128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_0910 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_4621  homogentisate 1,2-dioxygenase  81.06 
 
 		 433 aa  729    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.356023  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3551  homogentisate 1,2-dioxygenase  73.7 
 
 		 434 aa  667    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.518718  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3326  homogentisate 1,2-dioxygenase  74.35 
 
 		 434 aa  669    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0214185 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0910  homogentisate 1,2-dioxygenase  100 
 
 		 431 aa  890    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38510  homogentisate 1,2-dioxygenase  82.41 
 
 		 432 aa  742    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00419964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4481  homogentisate 1,2-dioxygenase  80.83 
 
 		 433 aa  718    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.518935  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3280  homogentisate 1,2-dioxygenase  82.18 
 
 		 432 aa  741    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.645052  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15350  homogentisate 1,2-dioxygenase  72.37 
 
 		 461 aa  642    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4605  homogentisate 1,2-dioxygenase  80.37 
 
 		 433 aa  725    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0198539  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0817  homogentisate 1,2-dioxygenase  80.83 
 
 		 433 aa  723    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.633132  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3864  homogentisate 1,2-dioxygenase  66.99 
 
 		 442 aa  572  1.0000000000000001e-162  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.412305  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3462  homogentisate 1,2-dioxygenase  64.72 
 
 		 448 aa  565  1e-160  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.311936  normal  0.0988393 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4534  homogentisate 1,2-dioxygenase  64.72 
 
 		 448 aa  565  1e-160  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.233345  normal  0.576048 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3652  homogentisate 1,2-dioxygenase  64.61 
 
 		 427 aa  560  1e-158  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.207248 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2435  homogentisate 1,2-dioxygenase  62.94 
 
 		 440 aa  558  1e-158  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.125362  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1557  homogentisate 1,2-dioxygenase  65.07 
 
 		 438 aa  555  1e-157  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.474294 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2005  homogentisate 1,2-dioxygenase  63.03 
 
 		 429 aa  552  1e-156  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.436695  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0691  homogentisate 1,2-dioxygenase  63.32 
 
 		 448 aa  548  1e-155  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.398963 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2563  homogentisate 1,2-dioxygenase  61.49 
 
 		 444 aa  548  1e-155  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04215  homogentisate 1,2-dioxygenase  62.35 
 
 		 441 aa  549  1e-155  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2056  homogentisate 1,2-dioxygenase  62.36 
 
 		 450 aa  545  1e-154  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3228  homogentisate 1,2-dioxygenase  62.36 
 
 		 450 aa  545  1e-154  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3900  homogentisate 1,2-dioxygenase  62 
 
 		 448 aa  546  1e-154  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.187148 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0856  homogentisate 1,2-dioxygenase  62.36 
 
 		 450 aa  545  1e-154  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.789962  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2688  homogentisate 1,2-dioxygenase  62.36 
 
 		 450 aa  545  1e-154  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.515143  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3174  homogentisate 1,2-dioxygenase  62.36 
 
 		 444 aa  545  1e-154  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.666135  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3213  homogentisate 1,2-dioxygenase  62.36 
 
 		 450 aa  545  1e-154  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1921  homogentisate 1,2-dioxygenase  62.36 
 
 		 450 aa  545  1e-154  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.884358  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0780  homogentisate 1,2-dioxygenase  62.7 
 
 		 448 aa  548  1e-154  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.90704  normal  0.708148 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3923  homogentisate 1,2-dioxygenase  61.21 
 
 		 468 aa  541  1e-153  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1397  homogentisate 1,2-dioxygenase  62.12 
 
 		 450 aa  544  1e-153  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.762264  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3913  homogentisate 1,2-dioxygenase  60.97 
 
 		 444 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0337  homogentisate 1,2-dioxygenase  60.81 
 
 		 444 aa  541  9.999999999999999e-153  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0820  homogentisate 1,2-dioxygenase  60.81 
 
