80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_0604 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008705  Mkms_0617  cupin 2 domain-containing protein  100 
 
 		 165 aa  334  2.9999999999999997e-91  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.546436  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0604  cupin 2, barrel  100 
 
 		 165 aa  334  2.9999999999999997e-91  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.398371  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0595  cupin 2 domain-containing protein  99.39 
 
 		 165 aa  333  7.999999999999999e-91  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.906672  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0760  cupin 2 domain-containing protein  83.64 
 
 		 178 aa  280  6.000000000000001e-75  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.26011  normal  0.519438 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0144  cupin 2 domain-containing protein  78.79 
 
 		 165 aa  261  4e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2141  Cupin 2 conserved barrel domain protein  47.47 
 
 		 159 aa  146  2.0000000000000003e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5299  hypothetical protein  46.54 
 
 		 166 aa  144  4.0000000000000006e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148055  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5660  Cupin 2 conserved barrel domain protein  45.24 
 
 		 170 aa  117  9.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.215719 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3405  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.57 
 
 		 156 aa  92.4  2e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0633  cupin 2 domain-containing protein  39.55 
 
 		 158 aa  78.2  0.00000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.643791  normal  0.229137 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4108  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.78 
 
 		 165 aa  69.7  0.00000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0747  cupin-like protein  34.75 
 
 		 169 aa  65.1  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.179804  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1181  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.46 
 
 		 192 aa  64.3  0.0000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.229288 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3189  cupin 2, barrel  36.08 
 
 		 190 aa  63.2  0.000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00000805068  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3153  cupin 2 domain-containing protein  31.25 
 
 		 135 aa  62.4  0.000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0483  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.44 
 
 		 172 aa  60.5  0.000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.319109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6233  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.68 
 
 		 163 aa  60.5  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.398434  normal  0.379299 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1228  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.62 
 
 		 135 aa  59.3  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.066401  normal  0.685252 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5545  cupin 2 domain-containing protein  30.28 
 
 		 141 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1864  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.16 
 
 		 144 aa  59.3  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1709  cupin 2, barrel  29.23 
 
 		 163 aa  57.8  0.00000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.448021 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2878  Cupin 2 conserved barrel domain-containing protein  29.06 
 
 		 161 aa  57.4  0.00000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.505096  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2309  hypothetical protein  32.65 
 
 		 139 aa  57.4  0.00000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.5332  hitchhiker  0.00622303 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5435  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.73 
 
 		 149 aa  57  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.657648 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3191  cupin 2, barrel  33.88 
 
 		 179 aa  53.9  0.0000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000053457  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3867  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.41 
 
 		 145 aa  53.9  0.0000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.468547  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3501  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.67 
 
 		 184 aa  53.9  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3858  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.87 
 
 		 133 aa  52.4  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2964  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.97 
 
 		 160 aa  53.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.75352  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2969  cupin 2  31.62 
 
 		 171 aa  52.8  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3902  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.54 
 
 		 166 aa  52  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.760355  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0223  cupin 2 domain-containing protein  34.07 
 
 		 114 aa  50.8  0.000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4406  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28 
 
 		 169 aa  50.1  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0295153  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3706  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.41 
 
 		 163 aa  50.1  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2790  cupin 2 domain-containing protein  35.29 
 
 		 153 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0565  hypothetical protein  36 
 
 		 155 aa  48.9  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.916683  normal  0.52627 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1911  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.5 
 
 		 131 aa  48.9  0.00003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.997303  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1878  Cupin 2 conserved barrel domain-containing protein  27.56 
 
 		 158 aa  48.5  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.0087666  normal  0.0137906 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1714  cupin 2 domain-containing protein  28.57 
 
 		 150 aa  48.5  0.00004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.259313 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4521  hypothetical protein  34.33 
 
 		 129 aa  48.1  0.00005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_11002  dioxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G07350)  34.72 
 
 		 355 aa  48.1  0.00005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.627949  normal  0.657367 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2609  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29 
 
 		 160 aa  48.1  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.629  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0884  cupin 2, barrel  32.47 
 
 		 191 aa  48.1  0.00005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0177  cupin 2 domain-containing protein  26.5 
 
 		 148 aa  47.8  0.00007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.178476 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3707  cupin 2, barrel  28.23 
 
 		 138 aa  47.4  0.00008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.52835  normal  0.602346 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4525  cupin 2 domain-containing protein  39.51 
 
 		 147 aa  47.4  0.00009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0464  mannose-6-phosphate isomerase type II  33 
 
 		 128 aa  46.2  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3791  Cupin 2 conserved barrel domain protein  26.26 
 
 		 159 aa  46.2  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.302037  normal  0.0222415 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3674  cupin 2 domain-containing protein  35.21 
 
 		 131 aa  46.6  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.206207  normal  0.126063 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0105  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.57 
 
 		 204 aa  45.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1444  cupin 2 domain-containing protein  32.5 
 
 		 132 aa  45.4  0.0004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3556  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.37 
 
 		 169 aa  45.1  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2810  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.43 
 
 		 191 aa  44.7  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.597474  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0102  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.57 
 
 		 204 aa  44.7  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.66506 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0109  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.33 
 
 		 377 aa  44.7  0.0006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.146013 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4456  hypothetical protein  31.34 
 
 		 129 aa  44.3  0.0008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0285903  normal  0.0443513 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2600  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.59 
 
 		 133 aa  44.3  0.0008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.556264 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00702  mannose-1-phosphate guanylyltransferase  32.53 
 
 		 469 aa  44.3  0.0008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2409  cupin family protein  31.82 
 
 		 114 aa  43.1  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116838  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0138  cupin 2 protein  39.71 
 
 		 174 aa  43.9  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0193  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.95 
 
 		 126 aa  43.5  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.539282  normal  0.99492 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0950  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.76 
 
 		 389 aa  43.9  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5804  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.66 
 
 		 123 aa  43.9  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3608  cupin 2 domain-containing protein  31.25 
 
 		 159 aa  43.5  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.13649  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1315  mannose-1-phosphate guanylyltransferase/mannose-6-phosphate isomerase  36.11 
 
 		 467 aa  43.5  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0104  cupin  32 
 
 		 122 aa  42.7  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.300673  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4715  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.36 
 
 		 127 aa  43.1  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3034  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.89 
 
 		 244 aa  42  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3440  cupin 2 domain-containing protein  30.63 
 
 		 167 aa  42  0.004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3961  cupin 2 domain-containing protein  29.89 
 
 		 174 aa  41.6  0.005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1030  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.18 
 
 		 172 aa  41.6  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3109  cupin region  31.82 
 
 		 175 aa  41.6  0.005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.348066 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1579  TonB box-like  33 
 
 		 151 aa  41.2  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0694121  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2699  hypothetical protein  33.73 
 
 		 120 aa  41.2  0.006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.615203  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2295  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.14 
 
 		 166 aa  40.8  0.007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0652  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.14 
 
 		 112 aa  41.2  0.007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1405  mannose-6-phosphate isomerase type II  35.9 
 
 		 135 aa  40.8  0.008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1072  hypothetical protein  30 
 
 		 279 aa  40.8  0.009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.278788  normal  0.0185429 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0971  cupin domain-containing protein  34.18 
 
 		 171 aa  40.4  0.01  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.341283  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6281  hypothetical protein  30.26 
 
 		 149 aa  40.4  0.01  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>