139 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_1709 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_1709  cupin 2, barrel  100 
 
 		 163 aa  334  2.9999999999999997e-91  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.448021 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1181  Cupin 2 conserved barrel domain protein  42.55 
 
 		 192 aa  91.7  4e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.229288 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1228  Cupin 2 conserved barrel domain protein  44.57 
 
 		 135 aa  81.3  0.000000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.066401  normal  0.685252 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3189  cupin 2, barrel  36.69 
 
 		 190 aa  79  0.00000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00000805068  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0102  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.43 
 
 		 204 aa  78.6  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.66506 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0105  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.1 
 
 		 204 aa  78.2  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4108  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.57 
 
 		 165 aa  77  0.00000000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2964  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.28 
 
 		 160 aa  76.3  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.75352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4406  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.19 
 
 		 169 aa  75.5  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0295153  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5435  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35 
 
 		 149 aa  75.1  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.657648 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3153  cupin 2 domain-containing protein  40.4 
 
 		 135 aa  72  0.000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4239  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.37 
 
 		 163 aa  70.9  0.000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.637233  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5299  hypothetical protein  34.43 
 
 		 166 aa  70.1  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148055  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3501  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.8 
 
 		 184 aa  68.2  0.00000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2969  cupin 2  29.41 
 
 		 171 aa  67.4  0.00000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6634  cupin 2 domain-containing protein  35.29 
 
 		 189 aa  67.4  0.00000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.718615  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3191  cupin 2, barrel  40.59 
 
 		 179 aa  66.6  0.0000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000053457  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3556  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.78 
 
 		 169 aa  65.5  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2609  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.97 
 
 		 160 aa  65.1  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.629  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0144  cupin 2 domain-containing protein  37.04 
 
 		 165 aa  64.3  0.0000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0483  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.03 
 
 		 172 aa  63.9  0.0000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.319109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2141  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.91 
 
 		 159 aa  62.8  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2790  cupin 2 domain-containing protein  43.66 
 
 		 153 aa  61.2  0.000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3707  cupin 2, barrel  33.33 
 
 		 138 aa  60.1  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.52835  normal  0.602346 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3197  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.11 
 
 		 191 aa  60.1  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.229687  normal  0.39078 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3405  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.45 
 
 		 156 aa  59.7  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0565  hypothetical protein  33.33 
 
 		 155 aa  59.7  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.916683  normal  0.52627 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3902  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.08 
 
 		 166 aa  59.3  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.760355  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0760  cupin 2 domain-containing protein  30.43 
 
 		 178 aa  58.5  0.00000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.26011  normal  0.519438 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0604  cupin 2, barrel  29.23 
 
 		 165 aa  58.2  0.00000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.398371  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0617  cupin 2 domain-containing protein  29.23 
 
 		 165 aa  58.2  0.00000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.546436  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0595  cupin 2 domain-containing protein  29.23 
 
 		 165 aa  58.2  0.00000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.906672  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3791  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.31 
 
 		 159 aa  57.8  0.00000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.302037  normal  0.0222415 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2878  Cupin 2 conserved barrel domain-containing protein  33.33 
 
 		 161 aa  57.8  0.00000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.505096  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0633  cupin 2 domain-containing protein  31.25 
 
 		 158 aa  57.4  0.00000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.643791  normal  0.229137 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6348  cupin 2 domain-containing protein  33.96 
 
 		 163 aa  57  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5062  hypothetical protein  31.65 
 
 		 157 aa  55.5  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.421326  normal  0.406339 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1714  cupin 2 domain-containing protein  41.86 
 
 		 150 aa  55.5  0.0000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.259313 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7008  hypothetical protein  34.65 
 
 		 163 aa  54.7  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0126624  hitchhiker  0.000933462 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6233  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.63 
 
 		 163 aa  54.3  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.398434  normal  0.379299 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3706  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.19 
 
 		 163 aa  54.3  0.0000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4525  cupin 2 domain-containing protein  37.63 
 
 		 147 aa  52.8  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1923  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.43 
 
 		 145 aa  53.1  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0356258  normal  0.456316 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1355  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.92 
 
 		 195 aa  52.4  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.646374  normal  0.0330672 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1878  Cupin 2 conserved barrel domain-containing protein  29.47 
 
 		 158 aa  52  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.0087666  normal  0.0137906 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3113  cupin 2 domain-containing protein  29.27 
 
 		 174 aa  51.6  0.000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.487782  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5084  cupin superfamily protein  38.89 
 
 		 147 aa  51.2  0.000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0259637  normal  0.536671 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5660  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.79 
 
