108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_4149 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_4149  hypothetical protein  100 
 
 		 150 aa  305  1.0000000000000001e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.26535  decreased coverage  0.0023385 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2392  cupin 2 domain-containing protein  63.57 
 
 		 140 aa  167  4e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.232938  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33680  Protein of unknown function (DUF861)  62.31 
 
 		 147 aa  164  2.9999999999999998e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.741976  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2852  cupin 2  64.52 
 
 		 156 aa  162  1.0000000000000001e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2501  cupin 2 domain-containing protein  58.7 
 
 		 135 aa  145  1.0000000000000001e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.342935  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2685  cupin 2 domain-containing protein  62.61 
 
 		 134 aa  143  7.0000000000000006e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.477579  hitchhiker  0.0004758 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0147  Cupin 2 conserved barrel domain protein  57.63 
 
 		 141 aa  136  1e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1085  Cupin 2 conserved barrel domain protein  54.17 
 
 		 168 aa  133  8e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3333  Cupin 2 conserved barrel domain protein  50.41 
 
 		 294 aa  114  3.9999999999999997e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0663795  normal  0.136427 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1043  cupin 2 domain-containing protein  38.54 
 
 		 181 aa  59.3  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1207  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.62 
 
 		 152 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.830198  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5028  cupin 2 domain-containing protein  38.74 
 
 		 210 aa  55.8  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4136  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.06 
 
 		 127 aa  55.1  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3638  cupin 2 domain-containing protein  32.94 
 
 		 152 aa  55.5  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.588869  normal  0.0557412 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3997  cupin 2 domain-containing protein  32.61 
 
 		 148 aa  54.7  0.0000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.439431  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1259  cupin family protein  35.29 
 
 		 418 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0758699  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2575  cupin family protein  35.29 
 
 		 418 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.97464  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0231  oxalate decarboxylase  35.29 
 
 		 418 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.842819  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0503  oxalate decarboxylase  35.29 
 
 		 418 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1413  oxalate decarboxylase  35.29 
 
 		 418 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00642683  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1331  oxalate decarboxylase  35.29 
 
 		 418 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.223306  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1067  oxalate decarboxylase  35.29 
 
 		 418 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.209096  n/a   
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4841  cupin 2 domain-containing protein  33.68 
 
 		 202 aa  52  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0193  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.09 
 
 		 126 aa  51.6  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.539282  normal  0.99492 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1426  cupin family protein  34.31 
 
 		 418 aa  50.8  0.000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6281  hypothetical protein  32.56 
 
 		 149 aa  50.4  0.000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3780  twin-arginine translocation pathway signal  34.55 
 
 		 418 aa  50.1  0.000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.150369  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4588  oxalate decarboxylase  34.55 
 
 		 418 aa  50.1  0.000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.576029  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5717  oxalate decarboxylase  34.55 
 
 		 418 aa  50.1  0.000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.619712  normal  0.130758 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0134  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.43 
 
 		 118 aa  49.3  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3988  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33 
 
 		 146 aa  49.7  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.507618  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0722  bicupin, oxalate decarboxylase family  35.23 
 
 		 234 aa  48.5  0.00003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1256  glucose-6-phosphate isomerase and related metalloenzyme  32.38 
 
 		 418 aa  48.1  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2654  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.98 
 
 		 128 aa  47.8  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.810725  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5381  Cupin 2 conserved barrel domain protein  39.66 
 
 		 132 aa  47.4  0.00007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2465  hypothetical protein  34.62 
 
 		 121 aa  47.4  0.00008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0296269  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2685  hypothetical protein  30.68 
 
 		 152 aa  47  0.00009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.273941  normal  0.254874 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4476  oxalate decarboxylase  32.61 
 
 		 418 aa  47  0.00009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.937895  normal  0.867974 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3716  cupin 2, barrel  32.53 
 
 		 129 aa  46.6  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.000701811  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4014  oxalate decarboxylase  32.61 
 
 		 418 aa  47  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.553342  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1816  cupin 2 domain-containing protein  33.33 
 
 		 123 aa  46.6  0.0001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.337557  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2329  Cupin 2 conserved barrel domain protein  39.66 
 
 		 128 aa  46.6  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.0016638  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6339  cupin 2 domain-containing protein  32.89 
 
 		 132 aa  45.8  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6039  cupin 2 domain-containing protein  32.89 
 
 		 132 aa  45.8  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.728658 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3140  conserved hypothetical phosphomannose protein  25.83 
 
 		 137 aa  46.2  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5786  cupin 2 conserved barrel domain protein  26.58 
 
 		 135 aa  45.8  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.242076  normal  0.0379764 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1424  cupin 2 domain-containing protein  33.33 
 
 		 123 aa  45.1  0.0003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.383328  hitchhiker  0.000000123197 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1444  cupin 2 domain-containing protein  37.14 
 
