58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_3647 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_3647  cupin 2 domain-containing protein  100 
 
 		 149 aa  306  5.9999999999999995e-83  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4108  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.89 
 
 		 165 aa  80.9  0.000000000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0102  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.3 
 
 		 204 aa  73.9  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.66506 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0105  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.3 
 
 		 204 aa  73.6  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3189  cupin 2, barrel  37.76 
 
 		 190 aa  72.8  0.000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00000805068  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7008  hypothetical protein  33.93 
 
 		 163 aa  70.1  0.000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0126624  hitchhiker  0.000933462 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2964  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.66 
 
 		 160 aa  68.6  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.75352  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6348  cupin 2 domain-containing protein  34.65 
 
 		 163 aa  67  0.00000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1181  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.17 
 
 		 192 aa  66.2  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.229288 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2609  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.63 
 
 		 160 aa  64.3  0.0000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.629  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0692  cupin 2 domain-containing protein  35.29 
 
 		 163 aa  61.6  0.000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3503  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.69 
 
 		 182 aa  58.9  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3902  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.67 
 
 		 166 aa  59.3  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.760355  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3556  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.29 
 
 		 169 aa  57.4  0.00000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1923  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.77 
 
 		 145 aa  55.1  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0356258  normal  0.456316 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3363  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32 
 
 		 181 aa  53.9  0.0000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.331871 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3791  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.75 
 
 		 159 aa  52.4  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.302037  normal  0.0222415 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2790  cupin 2 domain-containing protein  27.48 
 
 		 153 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4562  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.13 
 
 		 153 aa  51.2  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3620  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.32 
 
 		 159 aa  50.8  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.517442  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6281  hypothetical protein  32.97 
 
 		 149 aa  50.4  0.000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1714  cupin 2 domain-containing protein  31.4 
 
 		 150 aa  49.3  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.259313 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3908  Cupin 2 conserved barrel domain protein  26.21 
 
 		 186 aa  48.9  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.399642  normal  0.0760956 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2213  cupin 2 domain-containing protein  27 
 
 		 125 aa  48.5  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.971914  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3191  cupin 2, barrel  28.78 
 
 		 179 aa  48.5  0.00003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000053457  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1207  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.29 
 
 		 152 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.830198  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3706  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.91 
 
 		 163 aa  47.8  0.00005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6634  cupin 2 domain-containing protein  26.83 
 
 		 189 aa  47.4  0.00006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.718615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5062  hypothetical protein  27.34 
 
 		 157 aa  47  0.00009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.421326  normal  0.406339 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2969  cupin 2  27.56 
 
 		 171 aa  46.2  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1447  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.1 
 
 		 190 aa  46.6  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.901222  normal  0.428247 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2878  N-acetylneuraminic acid synthase domain protein  27.85 
 
 		 497 aa  46.6  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.251215  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3638  cupin 2 domain-containing protein  35.29 
 
 		 152 aa  46.2  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.588869  normal  0.0557412 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0565  hypothetical protein  27.5 
 
 		 155 aa  45.8  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.916683  normal  0.52627 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3773  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.33 
 
 		 421 aa  45.1  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.239832  normal  0.155443 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2327  cupin 2 domain-containing protein  29.76 
 
 		 150 aa  45.4  0.0003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000139899 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1709  cupin 2, barrel  27.14 
 
 		 163 aa  44.3  0.0006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.448021 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1878  Cupin 2 conserved barrel domain-containing protein  28 
 
 		 158 aa  44.3  0.0006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.0087666  normal  0.0137906 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4406  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.19 
 
 		 169 aa  43.9  0.0007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0295153  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0303  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.4 
 
 		 121 aa  43.5  0.0009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3067  cupin 2 domain-containing protein  28.95 
 
 		 145 aa  43.1  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0134  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.85 
 
 		 118 aa  43.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3140  conserved hypothetical phosphomannose protein  27.97 
 
 		 137 aa  42.4  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00345  cupin domain protein  28.4 
 
 		 121 aa  42.7  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00219915  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3997  cupin 2 domain-containing protein  42.86 
 
 		 148 aa  42.7  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.439431  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1228  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.77 
 
 		 135 aa  42  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.066401  normal  0.685252 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2309  hypothetical protein  31.58 
 
 		 139 aa  42  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.5332  hitchhiker  0.00622303 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1355  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.57 
 
 		 195 aa  41.6  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.646374  normal  0.0330672 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5028  cupin 2 domain-containing protein  29.35 
 
 		 210 aa  42  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6233  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.17 
 
 		 163 aa  41.2  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.398434  normal  0.379299 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8561  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.85 
 
 		 140 aa  41.6  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.853837  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0320  cupin 2 domain-containing protein  36.73 
 
 		 146 aa  41.6  0.004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.864661  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3197  Cupin 2 conserved barrel domain protein  25.21 
 
 		 191 aa  41.2  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.229687  normal  0.39078 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2685  hypothetical protein  43.75 
 
 		 152 aa  41.2  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.273941  normal  0.254874 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3707  cupin 2, barrel  32.26 
 
 		 138 aa  40.8  0.006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.52835  normal  0.602346 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3405  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.42 
 
 		 156 aa  40.4  0.008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2073  cupin 2, barrel  32.43 
 
 		 156 aa  40.4  0.009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.607152 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0109  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.87 
 
 		 377 aa  40  0.01  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.146013 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>