 		 170 aa  50.4  0.000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.215719 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3363  Cupin 2 conserved barrel domain protein  24.53 
 
 		 181 aa  50.4  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.331871 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0837  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.78 
 
 		 130 aa  49.3  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2409  cupin family protein  43.04 
 
 		 114 aa  49.7  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116838  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0378  cupin region  27.22 
 
 		 153 aa  48.9  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.930622  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1493  cupin:cupin region  41.46 
 
 		 155 aa  48.9  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1911  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.71 
 
 		 131 aa  48.9  0.00003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.997303  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2213  cupin 2 domain-containing protein  31.97 
 
 		 125 aa  48.1  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.971914  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0829  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.25 
 
 		 153 aa  48.5  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.55618  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4683  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.6 
 
 		 124 aa  48.5  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  9.43245e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1444  cupin 2 domain-containing protein  36.05 
 
 		 132 aa  48.1  0.00005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0452  Cupin 2 conserved barrel domain protein  39.39 
 
 		 136 aa  48.1  0.00005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1864  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.4 
 
 		 144 aa  48.1  0.00005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0223  cupin 2 domain-containing protein  33.67 
 
 		 114 aa  48.1  0.00006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3503  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30 
 
 		 182 aa  47.8  0.00007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0204  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.66 
 
 		 160 aa  47.4  0.00008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0747  cupin-like protein  27.5 
 
 		 169 aa  47.4  0.00009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.179804  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0906  cupin region  37.93 
 
 		 142 aa  47  0.0001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.168616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3997  cupin 2 domain-containing protein  37.14 
 
 		 148 aa  47  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.439431  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1069  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.67 
 
 		 117 aa  47  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.486556 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3657  cupin 2, barrel  39.08 
 
 		 142 aa  46.2  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.230089  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0692  cupin 2 domain-containing protein  29.17 
 
 		 163 aa  45.8  0.0002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0535  cupin 2 domain-containing protein  33.33 
 
 		 147 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.293275  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5545  cupin 2 domain-containing protein  32.56 
 
 		 141 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6600  cupin 2 domain-containing protein  41.56 
 
 		 138 aa  46.6  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3140  conserved hypothetical phosphomannose protein  36.76 
 
 		 137 aa  45.8  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2309  hypothetical protein  27.93 
 
 		 139 aa  45.8  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.5332  hitchhiker  0.00622303 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1675  cupin 2, barrel  33.33 
 
 		 147 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5649  cupin 2 domain-containing protein  33.33 
 
 		 147 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1700  cupin 2 domain-containing protein  33.33 
 
 		 147 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.792463 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1649  cupin 2 domain-containing protein  33.33 
 
 		 147 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.316822  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0548  cupin 2 domain-containing protein  33.33 
 
 		 147 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.915131  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0630  cupin 2 domain-containing protein  33.33 
 
 		 147 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2876  cupin 2 domain-containing protein  36.36 
 
 		 131 aa  45.8  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.859242  normal  0.230975 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2368  cupin 2 domain-containing protein  37.33 
 
 		 137 aa  45.4  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.034272  normal  0.382558 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0832  cupin 2 domain-containing protein  44.62 
 
 		 139 aa  45.4  0.0003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0950  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.72 
 
 		 389 aa  45.1  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2908  hypothetical protein  31.91 
 
 		 155 aa  44.7  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3908  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.55 
 
 		 186 aa  44.3  0.0006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.399642  normal  0.0760956 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3858  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.33 
 
 		 133 aa  44.7  0.0006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3647  cupin 2 domain-containing protein  27.14 
 
 		 149 aa  44.3  0.0008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2588  cupin region  31.87 
 
 		 123 aa  43.9  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.362535 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4820  cupin 2, barrel  31.91 
 
 		 155 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0884  cupin 2, barrel  30.68 
 
 		 191 aa  43.9  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3346  cupin 2 domain-containing protein  31.91 
 
 		 155 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3184  cupin region  35.11 
 
 		 162 aa  43.9  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3966  cupin 2 domain-containing protein  41.94 
 
 		 131 aa  43.5  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5232  hypothetical protein  34.85 
 
 		 131 aa  43.9  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.234619 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6281  hypothetical protein  38.33 
 
 		 149 aa  43.9  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2295  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.07 
 
 		 166 aa  43.9  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0303  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.7 
 
 		 121 aa  43.5  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0947  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.79 
 
 		 154 aa  43.5  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.451642  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3161  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.2 
 
 		 158 aa  43.1  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>