142 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_2762 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_2762  homogentisate 12-dioxygenase  100 
 
 		 385 aa  789    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000862823  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0230  homogentisate 12-dioxygenase  65.09 
 
 		 390 aa  532  1e-150  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0217  homogentisate 1,2-dioxygenase  64.83 
 
 		 390 aa  528  1e-149  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5068  putative homogentisate 1,2-dioxygenase  64.57 
 
 		 390 aa  525  1e-148  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00282868  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0262  homogentisate 1,2-dioxygenase, putative  64.57 
 
 		 390 aa  526  1e-148  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00729386  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0228  homogentisate 1,2-dioxygenase  64.57 
 
 		 390 aa  525  1e-148  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0215  homogentisate 1,2-dioxygenase  64.83 
 
 		 390 aa  527  1e-148  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0242  homogentisate 1,2-dioxygenase  64.57 
 
 		 390 aa  525  1e-148  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0255  putative homogentisate 1,2-dioxygenase  64.83 
 
 		 390 aa  527  1e-148  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0276  putative homogentisate 1,2-dioxygenase  64.83 
 
 		 390 aa  527  1e-148  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000242533  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0221  homogentisate 12-dioxygenase  64.3 
 
 		 390 aa  525  1e-148  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0257  putative homogentisate 1,2-dioxygenase  64.83 
 
 		 392 aa  525  1e-148  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000636938  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3805  homogentisate 12-dioxygenase  60.99 
 
 		 388 aa  493  9.999999999999999e-139  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00200515  normal  0.427722 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5427  homogentisate 12-dioxygenase  58.07 
 
 		 385 aa  470  1.0000000000000001e-131  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0911564  normal  0.337883 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3280  homogentisate 12-dioxygenase  53.91 
 
 		 385 aa  442  1e-123  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.524985 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02595  homogentisate 1,2-dioxygenase  53.89 
 
 		 386 aa  442  1e-123  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6321  homogentisate 12-dioxygenase  53.67 
 
 		 396 aa  432  1e-120  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0728  homogentisate 1,2-dioxygenase  52.6 
 
 		 385 aa  429  1e-119  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2106  homogentisate 12-dioxygenase  54.52 
 
 		 385 aa  429  1e-119  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0415029  normal  0.565208 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6468  homogentisate 12-dioxygenase  53.47 
 
 		 394 aa  404  1e-111  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.213717 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0088  homogentisate 12-dioxygenase  52.15 
 
 		 400 aa  402  1e-111  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8845  homogentisate 1,2-dioxygenase, putative  51.4 
 
 		 389 aa  391  1e-108  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.57227 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4688  homogentisate 12-dioxygenase  52.94 
 
 		 388 aa  390  1e-107  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.378892  normal  0.704415 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0709  homogentisate 12-dioxygenase  50.25 
 
 		 397 aa  386  1e-106  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4258  homogentisate 1,2-dioxygenase  52.94 
 
 		 388 aa  388  1e-106  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0597877 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1684  homogentisate 12-dioxygenase  52.01 
 
 		 395 aa  386  1e-106  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1918  homogentisate 12-dioxygenase  49.62 
 
 		 401 aa  374  1e-102  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0204233  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18910  homogentisate 1,2-dioxygenase  47.72 
 
 		 406 aa  372  1e-102  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0108464  normal  0.652013 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0657  homogentisate 1,2-dioxygenase  49.36 
 
 		 404 aa  370  1e-101  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2326  homogentisate 1,2-dioxygenase  46.61 
 
 		 386 aa  365  1e-100  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0812  homogentisate 12-dioxygenase  49.22 
 
 		 393 aa  364  1e-99  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1107  homogentisate 12-dioxygenase  49.24 
 
 		 399 aa  362  8e-99  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.141602 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1569  homogentisate 1,2-dioxygenase  46.35 
 
 		 386 aa  361  9e-99  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2154  homogentisate 1,2-dioxygenase  45.57 
 
