143 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_0530 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_0530  homogentisate 12-dioxygenase  100 
 
 		 406 aa  818    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1918  homogentisate 12-dioxygenase  74.94 
 
 		 401 aa  619  1e-176  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0204233  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07000  homogentisate 1,2-dioxygenase  71.5 
 
 		 399 aa  597  1e-170  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.126563 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1868  homogentisate 12-dioxygenase  71.29 
 
 		 402 aa  580  1e-164  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.501601  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0657  homogentisate 1,2-dioxygenase  70.49 
 
 		 404 aa  577  1.0000000000000001e-163  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18910  homogentisate 1,2-dioxygenase  69.98 
 
 		 406 aa  574  1.0000000000000001e-162  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0108464  normal  0.652013 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10650  homogentisate 1,2-dioxygenase  64.99 
 
 		 434 aa  549  1e-155  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.233818  normal  0.424884 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1107  homogentisate 12-dioxygenase  66.67 
 
 		 399 aa  547  1e-154  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.141602 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1684  homogentisate 12-dioxygenase  64.56 
 
 		 395 aa  534  1e-150  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3787  homogentisate 12-dioxygenase  67 
 
 		 407 aa  521  1e-146  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0088  homogentisate 12-dioxygenase  62.9 
 
 		 400 aa  496  1e-139  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4258  homogentisate 1,2-dioxygenase  60.59 
 
 		 388 aa  478  1e-134  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0597877 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4688  homogentisate 12-dioxygenase  60.74 
 
 		 388 aa  478  1e-134  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.378892  normal  0.704415 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6468  homogentisate 12-dioxygenase  58.42 
 
 		 394 aa  479  1e-134  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.213717 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8845  homogentisate 1,2-dioxygenase, putative  56.02 
 
 		 389 aa  453  1.0000000000000001e-126  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.57227 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0709  homogentisate 12-dioxygenase  53.25 
 
 		 397 aa  423  1e-117  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0812  homogentisate 12-dioxygenase  51.72 
 
 		 393 aa  407  1.0000000000000001e-112  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0228  homogentisate 1,2-dioxygenase  47.52 
 
 		 390 aa  369  1e-101  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0215  homogentisate 1,2-dioxygenase  47.52 
 
 		 390 aa  369  1e-101  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0217  homogentisate 1,2-dioxygenase  47.52 
 
 		 390 aa  369  1e-101  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0242  homogentisate 1,2-dioxygenase  47.52 
 
 		 390 aa  369  1e-101  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0255  putative homogentisate 1,2-dioxygenase  47.52 
 
 		 390 aa  369  1e-101  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5068  putative homogentisate 1,2-dioxygenase  47.52 
 
 		 390 aa  369  1e-101  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00282868  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0276  putative homogentisate 1,2-dioxygenase  47.52 
 
 		 390 aa  368  1e-100  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000242533  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0262  homogentisate 1,2-dioxygenase, putative  47.52 
 
 		 390 aa  367  1e-100  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00729386  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0257  putative homogentisate 1,2-dioxygenase  47.28 
 
 		 392 aa  368  1e-100  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000636938  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0230  homogentisate 12-dioxygenase  46.63 
 
 		 390 aa  365  1e-100  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0221  homogentisate 12-dioxygenase  47.03 
 
 		 390 aa  364  2e-99  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2762  homogentisate 12-dioxygenase  46.45 
 
 		 385 aa  345  1e-93  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000862823  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5427  homogentisate 12-dioxygenase  44.25 
 
 		 385 aa  335  9e-91  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0911564  normal  0.337883 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3805  homogentisate 12-dioxygenase  45.7 
 
 		 388 aa  332  9e-90  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00200515  normal  0.427722 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3280  homogentisate 12-dioxygenase  45.79 
 
 		 385 aa  327  3e-88  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.524985 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2106  homogentisate 12-dioxygenase  45.05 
 