 		 444 aa  541  9.999999999999999e-153  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.623719  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4374  homogentisate 1,2-dioxygenase  60.97 
 
 		 442 aa  537  1e-151  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000328355  normal  0.761675 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0718  homogentisate 1,2-dioxygenase  60.81 
 
 		 444 aa  537  1e-151  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.10992  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0701  homogentisate 1,2-dioxygenase  60.27 
 
 		 444 aa  534  1e-150  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0876  homogentisate 1,2-dioxygenase  61.16 
 
 		 443 aa  533  1e-150  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0480084  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0789  homogentisate 1,2-dioxygenase  60.14 
 
 		 444 aa  532  1e-150  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.211762  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2725  homogentisate 1,2-dioxygenase  61.03 
 
 		 431 aa  529  1e-149  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00241736  normal  0.0920445 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3738  homogentisate 1,2-dioxygenase  60.71 
 
 		 432 aa  530  1e-149  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.333429  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2997  homogentisate 1,2-dioxygenase  58.39 
 
 		 434 aa  510  1e-143  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.45322 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2336  homogentisate 1,2-dioxygenase  56.98 
 
 		 430 aa  500  1e-140  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.829883  normal  0.673279 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0289  homogentisate 1,2-dioxygenase  59.15 
 
 		 437 aa  494  9.999999999999999e-139  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.36661  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0891  homogentisate 1,2-dioxygenase  56.05 
 
 		 448 aa  479  1e-134  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.669112  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1018  homogentisate 1,2-dioxygenase  55.84 
 
 		 448 aa  479  1e-134  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.266165 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0907  homogentisate 1,2-dioxygenase  55.61 
 
 		 448 aa  475  1e-133  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.78575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3333  homogentisate 1,2-dioxygenase  54.76 
 
 		 455 aa  475  1e-133  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1043  homogentisate 1,2-dioxygenase  56.41 
 
 		 450 aa  475  1e-133  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0921  homogentisate 1,2-dioxygenase  55.37 
 
 		 448 aa  473  1e-132  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0994  homogentisate 1,2-dioxygenase  54.52 
 
 		 454 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5153  homogentisate 1,2-dioxygenase  54.4 
 
 		 448 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.424959  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1407  homogentisate 1,2-dioxygenase  53.3 
 
 		 453 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.818209 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0566  homogentisate 1,2-dioxygenase  54.44 
 
 		 449 aa  468  9.999999999999999e-131  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.11982  normal  0.485064 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4302  homogentisate 1,2-dioxygenase  55.97 
 
 		 443 aa  466  9.999999999999999e-131  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02539  homogentisate 1,2-dioxygenase  54.61 
 
 		 454 aa  466  9.999999999999999e-131  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000365945  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1511  homogentisate 1,2-dioxygenase  52.16 
 
 		 453 aa  463  1e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.000621512  normal  0.470006 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1193  homogentisate 1,2-dioxygenase  54.31 
 
 		 453 aa  462  1e-129  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.814651  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2532  homogentisate 1,2-dioxygenase  54.08 
 
 		 453 aa  460  9.999999999999999e-129  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2456  homogentisate 1,2-dioxygenase  53.36 
 
 		 452 aa  456  1e-127  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2833  homogentisate 1,2-dioxygenase  52.79 
 
 		 453 aa  457  1e-127  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.385298  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1025  homogentisate 1,2-dioxygenase  52.12 
 
 		 429 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.243336  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1439  homogentisate 1,2-dioxygenase  52.09 
 
 		 460 aa  444  1e-123  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2621  homogentisate 1,2-dioxygenase  51.84 
 
 		 451 aa  444  1e-123  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.783486 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0913  homogentisate 1,2-dioxygenase  52.34 
 
 		 453 aa  442  1e-123  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.994604  normal  0.237981 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3547  homogentisate 1,2-dioxygenase  52.34 
 
 		 453 aa  442  1e-123  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.294103 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3812  homogentisate 1,2-dioxygenase  51.96 
 
