145 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_2481 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_1963  hypothetical protein  97.41 
 
 		 386 aa  791    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2162  homogentisate 1,2-dioxygenase  86.01 
 
 		 386 aa  716    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2291  homogentisate 1,2-dioxygenase  98.96 
 
 		 386 aa  804    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000437513  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2363  homogentisate 1,2-dioxygenase  98.96 
 
 		 386 aa  803    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.445339  normal  0.275941 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2326  homogentisate 1,2-dioxygenase  85.49 
 
 		 386 aa  719    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2481  homogentisate 1,2-dioxygenase  100 
 
 		 386 aa  811    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.59318  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1569  homogentisate 1,2-dioxygenase  88.34 
 
 		 386 aa  725    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2615  homogentisate 12-dioxygenase  93.52 
 
 		 386 aa  771    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0308121  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2154  homogentisate 1,2-dioxygenase  85.49 
 
 		 386 aa  725    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.634063 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1671  homogentisate 1,2-dioxygenase  93.78 
 
 		 386 aa  773    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.991879  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2653  homogentisate 12-dioxygenase  93.01 
 
 		 386 aa  770    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.51516  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1874  homogentisate 12-dioxygenase  83.68 
 
 		 386 aa  704    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2728  homogentisate 12-dioxygenase  93.01 
 
 		 386 aa  768    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.315515  normal  0.247333 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1732  homogentisate 12-dioxygenase  93.52 
 
 		 386 aa  770    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00561061 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0257  putative homogentisate 1,2-dioxygenase  45.99 
 
 		 392 aa  368  1e-101  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000636938  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0228  homogentisate 1,2-dioxygenase  45.85 
 
 		 390 aa  365  1e-100  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0217  homogentisate 1,2-dioxygenase  45.85 
 
 		 390 aa  366  1e-100  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0242  homogentisate 1,2-dioxygenase  45.85 
 
 		 390 aa  365  1e-100  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5068  putative homogentisate 1,2-dioxygenase  45.99 
 
 		 390 aa  366  1e-100  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00282868  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0221  homogentisate 12-dioxygenase  45.85 
 
 		 390 aa  366  1e-100  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0262  homogentisate 1,2-dioxygenase, putative  45.85 
 
 		 390 aa  364  1e-99  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00729386  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0215  homogentisate 1,2-dioxygenase  45.85 
 
 		 390 aa  364  1e-99  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0276  putative homogentisate 1,2-dioxygenase  45.85 
 
 		 390 aa  365  1e-99  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000242533  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0255  putative homogentisate 1,2-dioxygenase  45.85 
 
 		 390 aa  364  1e-99  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0230  homogentisate 12-dioxygenase  45.08 
 
 		 390 aa  363  3e-99  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5427  homogentisate 12-dioxygenase  47.8 
 
 		 385 aa  361  1e-98  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0911564  normal  0.337883 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3280  homogentisate 12-dioxygenase  47.16 
 
 		 385 aa  356  3.9999999999999996e-97  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.524985 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3805  homogentisate 12-dioxygenase  47 
 
 		 388 aa  355  7.999999999999999e-97  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00200515  normal  0.427722 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02595  homogentisate 1,2-dioxygenase  46.15 
 
 		 386 aa  347  1e-94  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2762  homogentisate 12-dioxygenase  45.34 
 
 		 385 aa  346  3e-94  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000862823  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2369  homogentisate 12-dioxygenase  43.52 
 
 		 384 aa  327  2.0000000000000001e-88  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6321  homogentisate 12-dioxygenase  43.39 
 
 		 396 aa  325  1e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2106  homogentisate 12-dioxygenase  45.48 
 
 		 385 aa  324  1e-87  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0415029  normal  0.565208 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0728  homogentisate 1,2-dioxygenase  43.99 
 
 		 385 aa  324  2e-87  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0709  homogentisate 12-dioxygenase  42.07 
 
 		 397 aa  301  2e-80  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1918  homogentisate 12-dioxygenase  41.09 
 
 		 401 aa  296  4e-79  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0204233  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0657  homogentisate 1,2-dioxygenase  41.94 
 
 		 404 aa  295  8e-79  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18910  homogentisate 1,2-dioxygenase  41.06 
 
 		 406 aa  292  8e-78  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0108464  normal  0.652013 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0088  homogentisate 12-dioxygenase  39.65 
 
 		 400 aa  291  9e-78  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8845  homogentisate 1,2-dioxygenase, putative  40.66 
 
 		 389 aa  290  4e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.57227 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10650  homogentisate 1,2-dioxygenase  40.14 
 
 		 434 aa  289  6e-77  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.233818  normal  0.424884 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0812  homogentisate 12-dioxygenase  40.83 
 
 		 393 aa  289  7e-77  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1107  homogentisate 12-dioxygenase  40.65 
 
 		 399 aa  288  1e-76  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.141602 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1684  homogentisate 12-dioxygenase  39.7 
 
 		 395 aa  287  2.9999999999999996e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3787  homogentisate 12-dioxygenase  41.01 
 
 		 407 aa  286  2.9999999999999996e-76  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07000  homogentisate 1,2-dioxygenase  39 
 
 		 399 aa  283  3.0000000000000004e-75  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.126563 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1868  homogentisate 12-dioxygenase  39.85 
 
 		 402 aa  281  1e-74  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.501601  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0530  homogentisate 12-dioxygenase  39.31 
 
 		 406 aa  277  3e-73  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6468  homogentisate 12-dioxygenase  38.13 
 
