132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_2945 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_2945  cupin 2 domain-containing protein  100 
 
 		 171 aa  353  5e-97  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2265  cupin 2 domain-containing protein  63.16 
 
 		 172 aa  244  3e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.97009  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3712  cupin region  45.88 
 
 		 172 aa  175  3e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.963003  normal  0.584711 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0814  cupin 2 protein  48.06 
 
 		 173 aa  136  1e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3184  cupin region  44.78 
 
 		 162 aa  135  3.0000000000000003e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0568  cupin 2 domain-containing protein  48 
 
 		 172 aa  135  3.0000000000000003e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1188  Cupin 2 conserved barrel domain protein  40.94 
 
 		 172 aa  135  3.0000000000000003e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.814089  normal  0.762073 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1917  hypothetical protein  47.2 
 
 		 172 aa  134  7.000000000000001e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1458  cupin 2 domain-containing protein  42.55 
 
 		 174 aa  132  1.9999999999999998e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1277  Cupin 2 conserved barrel domain protein  40.59 
 
 		 167 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0247695  normal  0.362537 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1315  cupin 2 domain-containing protein  36.99 
 
 		 163 aa  110  9e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00314344  normal  0.472915 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2072  auxin-binding protein, putative  33.33 
 
 		 167 aa  97.8  6e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0382674  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2228  cupin 2 domain-containing protein  38.89 
 
 		 166 aa  97.8  7e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000300974 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1030  Cupin 2 conserved barrel domain protein  39.69 
 
 		 172 aa  96.3  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1882  auxin-binding protein, putative  34.13 
 
 		 167 aa  95.1  4e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0971  cupin domain-containing protein  39.69 
 
 		 171 aa  94.7  6e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.341283  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1033  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.93 
 
 		 172 aa  94  9e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.714129  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0971  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.03 
 
 		 166 aa  87.4  7e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2193  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.21 
 
 		 171 aa  87  1e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2161  cupin 2 domain-containing protein  38.46 
 
 		 152 aa  83.6  0.000000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0191913  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1607  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.81 
 
 		 158 aa  82.8  0.000000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.978873  normal  0.178437 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1644  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.59 
 
 		 154 aa  81.6  0.000000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.522674  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1696  cupin 2 protein  36.15 
 
 		 161 aa  78.6  0.00000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3161  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.57 
 
 		 158 aa  76.3  0.0000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1468  cupin 2 domain-containing protein  33.98 
 
 		 190 aa  76.6  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1474  hypothetical protein  35.05 
 
 		 154 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.208655  normal  0.292696 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5234  cupin 2 domain-containing protein  33.04 
 
 		 172 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0933989  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0950  cupin 2 domain-containing protein  31.43 
 
 		 157 aa  68.2  0.00000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0801  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.66 
 
 		 145 aa  68.6  0.00000000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0602591  normal  0.755419 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2502  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.81 
 
 		 159 aa  67.4  0.00000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.529336 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2908  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.81 
 
 		 159 aa  65.9  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0304  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.82 
 
 		 156 aa  66.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.000378551  normal  0.964061 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1331  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.19 
 
 		 158 aa  65.5  0.0000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2908  hypothetical protein  32.14 
 
 		 155 aa  65.9  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3249  cupin 2 domain-containing protein  30.39 
 
 		 166 aa  63.5  0.000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4820  cupin 2, barrel  32.99 
 
 		 155 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3346  cupin 2 domain-containing protein  32.99 
 
 		 155 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2010  cupin domain-containing protein  31.37 
 
 		 153 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1917  cupin domain-containing protein  31.37 
 
 		 153 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4169  cupin 2 domain-containing protein  32.99 
 
 		 155 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0435  cupin domain-containing protein  31.37 
 
 		 160 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3626  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.69 
 
 		 159 aa  62  0.000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.165032  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2672  hypothetical protein  27.34 
 
 		 159 aa  61.6  0.000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.311364  normal  0.391613 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0580  hypothetical protein  30.39 
 
 		 160 aa  60.8  0.000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5131  cupin 2 domain-containing protein  31.25 
 
 		 155 aa  61.2  0.000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.720465  normal  0.658143 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1110  cupin 2, barrel  33.33 
 
 		 170 aa  60.8  0.000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3273  cupin 2 domain-containing protein  31.25 
 
 		 155 aa  60.8  0.000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2431  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.9 
 
 		 161 aa  60.1  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00370098  hitchhiker  0.00000777225 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2765  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.9 
 
 		 161 aa  60.1  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.178075 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2805  hypothetical protein  29.9 
 