 		 386 aa  359  4e-98  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.634063 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2162  homogentisate 1,2-dioxygenase  45.83 
 
 		 386 aa  359  5e-98  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07000  homogentisate 1,2-dioxygenase  47.46 
 
 		 399 aa  357  9.999999999999999e-98  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.126563 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1874  homogentisate 12-dioxygenase  45.57 
 
 		 386 aa  358  9.999999999999999e-98  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2615  homogentisate 12-dioxygenase  45.85 
 
 		 386 aa  355  6.999999999999999e-97  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0308121  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2653  homogentisate 12-dioxygenase  45.57 
 
 		 386 aa  355  7.999999999999999e-97  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.51516  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1671  homogentisate 1,2-dioxygenase  45.31 
 
 		 386 aa  355  1e-96  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.991879  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3787  homogentisate 12-dioxygenase  48.1 
 
 		 407 aa  353  2e-96  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2363  homogentisate 1,2-dioxygenase  45.85 
 
 		 386 aa  353  4e-96  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.445339  normal  0.275941 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1732  homogentisate 12-dioxygenase  45.05 
 
 		 386 aa  352  5e-96  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00561061 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2728  homogentisate 12-dioxygenase  45.31 
 
 		 386 aa  352  5.9999999999999994e-96  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.315515  normal  0.247333 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2291  homogentisate 1,2-dioxygenase  46.11 
 
 		 386 aa  352  8e-96  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000437513  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1868  homogentisate 12-dioxygenase  46.6 
 
 		 402 aa  351  1e-95  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.501601  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1963  hypothetical protein  45.34 
 
 		 386 aa  348  8e-95  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2481  homogentisate 1,2-dioxygenase  45.34 
 
 		 386 aa  346  3e-94  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.59318  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0530  homogentisate 12-dioxygenase  45.48 
 
 		 406 aa  341  1e-92  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10650  homogentisate 1,2-dioxygenase  44.77 
 
 		 434 aa  338  9.999999999999999e-92  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.233818  normal  0.424884 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2369  homogentisate 12-dioxygenase  42.86 
 
 		 384 aa  330  2e-89  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6552  homogentisate 12-dioxygenase  42.93 
 
 		 389 aa  310  2e-83  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0724494  normal  0.194858 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3423  homogentisate 1,2-dioxygenase  43.16 
 
 		 385 aa  295  6e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00233011  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3572  homogentisate 12-dioxygenase  43.16 
 
 		 385 aa  294  1e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3485  homogentisate 12-dioxygenase  43.01 
 
 		 385 aa  294  1e-78  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.306053  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3504  homogentisate 12-dioxygenase  43.16 
 
 		 385 aa  295  1e-78  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.142046  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0961  putative oxidoreductase  32.31 
 
 		 378 aa  193  4e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1697  homogentisate 1,2-dioxygenase  34.71 
 
 		 379 aa  187  3e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.196029 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02178  hypothetical protein  31.97 
 
 		 376 aa  186  7e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1438  homogentisate 1,2-dioxygenase  34.07 
 
 		 372 aa  186  8e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003654  homogentisate 1,2-dioxygenase  31.3 
 
 		 364 aa  177  2e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0957  homogentisate 12-dioxygenase  31.94 
 
 		 373 aa  140  3.9999999999999997e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.490105  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4463  homogentisate 1,2-dioxygenase  31.29 
 
 		 367 aa  135  8e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.100375 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1897  homogentisate 1,2-dioxygenase  30.97 
 
 		 363 aa  134  3e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1591  homogentisate 1,2-dioxygenase  29.82 
 
 		 368 aa  121  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1615  homogentisate 1,2-dioxygenase  29.82 
 
 		 368 aa  121  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.904651 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1561  homogentisate 1,2-dioxygenase  29.82 
 
 		 368 aa  121  3e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2336  homogentisate 1,2-dioxygenase  28.91 
 
