136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_1897 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_1591  homogentisate 1,2-dioxygenase  84.55 
 
 		 368 aa  644    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1615  homogentisate 1,2-dioxygenase  84.55 
 
 		 368 aa  644    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.904651 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1897  homogentisate 1,2-dioxygenase  100 
 
 		 363 aa  745    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1561  homogentisate 1,2-dioxygenase  84.55 
 
 		 368 aa  643    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4463  homogentisate 1,2-dioxygenase  92.92 
 
 		 367 aa  703    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.100375 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0957  homogentisate 12-dioxygenase  65.55 
 
 		 373 aa  481  1e-135  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.490105  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1697  homogentisate 1,2-dioxygenase  35.82 
 
 		 379 aa  195  8.000000000000001e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.196029 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02178  hypothetical protein  33.8 
 
 		 376 aa  190  4e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003654  homogentisate 1,2-dioxygenase  33.81 
 
 		 364 aa  186  4e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1438  homogentisate 1,2-dioxygenase  32.28 
 
 		 372 aa  180  2.9999999999999997e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0961  putative oxidoreductase  32.68 
 
 		 378 aa  180  2.9999999999999997e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0230  homogentisate 12-dioxygenase  28.31 
 
 		 390 aa  138  1e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0215  homogentisate 1,2-dioxygenase  29.51 
 
 		 390 aa  137  2e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0217  homogentisate 1,2-dioxygenase  29.51 
 
 		 390 aa  137  2e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0221  homogentisate 12-dioxygenase  29.4 
 
 		 390 aa  138  2e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0276  putative homogentisate 1,2-dioxygenase  29.51 
 
 		 390 aa  137  2e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000242533  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0262  homogentisate 1,2-dioxygenase, putative  29.51 
 
 		 390 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00729386  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0228  homogentisate 1,2-dioxygenase  29.12 
 
 		 390 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0242  homogentisate 1,2-dioxygenase  29.12 
 
 		 390 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0257  putative homogentisate 1,2-dioxygenase  29.51 
 
 		 392 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000636938  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0255  putative homogentisate 1,2-dioxygenase  29.51 
 
 		 390 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0088  homogentisate 12-dioxygenase  29.35 
 
 		 400 aa  135  9e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5068  putative homogentisate 1,2-dioxygenase  29.23 
 
 		 390 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00282868  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2762  homogentisate 12-dioxygenase  30.97 
 
 		 385 aa  134  1.9999999999999998e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000862823  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1684  homogentisate 12-dioxygenase  31.72 
 
 		 395 aa  133  3.9999999999999996e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0657  homogentisate 1,2-dioxygenase  32.46 
 
 		 404 aa  132  6.999999999999999e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1918  homogentisate 12-dioxygenase  31.12 
 
 		 401 aa  132  9e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0204233  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18910  homogentisate 1,2-dioxygenase  31.61 
 
 		 406 aa  131  2.0000000000000002e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0108464  normal  0.652013 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0728  homogentisate 1,2-dioxygenase  26.56 
 
 		 385 aa  131  2.0000000000000002e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6321  homogentisate 12-dioxygenase  28.21 
 
 		 396 aa  129  6e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4688  homogentisate 12-dioxygenase  30.52 
 
 		 388 aa  129  7.000000000000001e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.378892  normal  0.704415 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6468  homogentisate 12-dioxygenase  30.1 
 
 		 394 aa  129  1.0000000000000001e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.213717 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2106  homogentisate 12-dioxygenase  27.65 
 
 		 385 aa  128  1.0000000000000001e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0415029  normal  0.565208 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4258  homogentisate 1,2-dioxygenase  30.89 
 
 		 388 aa  129  1.0000000000000001e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0597877 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1107  homogentisate 12-dioxygenase  29.92 
 
 		 399 aa  126  7e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.141602 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0530  homogentisate 12-dioxygenase  32.99 
 
 		 406 aa  123  4e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07000  homogentisate 1,2-dioxygenase  31.36 
 
 		 399 aa  123  6e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.126563 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0709  homogentisate 12-dioxygenase  29.22 
 
 		 397 aa  122  9e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02595  homogentisate 1,2-dioxygenase  25.66 
 
 		 386 aa  122  9.999999999999999e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3787  homogentisate 12-dioxygenase  30.48 
 
 		 407 aa  122  9.999999999999999e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8845  homogentisate 1,2-dioxygenase, putative  27.76 
 
 		 389 aa  121  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.57227 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0812  homogentisate 12-dioxygenase  28.23 
 
 		 393 aa  118  9.999999999999999e-26  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5427  homogentisate 12-dioxygenase  29.3 
 
 		 385 aa  118  1.9999999999999998e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0911564  normal  0.337883 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10650  homogentisate 1,2-dioxygenase  29.56 
 
 		 434 aa  117  3e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.233818  normal  0.424884 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2093  Homogentisate 1 2-dioxygenase-like protein  28.33 
 
 		 393 aa  116  6e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.6516  normal  0.270951 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1868  homogentisate 12-dioxygenase  29.79 
 
 		 402 aa  116  6e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.501601  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2162  homogentisate 1,2-dioxygenase  27.14 
 
 		 386 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2154  homogentisate 1,2-dioxygenase  26.3 
 
 		 386 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.634063 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1874  homogentisate 12-dioxygenase  25.85 
 
 		 386 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2291  homogentisate 1,2-dioxygenase  26.01 
 
