89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_1911 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012912  Dd1591_1911  Cupin 2 conserved barrel domain protein  100 
 
 		 131 aa  272  1.0000000000000001e-72  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.997303  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3461  Cupin 2 conserved barrel domain protein  56.67 
 
 		 130 aa  149  1e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00430569 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1493  cupin:cupin region  59.66 
 
 		 155 aa  147  5e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6600  cupin 2 domain-containing protein  54.69 
 
 		 138 aa  141  4e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4674  Cupin 2 conserved barrel domain protein  56.91 
 
 		 138 aa  138  3e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2238  Cupin 2 conserved barrel domain protein  50.41 
 
 		 127 aa  132  9.999999999999999e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0230076  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3294  Cupin 2 conserved barrel domain protein  48.31 
 
 		 137 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.53927  normal  0.0737316 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3039  Cupin 2 conserved barrel domain protein  48.31 
 
 		 137 aa  111  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.571434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3615  cupin 2 domain-containing protein  45.31 
 
 		 136 aa  107  6e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0243585  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2368  cupin 2 domain-containing protein  45.38 
 
 		 137 aa  103  1e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.034272  normal  0.382558 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0832  cupin 2 domain-containing protein  44.44 
 
 		 139 aa  101  4e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0937  hypothetical protein  44.44 
 
 		 170 aa  101  4e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0396  Cupin 2 conserved barrel domain protein  41.67 
 
 		 145 aa  98.2  3e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.337758  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5069  Cupin 2 conserved barrel domain protein  43.33 
 
 		 137 aa  97.8  5e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.666012  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4554  cupin 2 domain-containing protein  42.5 
 
 		 137 aa  93.6  7e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0071761 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3966  cupin 2 domain-containing protein  41.88 
 
 		 131 aa  93.6  9e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3228  mannose-6-phosphate isomerase  41.88 
 
 		 131 aa  93.6  9e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2215  cupin 2 domain-containing protein  42.06 
 
 		 145 aa  93.2  1e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.556926  normal  0.0146751 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5014  Cupin 2 conserved barrel domain protein  40.83 
 
 		 137 aa  91.7  3e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0559417  normal  0.0695462 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0906  cupin region  31.45 
 
 		 142 aa  78.6  0.00000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.168616  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3657  cupin 2, barrel  30.47 
 
 		 142 aa  75.5  0.0000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.230089  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0153  cupin 2 domain-containing protein  40.83 
 
 		 146 aa  74.7  0.0000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.621652  normal  0.0698288 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4209  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.98 
 
 		 166 aa  65.1  0.0000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3463  cupin 2, barrel  37.21 
 
 		 172 aa  65.5  0.0000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3387  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.67 
 
 		 157 aa  64.7  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.895408  normal  0.219685 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3115  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.67 
 
 		 157 aa  64.3  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.768633  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0220  hypothetical protein  32.67 
 
 		 156 aa  63.9  0.0000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2202  hypothetical protein  34.88 
 
 		 172 aa  62  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3018  cupin 2 domain-containing protein  34.62 
 
 		 165 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.609339  normal  0.0617685 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5111  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.62 
 
 		 167 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4843  cupin 2 domain-containing protein  32.69 
 
 		 182 aa  60.8  0.000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.45501  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0303  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.18 
 
 		 147 aa  60.1  0.000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.693609  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3156  cupin 2 domain-containing protein  30.7 
 
 		 160 aa  58.9  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0792  hypothetical protein  32.98 
 
 		 170 aa  58.2  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.817049  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3473  cupin 2 domain-containing protein  30.69 
 
 		 162 aa  58.5  0.00000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.017049  normal  0.970184 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3173  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.98 
 
 		 171 aa  58.2  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00457718 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0560  cupin 2 domain-containing protein  31.76 
 
 		 161 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.172519  hitchhiker  0.000823195 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4895  cupin 2 domain-containing protein  26.36 
 
 		 167 aa  57.8  0.00000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.664893 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1354  cupin 2, barrel  34.78 
 
 		 169 aa  57.8  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.688932  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1382  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.37 
 
 		 169 aa  57.4  0.00000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.336877  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5003  cupin 2 domain-containing protein  26.36 
 
 		 168 aa  57  0.00000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.338753  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4894  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.65 
 
 		 177 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1173  cupin 2 domain-containing protein  32.65 
 
 		 180 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0388903  normal  0.0358477 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1333  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.99 
 