 		 430 aa  79.3  0.0000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.829883  normal  0.673279 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0566  homogentisate 1,2-dioxygenase  25.35 
 
 		 449 aa  77.4  0.0000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.11982  normal  0.485064 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0921  homogentisate 1,2-dioxygenase  27.87 
 
 		 448 aa  73.2  0.000000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1043  homogentisate 1,2-dioxygenase  25 
 
 		 450 aa  71.6  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2456  homogentisate 1,2-dioxygenase  27.27 
 
 		 452 aa  71.2  0.00000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1193  homogentisate 1,2-dioxygenase  26.77 
 
 		 453 aa  70.9  0.00000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.814651  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1511  homogentisate 1,2-dioxygenase  26.69 
 
 		 453 aa  69.7  0.00000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.000621512  normal  0.470006 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1407  homogentisate 1,2-dioxygenase  26.35 
 
 		 453 aa  68.2  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.818209 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0913  homogentisate 1,2-dioxygenase  23.45 
 
 		 453 aa  68.6  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.994604  normal  0.237981 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3547  homogentisate 1,2-dioxygenase  23.45 
 
 		 453 aa  68.6  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.294103 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02539  homogentisate 1,2-dioxygenase  26.89 
 
 		 454 aa  67.8  0.0000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000365945  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0994  homogentisate 1,2-dioxygenase  23.4 
 
 		 454 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2532  homogentisate 1,2-dioxygenase  27.27 
 
 		 453 aa  67.4  0.0000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1018  homogentisate 1,2-dioxygenase  24.15 
 
 		 448 aa  67.4  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.266165 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0701  homogentisate 1,2-dioxygenase  24.24 
 
 		 444 aa  67.4  0.0000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1025  homogentisate 1,2-dioxygenase  24.74 
 
 		 429 aa  66.2  0.0000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.243336  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4374  homogentisate 1,2-dioxygenase  24.08 
 
 		 442 aa  65.9  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000328355  normal  0.761675 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3333  homogentisate 1,2-dioxygenase  23.94 
 
 		 455 aa  66.2  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3738  homogentisate 1,2-dioxygenase  25.63 
 
 		 432 aa  65.1  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.333429  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5153  homogentisate 1,2-dioxygenase  24.65 
 
 		 448 aa  64.3  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.424959  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0718  homogentisate 1,2-dioxygenase  24.01 
 
 		 444 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.10992  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01897  Homogentisate 1,2-dioxygenase (EC 1.13.11.5)(Homogentisic acid oxidase)(Homogentisate oxygenase)(Homogentisicase) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q00667]  24.49 
 
 		 448 aa  63.9  0.000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1397  homogentisate 1,2-dioxygenase  24.41 
 
 		 450 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.762264  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0907  homogentisate 1,2-dioxygenase  24.65 
 
 		 448 aa  63.9  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.78575  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2563  homogentisate 1,2-dioxygenase  23.24 
 
 		 444 aa  63.9  0.000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2056  homogentisate 1,2-dioxygenase  24.83 
 
 		 450 aa  63.5  0.000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3228  homogentisate 1,2-dioxygenase  24.83 
 
 		 450 aa  63.5  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0856  homogentisate 1,2-dioxygenase  24.83 
 
 		 450 aa  63.5  0.000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.789962  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2688  homogentisate 1,2-dioxygenase  24.83 
 
 		 450 aa  63.5  0.000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.515143  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3174  homogentisate 1,2-dioxygenase  24.83 
 
 		 444 aa  63.5  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.666135  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3213  homogentisate 1,2-dioxygenase  24.83 
 
 		 450 aa  63.5  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1921  homogentisate 1,2-dioxygenase  24.83 
 
 		 450 aa  63.5  0.000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.884358  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1439  homogentisate 1,2-dioxygenase  24.44 
 
 		 460 aa  63.2  0.000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>