 		 394 aa  273  4.0000000000000004e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.213717 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4688  homogentisate 12-dioxygenase  39.95 
 
 		 388 aa  263  4e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.378892  normal  0.704415 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4258  homogentisate 1,2-dioxygenase  41.11 
 
 		 388 aa  261  1e-68  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0597877 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3572  homogentisate 12-dioxygenase  37.86 
 
 		 385 aa  255  1.0000000000000001e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3423  homogentisate 1,2-dioxygenase  37.86 
 
 		 385 aa  255  1.0000000000000001e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00233011  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3504  homogentisate 12-dioxygenase  37.76 
 
 		 385 aa  254  2.0000000000000002e-66  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.142046  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6552  homogentisate 12-dioxygenase  36.25 
 
 		 389 aa  249  4e-65  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0724494  normal  0.194858 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3485  homogentisate 12-dioxygenase  36.72 
 
 		 385 aa  245  9.999999999999999e-64  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.306053  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003654  homogentisate 1,2-dioxygenase  33.89 
 
 		 364 aa  166  4e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0961  putative oxidoreductase  34.33 
 
 		 378 aa  166  6.9999999999999995e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02178  hypothetical protein  30.83 
 
 		 376 aa  164  3e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1697  homogentisate 1,2-dioxygenase  30.49 
 
 		 379 aa  158  2e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.196029 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1438  homogentisate 1,2-dioxygenase  31.88 
 
 		 372 aa  152  8e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0957  homogentisate 12-dioxygenase  29.08 
 
 		 373 aa  123  7e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.490105  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4463  homogentisate 1,2-dioxygenase  26.63 
 
 		 367 aa  117  3e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.100375 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1897  homogentisate 1,2-dioxygenase  26.5 
 
 		 363 aa  113  6e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1591  homogentisate 1,2-dioxygenase  27.07 
 
 		 368 aa  109  7.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1615  homogentisate 1,2-dioxygenase  27.07 
 
 		 368 aa  109  7.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.904651 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1561  homogentisate 1,2-dioxygenase  26.78 
 
 		 368 aa  107  5e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2725  homogentisate 1,2-dioxygenase  26.14 
 
 		 431 aa  76.3  0.0000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00241736  normal  0.0920445 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3326  homogentisate 1,2-dioxygenase  26.32 
 
 		 434 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0214185 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3551  homogentisate 1,2-dioxygenase  24.26 
 
 		 434 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.518718  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2997  homogentisate 1,2-dioxygenase  26.38 
 
 		 434 aa  71.6  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.45322 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0994  homogentisate 1,2-dioxygenase  25.48 
 
 		 454 aa  72  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06390  homogentisate 1,2-dioxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G10810)  25.35 
 
 		 462 aa  71.2  0.00000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.224544  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1025  homogentisate 1,2-dioxygenase  26.09 
 
 		 429 aa  70.1  0.00000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.243336  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4621  homogentisate 1,2-dioxygenase  23.51 
 
 		 433 aa  69.7  0.00000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.356023  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0337  homogentisate 1,2-dioxygenase  26.06 
 
 		 444 aa  69.3  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0820  homogentisate 1,2-dioxygenase  26.06 
 
 		 444 aa  69.3  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.623719  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1397  homogentisate 1,2-dioxygenase  26.01 
 
 		 450 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.762264  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0289  homogentisate 1,2-dioxygenase  26.8 
 
 		 437 aa  69.3  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.36661  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0701  homogentisate 1,2-dioxygenase  26.06 
 
 		 444 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2056  homogentisate 1,2-dioxygenase  25.83 
 
 		 450 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3228  homogentisate 1,2-dioxygenase  25.83 
 
 		 450 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0856  homogentisate 1,2-dioxygenase  25.83 
 
 		 450 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.789962  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2688  homogentisate 1,2-dioxygenase  25.83 
 
 		 450 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.515143  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3174  homogentisate 1,2-dioxygenase  25.83 
 
 		 444 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.666135  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3213  homogentisate 1,2-dioxygenase  25.83 
 
 		 450 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1921  homogentisate 1,2-dioxygenase  25.83 
 
 		 450 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.884358  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4605  homogentisate 1,2-dioxygenase  22.52 
 
 		 433 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0198539  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0718  homogentisate 1,2-dioxygenase  26.06 
 
 		 444 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.10992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4481  homogentisate 1,2-dioxygenase  23.51 
 
 		 433 aa  67.8  0.0000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.518935  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04215  homogentisate 1,2-dioxygenase  24.59 
 
 		 441 aa  67.4  0.0000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0789  homogentisate 1,2-dioxygenase  25.7 
 
 		 444 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.211762  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4374  homogentisate 1,2-dioxygenase  24.81 
 
 		 442 aa  66.6  0.0000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000328355  normal  0.761675 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1557  homogentisate 1,2-dioxygenase  28.51 
 
 		 438 aa  66.6  0.0000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.474294 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0691  homogentisate 1,2-dioxygenase  26.41 
 
 		 448 aa  66.2  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.398963 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3913  homogentisate 1,2-dioxygenase  25.35 
 
 		 444 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2563  homogentisate 1,2-dioxygenase  26.16 
 
 		 444 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0907  homogentisate 1,2-dioxygenase  27.37 
 
 		 448 aa  65.5  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.78575  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4534  homogentisate 1,2-dioxygenase  25.35 
 
 		 448 aa  65.1  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.233345  normal  0.576048 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3333  homogentisate 1,2-dioxygenase  26.64 
 
 		 455 aa  65.1  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>