 		 451 aa  436  1e-121  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.283332  normal  0.618849 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1248  homogentisate 1,2-dioxygenase  52.26 
 
 		 416 aa  434  1e-120  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1248  homogentisate 1,2-dioxygenase  52.26 
 
 		 416 aa  434  1e-120  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01897  Homogentisate 1,2-dioxygenase (EC 1.13.11.5)(Homogentisic acid oxidase)(Homogentisate oxygenase)(Homogentisicase) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q00667]  52.76 
 
 		 448 aa  430  1e-119  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2738  homogentisate 1,2-dioxygenase  45.63 
 
 		 441 aa  372  1e-102  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5825  homogentisate 1,2-dioxygenase  46.84 
 
 		 848 aa  363  2e-99  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0876183  normal  0.90273 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49112  predicted protein  45.39 
 
 		 494 aa  355  5.999999999999999e-97  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00796178  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06390  homogentisate 1,2-dioxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G10810)  42.53 
 
 		 462 aa  348  9e-95  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.224544  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00477  conserved hypothetical protein  39.85 
 
 		 458 aa  277  3e-73  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.727152  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04012  conserved hypothetical protein  38.43 
 
 		 533 aa  272  8.000000000000001e-72  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.383665  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1438  homogentisate 1,2-dioxygenase  29.09 
 
 		 372 aa  73.6  0.000000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1697  homogentisate 1,2-dioxygenase  23.84 
 
 		 379 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.196029 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2154  homogentisate 1,2-dioxygenase  23.53 
 
 		 386 aa  61.6  0.00000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.634063 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0961  putative oxidoreductase  24.56 
 
 		 378 aa  59.7  0.00000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1868  homogentisate 12-dioxygenase  27.67 
 
 		 402 aa  58.5  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.501601  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6321  homogentisate 12-dioxygenase  23.98 
 
 		 396 aa  58.9  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02595  homogentisate 1,2-dioxygenase  22.16 
 
 		 386 aa  58.2  0.0000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6468  homogentisate 12-dioxygenase  25.06 
 
 		 394 aa  57.8  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.213717 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2162  homogentisate 1,2-dioxygenase  22.4 
 
 		 386 aa  57.4  0.0000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0709  homogentisate 12-dioxygenase  24.49 
 
 		 397 aa  57.4  0.0000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0530  homogentisate 12-dioxygenase  26.52 
 
 		 406 aa  56.6  0.0000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2369  homogentisate 12-dioxygenase  23.57 
 
 		 384 aa  55.8  0.000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2106  homogentisate 12-dioxygenase  22.03 
 
 		 385 aa  55.1  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0415029  normal  0.565208 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8845  homogentisate 1,2-dioxygenase, putative  23.38 
 
 		 389 aa  54.7  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.57227 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07000  homogentisate 1,2-dioxygenase  25.34 
 
 		 399 aa  54.7  0.000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.126563 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02178  hypothetical protein  23.16 
 
 		 376 aa  53.5  0.000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2326  homogentisate 1,2-dioxygenase  21.2 
 
 		 386 aa  53.1  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003654  homogentisate 1,2-dioxygenase  23 
 
 		 364 aa  52.8  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3280  homogentisate 12-dioxygenase  21.71 
 
 		 385 aa  51.6  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.524985 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0088  homogentisate 12-dioxygenase  28.42 
 
 		 400 aa  51.6  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5427  homogentisate 12-dioxygenase  23.05 
 
 		 385 aa  51.6  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0911564  normal  0.337883 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10650  homogentisate 1,2-dioxygenase  23.65 
 
 		 434 aa  50.8  0.00005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.233818  normal  0.424884 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1918  homogentisate 12-dioxygenase  25.72 
 
 		 401 aa  50.4  0.00006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0204233  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6552  homogentisate 12-dioxygenase  24.56 
 
 		 389 aa  49.7  0.00009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0724494  normal  0.194858 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>