50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_0138 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007963  Csal_0138  cupin 2 protein  100 
 
 		 174 aa  367  1e-101  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3961  cupin 2 domain-containing protein  74.39 
 
 		 174 aa  273  8e-73  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0819  cupin 2, barrel  69.7 
 
 		 189 aa  249  1e-65  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.105884  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4640  Cupin 2 conserved barrel domain protein  68.26 
 
 		 178 aa  248  2e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.650295  normal  0.123647 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4508  Cupin 2 conserved barrel domain protein  68.26 
 
 		 178 aa  248  2e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3572  cupin region  65.06 
 
 		 178 aa  244  4.9999999999999997e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0140245  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0949  cupin 2 domain-containing protein  66.87 
 
 		 176 aa  242  1.9999999999999999e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3691  cupin 2, barrel  66.27 
 
 		 178 aa  239  1e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.224723  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4566  cupin 2 domain-containing protein  63.25 
 
 		 175 aa  236  2e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0464338  hitchhiker  0.000237614 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1107  hypothetical protein  63.25 
 
 		 175 aa  235  3e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.049501  normal  0.353862 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4101  cupin 2 domain-containing protein  62.65 
 
 		 175 aa  234  4e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.170919 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3986  cupin 2 domain-containing protein  62.05 
 
 		 175 aa  233  1.0000000000000001e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0531133  normal  0.0462942 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0317  hypothetical protein  63.25 
 
 		 177 aa  233  1.0000000000000001e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.453914  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0974  hypothetical protein  63.25 
 
 		 175 aa  232  2.0000000000000002e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4235  cupin 2 domain-containing protein  62.65 
 
 		 179 aa  232  2.0000000000000002e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3171  Cupin 2 conserved barrel domain protein  60.48 
 
 		 182 aa  232  2.0000000000000002e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.480255  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1334  hypothetical protein  63.25 
 
 		 175 aa  232  2.0000000000000002e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1236  cupin domain-containing protein  63.25 
 
 		 175 aa  232  2.0000000000000002e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1309  cupin domain-containing protein  63.25 
 
 		 175 aa  232  2.0000000000000002e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.3623  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0593  hypothetical protein  63.25 
 
 		 175 aa  232  2.0000000000000002e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.133951  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1499  hypothetical protein  62.65 
 
 		 175 aa  232  2.0000000000000002e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2496  hypothetical protein  63.25 
 
 		 175 aa  232  2.0000000000000002e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5593  cupin 2 domain-containing protein  62.05 
 
 		 175 aa  231  5e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0614455 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4707  cupin 2 domain-containing protein  62.05 
 
 		 175 aa  231  5e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.324848  normal  0.14883 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3660  cupin 2, barrel  62.05 
 
 		 175 aa  231  5e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.276566  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7061  Cupin 2 conserved barrel domain protein  61.45 
 
 		 175 aa  230  7.000000000000001e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.985846 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0177  cupin domain-containing protein  61.45 
 
 		 175 aa  229  2e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4109  Cupin 2 conserved barrel domain protein  40.85 
 
 		 172 aa  127  7.000000000000001e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3109  cupin region  38.22 
 
 		 175 aa  99  3e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.348066 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4294  cupin 2 domain-containing protein  31.34 
 
 		 323 aa  62.4  0.000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.689611 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1112  cupin 2 protein  31.01 
 
 		 340 aa  62  0.000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.792724  normal  0.152663 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1620  cupin 2 domain-containing protein  37.07 
 
 		 176 aa  61.2  0.000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.834926  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4085  cupin 2 protein  35.44 
 
 		 324 aa  57.8  0.00000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.362082 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2945  cupin 2 protein  32.59 
 
 		 177 aa  56.6  0.0000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0664771  decreased coverage  0.00000748463 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2810  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.86 
 
 		 191 aa  55.1  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.597474  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2141  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.24 
 
 		 159 aa  47  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5793  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.8 
 
 		 141 aa  47  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0814644 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0760  cupin 2 domain-containing protein  38.89 
 
 		 178 aa  44.3  0.0008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.26011  normal  0.519438 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3115  Cupin 2 conserved barrel domain protein  25.66 
 
 		 157 aa  43.9  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.768633  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3387  Cupin 2 conserved barrel domain protein  25 
 
 		 157 aa  43.9  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.895408  normal  0.219685 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0604  cupin 2, barrel  31.18 
 
 		 165 aa  43.9  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.398371  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5660  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.65 
 
 		 170 aa  43.9  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.215719 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1589  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.77 
 
 		 132 aa  43.9  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.908983 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0617  cupin 2 domain-containing protein  31.18 
 
 		 165 aa  43.9  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.546436  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02552  hypothetical protein  32.1 
 
 		 334 aa  42.4  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0595  cupin 2 domain-containing protein  30.11 
 
 		 165 aa  42.7  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.906672  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2781  cupin 2, barrel  31.96 
 
 		 338 aa  42  0.004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.402218  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3139  cupin domain protein  29.29 
 
 		 376 aa  41.6  0.006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.557804  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1911  Cupin 2 conserved barrel domain protein  26.09 
 
 		 131 aa  41.6  0.006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.997303  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5299  hypothetical protein  29.09 
 
 		 166 aa  40.8  0.009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148055  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>