 		 180 aa  56.2  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.861025  normal  0.798178 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3711  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.73 
 
 		 138 aa  55.1  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0144  cupin 2 domain-containing protein  33.33 
 
 		 165 aa  50.8  0.000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0617  cupin 2 domain-containing protein  37.5 
 
 		 165 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.546436  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1709  cupin 2, barrel  36.71 
 
 		 163 aa  48.9  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.448021 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0595  cupin 2 domain-containing protein  37.5 
 
 		 165 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.906672  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3171  Cupin 2 conserved barrel domain protein  26.8 
 
 		 182 aa  49.3  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.480255  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0604  cupin 2, barrel  37.5 
 
 		 165 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.398371  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5642  cupin 2 domain-containing protein  33.98 
 
 		 156 aa  48.1  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0389  cupin 2 domain-containing protein  29.03 
 
 		 122 aa  47.4  0.00007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0602  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.52 
 
 		 118 aa  45.4  0.0002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2761  Cupin 2 conserved barrel domain protein  26.21 
 
 		 139 aa  46.2  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.668807  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3691  cupin 2, barrel  26 
 
 		 178 aa  45.8  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.224723  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0571  pectin degradation protein kdgF  34.57 
 
 		 138 aa  45.1  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0760  cupin 2 domain-containing protein  33.33 
 
 		 178 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.26011  normal  0.519438 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0949  cupin 2 domain-containing protein  25.26 
 
 		 176 aa  44.7  0.0004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1334  hypothetical protein  32.97 
 
 		 175 aa  44.3  0.0005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2496  hypothetical protein  32.97 
 
 		 175 aa  44.3  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4640  Cupin 2 conserved barrel domain protein  25.26 
 
 		 178 aa  44.7  0.0005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.650295  normal  0.123647 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4508  Cupin 2 conserved barrel domain protein  25.26 
 
 		 178 aa  44.7  0.0005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0317  hypothetical protein  32.97 
 
 		 177 aa  44.7  0.0005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.453914  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0593  hypothetical protein  32.97 
 
 		 175 aa  44.3  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.133951  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0974  hypothetical protein  32.97 
 
 		 175 aa  44.3  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1309  cupin domain-containing protein  32.97 
 
 		 175 aa  44.3  0.0005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.3623  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1236  cupin domain-containing protein  32.97 
 
 		 175 aa  44.3  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4707  cupin 2 domain-containing protein  31.52 
 
 		 175 aa  44.3  0.0006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.324848  normal  0.14883 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3660  cupin 2, barrel  31.52 
 
 		 175 aa  44.3  0.0006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.276566  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5593  cupin 2 domain-containing protein  31.52 
 
 		 175 aa  44.3  0.0006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0614455 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2453  cupin domain-containing protein  34.57 
 
 		 137 aa  43.9  0.0007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3572  cupin region  25.26 
 
 		 178 aa  43.9  0.0007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0140245  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3986  cupin 2 domain-containing protein  31.87 
 
 		 175 aa  43.9  0.0008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0531133  normal  0.0462942 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2589  pectin degradation protein KdgF  34.57 
 
 		 137 aa  43.5  0.0008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.933509  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4149  hypothetical protein  35 
 
 		 150 aa  43.5  0.0009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.26535  decreased coverage  0.0023385 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7061  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.87 
 
 		 175 aa  43.1  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.985846 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0889  hypothetical protein  34.57 
 
 		 169 aa  43.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4566  cupin 2 domain-containing protein  30.61 
 
 		 175 aa  43.5  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0464338  hitchhiker  0.000237614 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1107  hypothetical protein  31.52 
 
 		 175 aa  42.7  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.049501  normal  0.353862 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1499  hypothetical protein  31.87 
 
 		 175 aa  43.1  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0177  cupin domain-containing protein  31.87 
 
 		 175 aa  43.1  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4101  cupin 2 domain-containing protein  30.61 
 
 		 175 aa  43.5  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.170919 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4525  cupin 2 domain-containing protein  32.88 
 
 		 147 aa  43.1  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2731  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.17 
 
 		 113 aa  42.7  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.497805  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7217  hypothetical protein  26.95 
 
 		 206 aa  42.4  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.862471  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4235  cupin 2 domain-containing protein  31.52 
 
 		 179 aa  42.7  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0819  cupin 2, barrel  28.42 
 
 		 189 aa  41.6  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.105884  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0138  cupin 2 protein  26.09 
 
 		 174 aa  41.6  0.004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>