 		 385 aa  315  9e-85  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0415029  normal  0.565208 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6321  homogentisate 12-dioxygenase  43.37 
 
 		 396 aa  309  5e-83  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02595  homogentisate 1,2-dioxygenase  43.52 
 
 		 386 aa  309  5.9999999999999995e-83  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0728  homogentisate 1,2-dioxygenase  40.35 
 
 		 385 aa  291  2e-77  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2363  homogentisate 1,2-dioxygenase  39.31 
 
 		 386 aa  287  2e-76  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.445339  normal  0.275941 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2291  homogentisate 1,2-dioxygenase  38.82 
 
 		 386 aa  286  5.999999999999999e-76  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000437513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1874  homogentisate 12-dioxygenase  38.61 
 
 		 386 aa  283  3.0000000000000004e-75  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1732  homogentisate 12-dioxygenase  38.82 
 
 		 386 aa  283  4.0000000000000003e-75  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00561061 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2154  homogentisate 1,2-dioxygenase  39.11 
 
 		 386 aa  282  6.000000000000001e-75  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.634063 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2615  homogentisate 12-dioxygenase  38.82 
 
 		 386 aa  282  8.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0308121  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1671  homogentisate 1,2-dioxygenase  38.82 
 
 		 386 aa  282  8.000000000000001e-75  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.991879  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2481  homogentisate 1,2-dioxygenase  38.57 
 
 		 386 aa  282  9e-75  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.59318  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1963  hypothetical protein  38.82 
 
 		 386 aa  280  3e-74  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2653  homogentisate 12-dioxygenase  38.57 
 
 		 386 aa  280  3e-74  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.51516  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2728  homogentisate 12-dioxygenase  38.57 
 
 		 386 aa  280  3e-74  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.315515  normal  0.247333 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1569  homogentisate 1,2-dioxygenase  38.82 
 
 		 386 aa  278  2e-73  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2326  homogentisate 1,2-dioxygenase  36.61 
 
 		 386 aa  273  5.000000000000001e-72  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2369  homogentisate 12-dioxygenase  37.56 
 
 		 384 aa  267  2e-70  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2162  homogentisate 1,2-dioxygenase  37.1 
 
 		 386 aa  268  2e-70  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3572  homogentisate 12-dioxygenase  39.21 
 
 		 385 aa  242  1e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3504  homogentisate 12-dioxygenase  38.96 
 
 		 385 aa  241  2e-62  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.142046  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3423  homogentisate 1,2-dioxygenase  38.96 
 
 		 385 aa  239  9e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00233011  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3485  homogentisate 12-dioxygenase  35.84 
 
 		 385 aa  219  5e-56  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.306053  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6552  homogentisate 12-dioxygenase  35.91 
 
 		 389 aa  217  4e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0724494  normal  0.194858 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0961  putative oxidoreductase  33.55 
 
 		 378 aa  164  3e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02178  hypothetical protein  32.69 
 
 		 376 aa  160  3e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003654  homogentisate 1,2-dioxygenase  32.04 
 
 		 364 aa  157  3e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1697  homogentisate 1,2-dioxygenase  31.98 
 
 		 379 aa  154  4e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.196029 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1438  homogentisate 1,2-dioxygenase  29.95 
 
 		 372 aa  149  8e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1897  homogentisate 1,2-dioxygenase  30.65 
 
 		 363 aa  126  9e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4463  homogentisate 1,2-dioxygenase  31.36 
 
 		 367 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.100375 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0957  homogentisate 12-dioxygenase  31.05 
 
 		 373 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.490105  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1591  homogentisate 1,2-dioxygenase  29.41 
 
 		 368 aa  118  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1615  homogentisate 1,2-dioxygenase  29.41 
 
 		 368 aa  118  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.904651 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1561  homogentisate 1,2-dioxygenase  29.41 
 