 		 161 aa  60.1  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.523774  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3169  hypothetical protein  29.9 
 
 		 161 aa  60.1  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1854  hypothetical protein  29.41 
 
 		 160 aa  58.5  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0887  hypothetical protein  29.41 
 
 		 153 aa  58.5  0.00000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1371  cupin 2 domain-containing protein  27.45 
 
 		 372 aa  57  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.898845 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0866  cupin 2 domain-containing protein  29.66 
 
 		 333 aa  56.6  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.647462  normal  0.208586 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1459  hypothetical protein  28.57 
 
 		 332 aa  55.8  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0434689  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2403  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.48 
 
 		 332 aa  55.1  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2355  hypothetical protein  27.41 
 
 		 161 aa  53.9  0.000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1603  cupin 2 domain-containing protein  32.31 
 
 		 123 aa  53.9  0.000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0950  cupin 2 domain-containing protein  23.94 
 
 		 158 aa  52  0.000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4274  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.23 
 
 		 150 aa  52  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.680617 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2501  hypothetical protein  27.27 
 
 		 161 aa  51.2  0.000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4857  cupin domain-containing protein  29.03 
 
 		 157 aa  50.8  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0286871 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0551  cupin 2 domain-containing protein  26.8 
 
 		 170 aa  50.1  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.201828  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02768  cupin region  27.34 
 
 		 129 aa  50.1  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.711044  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0193  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.94 
 
 		 126 aa  49.3  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.539282  normal  0.99492 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5493  Cupin 2 conserved barrel domain protein  26.28 
 
 		 160 aa  48.9  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.302326  normal  0.111821 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2327  cupin 2 domain-containing protein  32.22 
 
 		 150 aa  48.1  0.00005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000139899 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0848  cupin 2 domain-containing protein  23.13 
 
 		 154 aa  48.1  0.00006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5435  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.71 
 
 		 149 aa  47.8  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.657648 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0389  cupin 2 domain-containing protein  26.88 
 
 		 122 aa  47.4  0.00009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0751  cupin 2 domain-containing protein  31.25 
 
 		 159 aa  47.4  0.00009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.204167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13508  hypothetical protein  36.23 
 
 		 177 aa  47  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3988  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.33 
 
 		 146 aa  47  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.507618  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2162  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.71 
 
 		 115 aa  46.2  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000761945  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3146  cupin 2 protein  26.43 
 
 		 160 aa  45.8  0.0003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2249  cupin 2, barrel  28.03 
 
 		 143 aa  45.8  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5793  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.91 
 
 		 141 aa  45.4  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0814644 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4126  cupin 2 domain-containing protein  35.21 
 
 		 119 aa  45.8  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1011  hypothetical protein  26.96 
 
 		 152 aa  45.4  0.0004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0747  hypothetical protein  28.42 
 
 		 160 aa  45.4  0.0004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0896344 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3440  cupin 2 domain-containing protein  25.81 
 
 		 167 aa  45.4  0.0004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0121  Cupin 2 conserved barrel domain protein  26.67 
 
 		 141 aa  45.4  0.0004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1904  cupin region  37.04 
 
 		 120 aa  45.1  0.0005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2936  cupin 2 protein  25.23 
 
 		 151 aa  45.1  0.0005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0225077  hitchhiker  0.00286289 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1181  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.62 
 
 		 192 aa  45.1  0.0005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.229288 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4703  cupin 2 domain-containing protein  28.42 
 
 		 154 aa  44.7  0.0006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.835831  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2394  cupin 2 domain-containing protein  23.33 
 
 		 151 aa  44.3  0.0007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00264239  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1207  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.76 
 
 		 152 aa  44.3  0.0008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.830198  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7008  hypothetical protein  35.21 
 
 		 163 aa  44.3  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0126624  hitchhiker  0.000933462 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003224  mannose-6-phosphate isomerase  31.25 
 
 		 116 aa  43.5  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0134  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.88 
 
 		 118 aa  43.9  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3060  cupin 2 domain-containing protein  28.45 
 
 		 149 aa  43.9  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00975792 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2981  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.34 
 
 		 159 aa  43.9  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2629  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.56 
 
 		 138 aa  43.9  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2020  cupin 2, barrel  28.4 
 
 		 155 aa  43.1  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00434776 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0865  cupin 2 domain-containing protein  23 
 
 		 152 aa  42.7  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.151953  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4399  polyketide synthesis domain protein  30.67 
 
 		 116 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4402  polyketide synthesis domain-containing protein  30.67 
 
 		 116 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.155389  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4317  polyketide synthesis domain protein  30.67 
 
 		 116 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>