99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_2093 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_2093  Homogentisate 1 2-dioxygenase-like protein  100 
 
 		 393 aa  807    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.6516  normal  0.270951 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4463  homogentisate 1,2-dioxygenase  29.1 
 
 		 367 aa  124  2e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.100375 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1561  homogentisate 1,2-dioxygenase  29.76 
 
 		 368 aa  119  7.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1591  homogentisate 1,2-dioxygenase  29.49 
 
 		 368 aa  118  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1615  homogentisate 1,2-dioxygenase  29.49 
 
 		 368 aa  118  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.904651 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1897  homogentisate 1,2-dioxygenase  28.33 
 
 		 363 aa  116  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0957  homogentisate 12-dioxygenase  28.95 
 
 		 373 aa  107  4e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.490105  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1697  homogentisate 1,2-dioxygenase  28.77 
 
 		 379 aa  97.4  4e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.196029 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003654  homogentisate 1,2-dioxygenase  28.15 
 
 		 364 aa  84.3  0.000000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0961  putative oxidoreductase  27.35 
 
 		 378 aa  83.2  0.000000000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02178  hypothetical protein  26.63 
 
 		 376 aa  81.3  0.00000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6321  homogentisate 12-dioxygenase  25.6 
 
 		 396 aa  78.6  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0728  homogentisate 1,2-dioxygenase  24.14 
 
 		 385 aa  71.2  0.00000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2106  homogentisate 12-dioxygenase  27.74 
 
 		 385 aa  71.2  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0415029  normal  0.565208 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5427  homogentisate 12-dioxygenase  24.59 
 
 		 385 aa  71.2  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0911564  normal  0.337883 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2369  homogentisate 12-dioxygenase  24.92 
 
 		 384 aa  70.5  0.00000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02595  homogentisate 1,2-dioxygenase  24.38 
 
 		 386 aa  67.4  0.0000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3805  homogentisate 12-dioxygenase  27.06 
 
 		 388 aa  67  0.0000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00200515  normal  0.427722 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0230  homogentisate 12-dioxygenase  23.73 
 
 		 390 aa  63.5  0.000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0217  homogentisate 1,2-dioxygenase  27.7 
 
 		 390 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0257  putative homogentisate 1,2-dioxygenase  28.38 
 
 		 392 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000636938  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0215  homogentisate 1,2-dioxygenase  27.7 
 
 		 390 aa  61.2  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0221  homogentisate 12-dioxygenase  27.7 
 
 		 390 aa  61.2  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0228  homogentisate 1,2-dioxygenase  27.7 
 
 		 390 aa  61.2  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0709  homogentisate 12-dioxygenase  26.16 
 
 		 397 aa  61.2  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1438  homogentisate 1,2-dioxygenase  24.42 
 
 		 372 aa  61.6  0.00000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0276  putative homogentisate 1,2-dioxygenase  27.7 
 
 		 390 aa  61.2  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000242533  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0242  homogentisate 1,2-dioxygenase  27.7 
 
 		 390 aa  61.2  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0255  putative homogentisate 1,2-dioxygenase  27.7 
 
 		 390 aa  61.2  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5068  putative homogentisate 1,2-dioxygenase  27.7 
 
 		 390 aa  60.8  0.00000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00282868  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0262  homogentisate 1,2-dioxygenase, putative  27.03 
 
 		 390 aa  60.8  0.00000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00729386  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4605  homogentisate 1,2-dioxygenase  30.95 
 
 		 433 aa  60.1  0.00000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0198539  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4621  homogentisate 1,2-dioxygenase  30.95 
 
 		 433 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.356023  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3280  homogentisate 12-dioxygenase  22.5 
 
 		 385 aa  57  0.0000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.524985 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4481  homogentisate 1,2-dioxygenase  30.36 
 
 		 433 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.518935  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2833  homogentisate 1,2-dioxygenase  27.91 
 
 		 453 aa  55.1  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.385298  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3485  homogentisate 12-dioxygenase  27.52 
 
 		 385 aa  54.3  0.000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.306053  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3864  homogentisate 1,2-dioxygenase  32.17 
 
 		 442 aa  54.7  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.412305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1569  homogentisate 1,2-dioxygenase  21.12 
 
 		 386 aa  54.3  0.000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0817  homogentisate 1,2-dioxygenase  29.17 
 
 		 433 aa  54.3  0.000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.633132  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5825  homogentisate 1,2-dioxygenase  27.95 
 
 		 848 aa  53.9  0.000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0876183  normal  0.90273 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1025  homogentisate 1,2-dioxygenase  26.92 
 
 		 429 aa  53.9  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.243336  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2762  homogentisate 12-dioxygenase  22.22 
 
 		 385 aa  53.5  0.000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000862823  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6552  homogentisate 12-dioxygenase  24.07 
 
 		 389 aa  53.1  0.000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0724494  normal  0.194858 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5153  homogentisate 1,2-dioxygenase  28.67 
 
 		 448 aa  53.1  0.000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.424959  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3547  homogentisate 1,2-dioxygenase  27.49 
 
 		 453 aa  52.8  0.000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.294103 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0913  homogentisate 1,2-dioxygenase  27.49 
 
 		 453 aa  52.8  0.000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.994604  normal  0.237981 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3280  homogentisate 1,2-dioxygenase  31.25 
 
 		 432 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.645052  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38510  homogentisate 1,2-dioxygenase  31.25 
 
 		 432 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00419964  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1684  homogentisate 12-dioxygenase  25 
 
 		 395 aa  52.4  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3923  homogentisate 1,2-dioxygenase  27.72 
 