 		 386 aa  113  4.0000000000000004e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000437513  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2481  homogentisate 1,2-dioxygenase  26.5 
 
 		 386 aa  113  5e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.59318  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1569  homogentisate 1,2-dioxygenase  26.2 
 
 		 386 aa  112  9e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2326  homogentisate 1,2-dioxygenase  25.93 
 
 		 386 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3805  homogentisate 12-dioxygenase  28.06 
 
 		 388 aa  110  4.0000000000000004e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00200515  normal  0.427722 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3280  homogentisate 12-dioxygenase  24.71 
 
 		 385 aa  110  5e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.524985 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2363  homogentisate 1,2-dioxygenase  26.21 
 
 		 386 aa  109  7.000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.445339  normal  0.275941 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1963  hypothetical protein  24.86 
 
 		 386 aa  107  3e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1732  homogentisate 12-dioxygenase  24.51 
 
 		 386 aa  107  3e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00561061 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2653  homogentisate 12-dioxygenase  24.51 
 
 		 386 aa  106  6e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.51516  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2615  homogentisate 12-dioxygenase  24.51 
 
 		 386 aa  106  7e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0308121  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1671  homogentisate 1,2-dioxygenase  24.51 
 
 		 386 aa  106  7e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.991879  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2728  homogentisate 12-dioxygenase  24.51 
 
 		 386 aa  106  7e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.315515  normal  0.247333 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3423  homogentisate 1,2-dioxygenase  30.5 
 
 		 385 aa  105  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00233011  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3572  homogentisate 12-dioxygenase  30.7 
 
 		 385 aa  104  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3504  homogentisate 12-dioxygenase  30.5 
 
 		 385 aa  104  2e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.142046  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2369  homogentisate 12-dioxygenase  24.46 
 
 		 384 aa  102  9e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3485  homogentisate 12-dioxygenase  29.36 
 
 		 385 aa  100  3e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.306053  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6552  homogentisate 12-dioxygenase  25.71 
 
 		 389 aa  91.3  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0724494  normal  0.194858 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0337  homogentisate 1,2-dioxygenase  25.9 
 
 		 444 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0820  homogentisate 1,2-dioxygenase  25.9 
 
 		 444 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.623719  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0691  homogentisate 1,2-dioxygenase  25.97 
 
 		 448 aa  65.1  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.398963 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3923  homogentisate 1,2-dioxygenase  24.7 
 
 		 468 aa  64.3  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0789  homogentisate 1,2-dioxygenase  26.19 
 
 		 444 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.211762  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4534  homogentisate 1,2-dioxygenase  25.54 
 
 		 448 aa  63.9  0.000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.233345  normal  0.576048 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3462  homogentisate 1,2-dioxygenase  25.54 
 
 		 448 aa  63.9  0.000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.311936  normal  0.0988393 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0701  homogentisate 1,2-dioxygenase  25.1 
 
 		 444 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0718  homogentisate 1,2-dioxygenase  25.1 
 
 		 444 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.10992  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3913  homogentisate 1,2-dioxygenase  24.7 
 
 		 444 aa  63.2  0.000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2725  homogentisate 1,2-dioxygenase  25 
 
 		 431 aa  63.2  0.000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00241736  normal  0.0920445 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0780  homogentisate 1,2-dioxygenase  25.6 
 
 		 448 aa  62.8  0.000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.90704  normal  0.708148 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3900  homogentisate 1,2-dioxygenase  25.2 
 
 		 448 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.187148 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1397  homogentisate 1,2-dioxygenase  25.2 
 
 		 450 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.762264  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2435  homogentisate 1,2-dioxygenase  25.1 
 
 		 440 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.125362  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2056  homogentisate 1,2-dioxygenase  25.2 
 
 		 450 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3228  homogentisate 1,2-dioxygenase  25.2 
 
 		 450 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0856  homogentisate 1,2-dioxygenase  25.2 
 
 		 450 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.789962  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2688  homogentisate 1,2-dioxygenase  25.2 
 
 		 450 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.515143  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3174  homogentisate 1,2-dioxygenase  25.2 
 
 		 444 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.666135  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3213  homogentisate 1,2-dioxygenase  25.2 
 
 		 450 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1921  homogentisate 1,2-dioxygenase  25.2 
 
 		 450 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.884358  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2563  homogentisate 1,2-dioxygenase  25.1 
 
 		 444 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1557  homogentisate 1,2-dioxygenase  24.45 
 
 		 438 aa  59.7  0.00000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.474294 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0817  homogentisate 1,2-dioxygenase  23.63 
 
 		 433 aa  59.7  0.00000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.633132  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0876  homogentisate 1,2-dioxygenase  24.26 
 
 		 443 aa  59.3  0.00000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0480084  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4374  homogentisate 1,2-dioxygenase  24.23 
 
 		 442 aa  58.9  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000328355  normal  0.761675 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06390  homogentisate 1,2-dioxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G10810)  24.78 
 
 		 462 aa  58.2  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.224544  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4621  homogentisate 1,2-dioxygenase  22.54 
 
 		 433 aa  58.2  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.356023  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4605  homogentisate 1,2-dioxygenase  22.76 
 
 		 433 aa  57.4  0.0000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0198539  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1025  homogentisate 1,2-dioxygenase  21.84 
 
 		 429 aa  55.5  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.243336  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0921  homogentisate 1,2-dioxygenase  25.5 
 
 		 448 aa  55.8  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>