 		 132 aa  44.7  0.0004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4578  cupin 2 domain-containing protein  35.29 
 
 		 133 aa  44.7  0.0004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.753369 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0320  cupin 2 domain-containing protein  28.17 
 
 		 146 aa  44.7  0.0004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.864661  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1525  oxalate decarboxylase  32.61 
 
 		 408 aa  45.1  0.0004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0264195 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0402  bicupin, oxalate decarboxylase family  32.61 
 
 		 404 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.861289  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08099  oxalate decarboxylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G14610)  28.21 
 
 		 477 aa  44.3  0.0006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.361819  normal  0.0552946 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0371  bicupin, oxalate decarboxylase family  30.43 
 
 		 404 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.571775  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1911  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35 
 
 		 131 aa  43.5  0.0009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.997303  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3858  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.12 
 
 		 133 aa  43.5  0.0009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1456  xenobiotic response element family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 188 aa  43.5  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.01823e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3023  cupin 2, barrel  44.23 
 
 		 113 aa  43.5  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4126  cupin 2 domain-containing protein  33.33 
 
 		 119 aa  43.5  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5798  cupin 2 domain-containing protein  31.82 
 
 		 150 aa  43.1  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0985  oxalate decarboxylase  29.7 
 
 		 405 aa  43.1  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18490  mannose-6-phosphate isomerase  33.33 
 
 		 127 aa  43.1  0.001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.151918  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0181  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.71 
 
 		 184 aa  42.7  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3543  cupin 2 domain-containing protein  33.33 
 
 		 121 aa  42.7  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.76307  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1397  cupin 2 domain-containing protein  30.3 
 
 		 115 aa  42.7  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0319163  normal  0.27943 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4399  polyketide synthesis domain protein  33.33 
 
 		 116 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4402  polyketide synthesis domain-containing protein  33.33 
 
 		 116 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.155389  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4287  polyketide synthesis domain protein  33.33 
 
 		 116 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.640485  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0381  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35 
 
 		 103 aa  42.4  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.754668  normal  0.233584 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0773  cupin 2 protein  33.33 
 
 		 116 aa  42  0.003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.707426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4006  cupin 2 domain-containing protein  41.18 
 
 		 137 aa  41.6  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.244405  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4317  polyketide synthesis domain protein  33.33 
 
 		 116 aa  42  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4469  polyketide synthesis domain-containing protein  33.33 
 
 		 116 aa  42  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2037  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.43 
 
 		 112 aa  42  0.003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0486792  normal  0.209563 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1709  cupin 2, barrel  34.43 
 
 		 163 aa  41.6  0.004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.448021 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0389  cupin 2 domain-containing protein  25.88 
 
 		 122 aa  41.6  0.004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5791  Cupin 2 conserved barrel domain protein  40.38 
 
 		 150 aa  41.2  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0842  transcriptional regulator, AraC family  28.05 
 
 		 318 aa  41.6  0.004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.404534  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3018  cupin domain-containing protein  28.4 
 
 		 120 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.117139  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2250  DNA-binding protein  33.87 
 
 		 186 aa  41.2  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2770  cupin domain-containing protein  28.4 
 
 		 120 aa  41.2  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2719  hypothetical protein  28.4 
 
 		 120 aa  41.2  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2170  MerR family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 186 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.22299  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2444  hypothetical protein  37.29 
 
 		 141 aa  41.2  0.005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.406383  normal  0.979022 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2414  DNA-binding protein  33.87 
 
 		 186 aa  41.2  0.005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2981  cupin domain-containing protein  28.4 
 
 		 120 aa  41.2  0.005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2775  cupin 2 domain-containing protein  28.4 
 
 		 120 aa  41.2  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.108544  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2982  polyketide synthesis domain protein  28.4 
 
 		 120 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2260  polyketide synthesis domain protein  28.4 
 
 		 120 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0666056 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2951  DNA-binding protein  33.87 
 
 		 186 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000726653  hitchhiker  0.00000000446905 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2432  DNA-binding protein  33.87 
 
 		 186 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.164998 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2978  polyketide synthesis domain protein  28.4 
 
 		 120 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000628046 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3867  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.25 
 
 		 145 aa  41.2  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.468547  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2209  MerR family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 85 aa  40.8  0.006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000991087  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3531  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.35 
 
 		 125 aa  40.8  0.006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0222774 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2380  DNA-binding protein  32.26 
 
 		 186 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.801132  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2699  hypothetical protein  28.4 
 
 		 120 aa  40.8  0.007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.615203  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3737  cupin 2 domain-containing protein  40.82 
 
 		 135 aa  40.8  0.007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.107824  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4683  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.35 
 
 		 124 aa  40.8  0.007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  9.43245e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3205  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.35 
 
 		 125 aa  40.8  0.007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>