 		 468 aa  51.2  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3326  homogentisate 1,2-dioxygenase  26.67 
 
 		 434 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0214185 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0907  homogentisate 1,2-dioxygenase  29.33 
 
 		 448 aa  51.2  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.78575  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2456  homogentisate 1,2-dioxygenase  29.68 
 
 		 452 aa  51.2  0.00003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3423  homogentisate 1,2-dioxygenase  25.66 
 
 		 385 aa  50.8  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00233011  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3504  homogentisate 12-dioxygenase  25.66 
 
 		 385 aa  50.8  0.00004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.142046  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3652  homogentisate 1,2-dioxygenase  30.46 
 
 		 427 aa  50.8  0.00004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.207248 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1193  homogentisate 1,2-dioxygenase  29.63 
 
 		 453 aa  50.4  0.00005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.814651  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1407  homogentisate 1,2-dioxygenase  26.74 
 
 		 453 aa  50.4  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.818209 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10650  homogentisate 1,2-dioxygenase  25.32 
 
 		 434 aa  50.4  0.00005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.233818  normal  0.424884 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3572  homogentisate 12-dioxygenase  24.22 
 
 		 385 aa  50.1  0.00007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2621  homogentisate 1,2-dioxygenase  26.74 
 
 		 451 aa  50.1  0.00007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.783486 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1439  homogentisate 1,2-dioxygenase  25.84 
 
 		 460 aa  50.1  0.00007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0891  homogentisate 1,2-dioxygenase  29.14 
 
 		 448 aa  50.1  0.00008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.669112  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1868  homogentisate 12-dioxygenase  24.33 
 
 		 402 aa  49.3  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.501601  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1918  homogentisate 12-dioxygenase  24.84 
 
 		 401 aa  48.9  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0204233  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0994  homogentisate 1,2-dioxygenase  30.73 
 
 		 454 aa  48.9  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1018  homogentisate 1,2-dioxygenase  28 
 
 		 448 aa  48.1  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.266165 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0921  homogentisate 1,2-dioxygenase  28.48 
 
 		 448 aa  48.5  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6468  homogentisate 12-dioxygenase  24.5 
 
 		 394 aa  48.1  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.213717 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3812  homogentisate 1,2-dioxygenase  26.59 
 
 		 451 aa  48.5  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.283332  normal  0.618849 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1043  homogentisate 1,2-dioxygenase  27.06 
 
 		 450 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1107  homogentisate 12-dioxygenase  23.46 
 
 		 399 aa  47.8  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.141602 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1511  homogentisate 1,2-dioxygenase  26.67 
 
 		 453 aa  48.1  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.000621512  normal  0.470006 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0530  homogentisate 12-dioxygenase  28.22 
 
 		 406 aa  47.8  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3333  homogentisate 1,2-dioxygenase  26.39 
 
 		 455 aa  47.8  0.0004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8845  homogentisate 1,2-dioxygenase, putative  26.05 
 
 		 389 aa  47.4  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.57227 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2532  homogentisate 1,2-dioxygenase  28.67 
 
 		 453 aa  47  0.0006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4534  homogentisate 1,2-dioxygenase  29.37 
 
 		 448 aa  46.6  0.0007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.233345  normal  0.576048 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3462  homogentisate 1,2-dioxygenase  29.37 
 
 		 448 aa  46.6  0.0007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.311936  normal  0.0988393 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3738  homogentisate 1,2-dioxygenase  30.83 
 
 		 432 aa  46.6  0.0007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.333429  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4688  homogentisate 12-dioxygenase  24.83 
 
 		 388 aa  46.6  0.0009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.378892  normal  0.704415 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2725  homogentisate 1,2-dioxygenase  29.27 
 
 		 431 aa  45.8  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00241736  normal  0.0920445 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18910  homogentisate 1,2-dioxygenase  21.28 
 
 		 406 aa  45.8  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0108464  normal  0.652013 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0088  homogentisate 12-dioxygenase  26.76 
 
 		 400 aa  46.2  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0657  homogentisate 1,2-dioxygenase  25.14 
 
 		 404 aa  46.2  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3787  homogentisate 12-dioxygenase  25.29 
 
 		 407 aa  45.1  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0566  homogentisate 1,2-dioxygenase  26.49 
 
 		 449 aa  45.1  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.11982  normal  0.485064 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0691  homogentisate 1,2-dioxygenase  29.37 
 
 		 448 aa  45.1  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.398963 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06390  homogentisate 1,2-dioxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G10810)  28.49 
 
 		 462 aa  45.4  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.224544  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2336  homogentisate 1,2-dioxygenase  28.47 
 
 		 430 aa  44.7  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.829883  normal  0.673279 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4258  homogentisate 1,2-dioxygenase  22.97 
 
 		 388 aa  44.7  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0597877 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2997  homogentisate 1,2-dioxygenase  30.59 
 
 		 434 aa  44.7  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.45322 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07000  homogentisate 1,2-dioxygenase  23.31 
 
 		 399 aa  43.9  0.004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.126563 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0876  homogentisate 1,2-dioxygenase  28.31 
 
 		 443 aa  44.3  0.004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0480084  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0812  homogentisate 12-dioxygenase  23.76 
 
 		 393 aa  43.9  0.005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4374  homogentisate 1,2-dioxygenase  28.48 
 
 		 442 aa  43.5  0.007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000328355  normal  0.761675 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3900  homogentisate 1,2-dioxygenase  28.1 
 
 		 448 aa  43.1  0.008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.187148 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3913  homogentisate 1,2-dioxygenase  25.12 
 
 		 444 aa  42.7  0.01  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>