 		 368 aa  118  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01897  Homogentisate 1,2-dioxygenase (EC 1.13.11.5)(Homogentisic acid oxidase)(Homogentisate oxygenase)(Homogentisicase) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q00667]  27.71 
 
 		 448 aa  87.8  3e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0921  homogentisate 1,2-dioxygenase  28.91 
 
 		 448 aa  79  0.0000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4374  homogentisate 1,2-dioxygenase  28.62 
 
 		 442 aa  79  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000328355  normal  0.761675 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3923  homogentisate 1,2-dioxygenase  27.11 
 
 		 468 aa  75.1  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4302  homogentisate 1,2-dioxygenase  28.74 
 
 		 443 aa  75.1  0.000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1043  homogentisate 1,2-dioxygenase  27.06 
 
 		 450 aa  74.7  0.000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1193  homogentisate 1,2-dioxygenase  28.62 
 
 		 453 aa  74.7  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.814651  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3333  homogentisate 1,2-dioxygenase  28.17 
 
 		 455 aa  73.6  0.000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3652  homogentisate 1,2-dioxygenase  28.29 
 
 		 427 aa  73.6  0.000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.207248 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0907  homogentisate 1,2-dioxygenase  28.91 
 
 		 448 aa  73.2  0.000000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.78575  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1018  homogentisate 1,2-dioxygenase  26.59 
 
 		 448 aa  73.2  0.000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.266165 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06390  homogentisate 1,2-dioxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G10810)  26.63 
 
 		 462 aa  72.8  0.000000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.224544  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2997  homogentisate 1,2-dioxygenase  29.19 
 
 		 434 aa  72.8  0.00000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.45322 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5153  homogentisate 1,2-dioxygenase  27.99 
 
 		 448 aa  72.4  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.424959  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02539  homogentisate 1,2-dioxygenase  30.22 
 
 		 454 aa  71.6  0.00000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000365945  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0994  homogentisate 1,2-dioxygenase  27.42 
 
 		 454 aa  72  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0891  homogentisate 1,2-dioxygenase  28.42 
 
 		 448 aa  68.9  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.669112  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2725  homogentisate 1,2-dioxygenase  27.31 
 
 		 431 aa  69.7  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00241736  normal  0.0920445 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2456  homogentisate 1,2-dioxygenase  29.37 
 
 		 452 aa  69.3  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3864  homogentisate 1,2-dioxygenase  28.98 
 
 		 442 aa  69.3  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.412305  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1025  homogentisate 1,2-dioxygenase  28.52 
 
 		 429 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.243336  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0817  homogentisate 1,2-dioxygenase  28.19 
 
 		 433 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.633132  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2621  homogentisate 1,2-dioxygenase  25.16 
 
 		 451 aa  67.8  0.0000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.783486 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2738  homogentisate 1,2-dioxygenase  27.1 
 
 		 441 aa  67.8  0.0000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3900  homogentisate 1,2-dioxygenase  27.27 
 
 		 448 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.187148 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0566  homogentisate 1,2-dioxygenase  28.05 
 
 		 449 aa  67.4  0.0000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.11982  normal  0.485064 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2532  homogentisate 1,2-dioxygenase  28.3 
 
 		 453 aa  67.4  0.0000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0913  homogentisate 1,2-dioxygenase  25.24 
 
 		 453 aa  67  0.0000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.994604  normal  0.237981 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3547  homogentisate 1,2-dioxygenase  25.24 
 
 		 453 aa  67  0.0000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.294103 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0780  homogentisate 1,2-dioxygenase  26.86 
 
 		 448 aa  66.6  0.0000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.90704  normal  0.708148 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3738  homogentisate 1,2-dioxygenase  27.61 
 
 		 432 aa  66.6  0.0000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.333429  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3462  homogentisate 1,2-dioxygenase  27.81 
 
 		 448 aa  66.6  0.0000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.311936  normal  0.0988393 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0289  homogentisate 1,2-dioxygenase  28.33 
 
 		 437 aa  66.2  0.0000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.36661  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>