
 
 		 455 aa  64.3  0.000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3652  homogentisate 1,2-dioxygenase  29.83 
 
 		 427 aa  64.3  0.000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.207248 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0891  homogentisate 1,2-dioxygenase  26.67 
 
 		 448 aa  63.9  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.669112  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5153  homogentisate 1,2-dioxygenase  26.44 
 
 		 448 aa  63.2  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.424959  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3864  homogentisate 1,2-dioxygenase  28.37 
 
 		 442 aa  63.2  0.000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.412305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2738  homogentisate 1,2-dioxygenase  30.11 
 
 		 441 aa  62.4  0.00000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2336  homogentisate 1,2-dioxygenase  26.61 
 
 		 430 aa  62.4  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.829883  normal  0.673279 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2456  homogentisate 1,2-dioxygenase  27.53 
 
 		 452 aa  62.4  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1193  homogentisate 1,2-dioxygenase  28.4 
 
 		 453 aa  62  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.814651  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0994  homogentisate 1,2-dioxygenase  25.21 
 
 		 454 aa  59.7  0.00000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1248  homogentisate 1,2-dioxygenase  25.87 
 
 		 416 aa  59.7  0.0000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38510  homogentisate 1,2-dioxygenase  27.12 
 
 		 432 aa  59.3  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00419964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3280  homogentisate 1,2-dioxygenase  26.14 
 
 		 432 aa  59.3  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.645052  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0789  homogentisate 1,2-dioxygenase  27.44 
 
 		 444 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.211762  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0337  homogentisate 1,2-dioxygenase  27.44 
 
 		 444 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0701  homogentisate 1,2-dioxygenase  27.44 
 
 		 444 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0820  homogentisate 1,2-dioxygenase  27.44 
 
 		 444 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.623719  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0913  homogentisate 1,2-dioxygenase  25 
 
 		 453 aa  58.9  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.994604  normal  0.237981 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3547  homogentisate 1,2-dioxygenase  25 
 
 		 453 aa  58.9  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.294103 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2532  homogentisate 1,2-dioxygenase  27.73 
 
 		 453 aa  58.5  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>